NUP107

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3CQC, 3CQG, 3I4R, 5A9Q

Ідентифікатори

Символи

NUP107, NUP84, NPHS11, nucleoporin 107kDa, nucleoporin 107, ODG6, ODG6; GAMOS7

Зовнішні ІД

OMIM: 607617 MGI: 2143854 HomoloGene: 5555 GeneCards: NUP107

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • центросома • ядерна мембрана • nuclear periphery • мембрана • nuclear envelope • ядерна пора • нуклеоплазма • хромосома • nuclear pore outer ring • центромера • клітинне ядро • кінетохор • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • nuclear pore complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein import into nucleus • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • regulation of cellular response to heat • protein transport • posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • GO:0022415 viral process • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • female gonad development • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57122


103468

Ensembl


ENSG00000111581


ENSMUSG00000052798

UniProt


P57740


Q8BH74

RefSeq (мРНК)


NM_020401 NM_001330192


NM_134010

RefSeq (білок)


NP_001317121 NP_065134


NP_598771

Локус (UCSC)

Хр. 12: 68.69 – 68.75 Mb

Хр. 10: 117.59 – 117.63 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP107 (англ. Nucleoporin 107) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот, а молекулярна маса — 106 374^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDRSGFGEIS	SPVIREAEVT	RTARKQSAQK	RVLLQASQDE	NFGNTTPRNQ
VIPRTPSSFR	QPFTPTSRSL	LRQPDISCIL	GTGGKSPRLT	QSSGFFGNLS
MVTNLDDSNW	AAAFSSQRSG	LFTNTEPHSI	TEDVTISAVM	LREDDPGEAA
SMSMFSDFLQ	SFLKHSSSTV	FDLVEEYENI	CGSQVNILSK	IVSRATPGLQ
KFSKTASMLW	LLQQEMVTWR	LLASLYRDRI	QSALEEESVF	AVTAVNASEK
TVVEALFQRD	SLVRQSQLVV	DWLESIAKDE	IGEFSDNIEF	YAKSVYWENT
LHTLKQRQLT	SYVGSVRPLV	TELDPDAPIR	QKMPLDDLDR	EDEVRLLKYL
FTLIRAGMTE	EAQRLCKRCG	QAWRAATLEG	WKLYHDPNVN	GGTELEPVEG
NPYRRIWKIS	CWRMAEDELF	NRYERAIYAA	LSGNLKQLLP	VCDTWEDTVW
AYFRVMVDSL	VEQEIQTSVA	TLDETEELPR	EYLGANWTLE	KVFEELQATD
KKRVLEENQE	HYHIVQKFLI	LGDIDGLMDE	FSKWLSKSRN	NLPGHLLRFM
THLILFFRTL	GLQTKEEVSI	EVLKTYIQLL	IREKHTNLIA	FYTCHLPQDL
AVAQYALFLE	SVTEFEQRHH	CLELAKEADL	DVATITKTVV	ENIRKKDNGE
FSHHDLAPAL	DTGTTEEDRL	KIDVIDWLVF	DPAQRAEALK	QGNAIMRKFL
ASKKHEAAKE	VFVKIPQDSI	AEIYNQCEEQ	GMESPLPAED	DNAIREHLCI
RAYLEAHETF	NEWFKHMNSV	PQKPALIPQP	TFTEKVAHEH	KEKKYEMDFG
IWKGHLDALT	ADVKEKMYNV	LLFVDGGWMV	DVREDAKEDH	ERTHQMVLLR
KLCLPMLCFL	LHTILHSTGQ	YQECLQLADM	VSSERHKLYL	VFSKEELRKL
LQKLRESSLM	LLDQGLDPLG	YEIQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
Boehmer T., Enninga J., Dales S., Blobel G., Zhong H. (2003). Depletion of a single nucleoporin, Nup107, prevents the assembly of a subset of nucleoporins into the nuclear pore complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 981—985. PMID 12552102 DOI:10.1073/pnas.252749899
Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29914 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P57740 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.