NUP107 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7a/Protein_NUP107_PDB_3CQC.png/250px-Protein_NUP107_PDB_3CQC.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3CQC, 3CQG, 3I4R, 5A9Q | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NUP107, NUP84, NPHS11, nucleoporin 107kDa, nucleoporin 107, ODG6, ODG6; GAMOS7 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607617 MGI: 2143854 HomoloGene: 5555 GeneCards: NUP107 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • центросома • ядерна мембрана • nuclear periphery • мембрана • nuclear envelope • ядерна пора • нуклеоплазма • хромосома • nuclear pore outer ring • центромера • клітинне ядро • кінетохор • host cell |
---|
Біологічний процес | • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein import into nucleus • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • regulation of cellular response to heat • protein transport • posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • GO:0022415 viral process • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • female gonad development • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f2/PBB_GE_NUP107_218768_at_fs.png/250px-PBB_GE_NUP107_218768_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 68.69 – 68.75 Mb | Хр. 10: 117.59 – 117.63 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NUP107 (англ. Nucleoporin 107) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот, а молекулярна маса — 106 374[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDRSGFGEIS | | SPVIREAEVT | | RTARKQSAQK | | RVLLQASQDE | | NFGNTTPRNQ |
VIPRTPSSFR | | QPFTPTSRSL | | LRQPDISCIL | | GTGGKSPRLT | | QSSGFFGNLS |
MVTNLDDSNW | | AAAFSSQRSG | | LFTNTEPHSI | | TEDVTISAVM | | LREDDPGEAA |
SMSMFSDFLQ | | SFLKHSSSTV | | FDLVEEYENI | | CGSQVNILSK | | IVSRATPGLQ |
KFSKTASMLW | | LLQQEMVTWR | | LLASLYRDRI | | QSALEEESVF | | AVTAVNASEK |
TVVEALFQRD | | SLVRQSQLVV | | DWLESIAKDE | | IGEFSDNIEF | | YAKSVYWENT |
LHTLKQRQLT | | SYVGSVRPLV | | TELDPDAPIR | | QKMPLDDLDR | | EDEVRLLKYL |
FTLIRAGMTE | | EAQRLCKRCG | | QAWRAATLEG | | WKLYHDPNVN | | GGTELEPVEG |
NPYRRIWKIS | | CWRMAEDELF | | NRYERAIYAA | | LSGNLKQLLP | | VCDTWEDTVW |
AYFRVMVDSL | | VEQEIQTSVA | | TLDETEELPR | | EYLGANWTLE | | KVFEELQATD |
KKRVLEENQE | | HYHIVQKFLI | | LGDIDGLMDE | | FSKWLSKSRN | | NLPGHLLRFM |
THLILFFRTL | | GLQTKEEVSI | | EVLKTYIQLL | | IREKHTNLIA | | FYTCHLPQDL |
AVAQYALFLE | | SVTEFEQRHH | | CLELAKEADL | | DVATITKTVV | | ENIRKKDNGE |
FSHHDLAPAL | | DTGTTEEDRL | | KIDVIDWLVF | | DPAQRAEALK | | QGNAIMRKFL |
ASKKHEAAKE | | VFVKIPQDSI | | AEIYNQCEEQ | | GMESPLPAED | | DNAIREHLCI |
RAYLEAHETF | | NEWFKHMNSV | | PQKPALIPQP | | TFTEKVAHEH | | KEKKYEMDFG |
IWKGHLDALT | | ADVKEKMYNV | | LLFVDGGWMV | | DVREDAKEDH | | ERTHQMVLLR |
KLCLPMLCFL | | LHTILHSTGQ | | YQECLQLADM | | VSSERHKLYL | | VFSKEELRKL |
LQKLRESSLM | | LLDQGLDPLG | | YEIQL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
- Boehmer T., Enninga J., Dales S., Blobel G., Zhong H. (2003). Depletion of a single nucleoporin, Nup107, prevents the assembly of a subset of nucleoporins into the nuclear pore complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 981—985. PMID 12552102 DOI:10.1073/pnas.252749899
- Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29914 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P57740 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |