NUB1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a8/Protein_NUB1_PDB_1wju.png/250px-Protein_NUB1_PDB_1wju.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NUB1, BS4, NUB1L, NYREN18, negative regulator of ubiquitin-like proteins 1, negative regulator of ubiquitin like proteins 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607981 MGI: 1889001 HomoloGene: 41108 GeneCards: NUB1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерце |
---|
Біологічний процес | • response to tumor necrosis factor • response to interferon-gamma • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • посттрансляційна модифікація |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c1/PBB_GE_NUB1_gnf1h00209_at_fs.png/250px-PBB_GE_NUB1_gnf1h00209_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001243351 NM_016118 NM_001363529 NM_001385353 NM_001385354
| NM_001385355 NM_001385356 NM_001385361 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001230280 NP_057202 NP_001350458 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 151.34 – 151.38 Mb | Хр. 5: 24.89 – 24.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NUB1 (англ. Negative regulator of ubiquitin like proteins 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 615 амінокислот, а молекулярна маса — 70 538[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQKKYLQAK | | LTQFLREDRI | | QLWKPPYTDE | | NKKVGLALKD | | LAKQYSDRLE |
CCENEVEKVI | | EEIRCKAIER | | GTGNDNYRTT | | GIATIEVFLP | | PRLKKDRKNL |
LETRLHITGR | | ELRSKIAETF | | GLQENYIKIV | | INKKQLQLGK | | TLEEQGVAHN |
VKAMVLELKQ | | SEEDARKNFQ | | LEEEEQNEAK | | LKEKQIQRTK | | RGLEILAKRA |
AETVVDPEMT | | PYLDIANQTG | | RSIRIPPSER | | KALMLAMGYH | | EKGRAFLKRK |
EYGIALPCLL | | DADKYFCECC | | RELLDTVDNY | | AVLQLDIVWC | | YFRLEQLECL |
DDAEKKLNLA | | QKCFKNCYGE | | NHQRLVHIKG | | NCGKEKVLFL | | RLYLLQGIRN |
YHSGNDVEAY | | EYLNKARQLF | | KELYIDPSKV | | DNLLQLGFTA | | QEARLGLRAC |
DGNVDHAATH | | ITNRREELAQ | | IRKEEKEKKR | | RRLENIRFLK | | GMGYSTHAAQ |
QVLHAASGNL | | DEALKILLSN | | PQMWWLNDSN | | PETDNRQESP | | SQENIDRLVY |
MGFDALVAEA | | ALRVFRGNVQ | | LAAQTLAHNG | | GSLPPELPLS | | PEDSLSPPAT |
SPSDSAGTSS | | ASTDEDMETE | | AVNEILEDIP | | EHEEDYLDST | | LEDEEIIIAE |
YLSYVENRKS | | ATKKN |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Kito K., Yeh E.T.H., Kamitani T. (2001). NUB1, a NEDD8-interacting protein, is induced by interferon and down-regulates the NEDD8 expression. J. Biol. Chem. 276: 20603—20609. PMID 11259415 DOI:10.1074/jbc.M100920200
- Tanaka T., Kawashima H., Yeh E.T.H., Kamitani T. (2003). Regulation of the NEDD8 conjugation system by a splicing variant, NUB1L. J. Biol. Chem. 278: 32905—32913. PMID 12816948 DOI:10.1074/jbc.M212057200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kamitani T., Kito K., Fukuda-Kamitani T., Yeh E.T.H. (2001). Targeting of NEDD8 and its conjugates for proteasomal degradation by NUB1. J. Biol. Chem. 276: 46655—46660. PMID 11585840 DOI:10.1074/jbc.M108636200
- Hipp M.S., Raasi S., Groettrup M., Schmidtke G. (2004). NEDD8 ultimate buster-1L interacts with the ubiquitin-like protein FAT10 and accelerates its degradation. J. Biol. Chem. 279: 16503—16510. PMID 14757770 DOI:10.1074/jbc.M310114200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17623 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5A7 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |