NUP85 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NUP85, Nup75, FROUNT, nucleoporin 85, NPHS17 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 170285 MGI: 3046173 HomoloGene: 11755 GeneCards: NUP85 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ядерна мембрана • мембрана • nuclear envelope • веретено поділу • ядерна пора • хромосома • nuclear pore outer ring • центромера • цитоскелет • кінетохор • клітинне ядро • гіалоплазма • host cell |
---|
Біологічний процес | • mRNA transport • protein import into nucleus • viral transcription • protein sumoylation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • хемотаксис • mitotic nuclear membrane disassembly • macrophage chemotaxis • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • lamellipodium assembly • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development • nucleocytoplasmic transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/12/PBB_GE_NUP85_218014_at_fs.png/250px-PBB_GE_NUP85_218014_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001303276 NM_024844 NM_001330472 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001290205 NP_001317401 NP_079120 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 75.21 – 75.24 Mb | Хр. 11: 115.46 – 115.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NUP85 (англ. Nucleoporin 85) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 656 амінокислот, а молекулярна маса — 75 019[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEELDGEPTV | | TLIPGVNSKK | | NQMYFDWGPG | | EMLVCETSFN | | KKEKSEMVPS |
CPFIYIIRKD | | VDVYSQILRK | | LFNESHGIFL | | GLQRIDEELT | | GKSRKSQLVR |
VSKNYRSVIR | | ACMEEMHQVA | | IAAKDPANGR | | QFSSQVSILS | | AMELIWNLCE |
ILFIEVAPAG | | PLLLHLLDWV | | RLHVCEVDSL | | SADVLGSENP | | SKHDSFWNLV |
TILVLQGRLD | | EARQMLSKEA | | DASPASAGIC | | RIMGDLMRTM | | PILSPGNTQT |
LTELELKWQH | | WHEECERYLQ | | DSTFATSPHL | | ESLLKIMLGD | | EAALLEQKEL |
LSNWYHFLVT | | RLLYSNPTVK | | PIDLHYYAQS | | SLDLFLGGES | | SPEPLDNILL |
AAFEFDIHQV | | IKECSIALSN | | WWFVAHLTDL | | LDHCKLLQSH | | NLYFGSNMRE |
FLLLEYASGL | | FAHPSLWQLG | | VDYFDYCPEL | | GRVSLELHIE | | RIPLNTEQKA |
LKVLRICEQR | | QMTEQVRSIC | | KILAMKAVRN | | NRLGSALSWS | | IRAKDAAFAT |
LVSDRFLRDY | | CERGCFSDLD | | LIDNLGPAMM | | LSDRLTFLGK | | YREFHRMYGE |
KRFADAASLL | | LSLMTSRIAP | | RSFWMTLLTD | | ALPLLEQKQV | | IFSAEQTYEL |
MRCLEDLTSR | | RPVHGESDTE | | QLQDDDIETT | | KVEMLRLSLA | | RNLARAIIRE |
GSLEGS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.
Література
- Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8734 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BW27 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |