NUP35

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4LIR

Ідентифікатори

Символи

NUP35, MP-44, MP44, NP44, NUP53, nucleoporin 35kDa, nucleoporin 35

Зовнішні ІД

OMIM: 608140 MGI: 1916732 HomoloGene: 44517 GeneCards: NUP35

Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • nucleic acid binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• Ядерна пластинка • ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинна мембрана • ядерна пора • нуклеоплазма • nuclear pore central transport channel • nuclear pore nuclear basket • клітинне ядро • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein transport • GO:0022415 viral process • nuclear pore organization • NLS-bearing protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • nucleocytoplasmic transport • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


129401


69482

Ensembl


ENSG00000163002


ENSMUSG00000026999

UniProt


Q8NFH5


Q8R4R6

RefSeq (мРНК)


NM_001008544 NM_001287584 NM_001287585 NM_138285


NM_001190179 NM_027091

RefSeq (білок)


NP_001274513 NP_001274514 NP_612142


NP_001177108 NP_081367

Локус (UCSC)

Хр. 2: 183.12 – 183.16 Mb

Хр. 2: 80.45 – 80.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP35 (англ. Nucleoporin 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 34 774^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAFAVEPQG	PALGSEPMML	GSPTSPKPGV	NAQFLPGFLM	GDLPAPVTPQ
PRSISGPSVG	VMEMRSPLLA	GGSPPQPVVP	AHKDKSGAPP	VRSIYDDISS
PGLGSTPLTS	RRQPNISVMQ	SPLVGVTSTP	GTGQSMFSPA	SIGQPRKTTL
SPAQLDPFYT	QGDSLTSEDH	LDDSWVTVFG	FPQASASYIL	LQFAQYGNIL
KHVMSNTGNW	MHIRYQSKLQ	ARKALSKDGR	IFGESIMIGV	KPCIDKSVME
SSDRCALSSP	SLAFTPPIKT	LGTPTQPGST	PRISTMRPLA	TAYKASTSDY
QVISDRQTPK	KDESLVSKAM	EYMFGW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hawryluk-Gara L.A., Shibuya E.K., Wozniak R.W. (2005). Vertebrate Nup53 interacts with the nuclear lamina and is required for the assembly of a Nup93-containing complex. Mol. Biol. Cell. 16: 2382—2394. PMID 15703211 DOI:10.1091/mbc.E04-10-0857

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29797 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8NFH5 (англ.) . Архів оригіналу за 20 лютого 2017. Процитовано 29 серпня 2017.