NUP85

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5A9Q

Ідентифікатори

Символи

NUP85, Nup75, FROUNT, nucleoporin 85, NPHS17

Зовнішні ІД

OMIM: 170285 MGI: 3046173 HomoloGene: 11755 GeneCards: NUP85

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерна мембрана • мембрана • nuclear envelope • веретено поділу • ядерна пора • хромосома • nuclear pore outer ring • центромера • цитоскелет • кінетохор • клітинне ядро • гіалоплазма • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • protein import into nucleus • viral transcription • protein sumoylation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • хемотаксис • mitotic nuclear membrane disassembly • macrophage chemotaxis • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • lamellipodium assembly • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development • nucleocytoplasmic transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79902


445007

Ensembl


ENSG00000125450


ENSMUSG00000020739

UniProt


Q9BW27


Q8R480

RefSeq (мРНК)


NM_001303276 NM_024844 NM_001330472


NM_001002929

RefSeq (білок)


NP_001290205 NP_001317401 NP_079120


NP_001002929

Локус (UCSC)

Хр. 17: 75.21 – 75.24 Mb

Хр. 11: 115.46 – 115.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP85 (англ. Nucleoporin 85) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 656 амінокислот, а молекулярна маса — 75 019^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELDGEPTV	TLIPGVNSKK	NQMYFDWGPG	EMLVCETSFN	KKEKSEMVPS
CPFIYIIRKD	VDVYSQILRK	LFNESHGIFL	GLQRIDEELT	GKSRKSQLVR
VSKNYRSVIR	ACMEEMHQVA	IAAKDPANGR	QFSSQVSILS	AMELIWNLCE
ILFIEVAPAG	PLLLHLLDWV	RLHVCEVDSL	SADVLGSENP	SKHDSFWNLV
TILVLQGRLD	EARQMLSKEA	DASPASAGIC	RIMGDLMRTM	PILSPGNTQT
LTELELKWQH	WHEECERYLQ	DSTFATSPHL	ESLLKIMLGD	EAALLEQKEL
LSNWYHFLVT	RLLYSNPTVK	PIDLHYYAQS	SLDLFLGGES	SPEPLDNILL
AAFEFDIHQV	IKECSIALSN	WWFVAHLTDL	LDHCKLLQSH	NLYFGSNMRE
FLLLEYASGL	FAHPSLWQLG	VDYFDYCPEL	GRVSLELHIE	RIPLNTEQKA
LKVLRICEQR	QMTEQVRSIC	KILAMKAVRN	NRLGSALSWS	IRAKDAAFAT
LVSDRFLRDY	CERGCFSDLD	LIDNLGPAMM	LSDRLTFLGK	YREFHRMYGE
KRFADAASLL	LSLMTSRIAP	RSFWMTLLTD	ALPLLEQKQV	IFSAEQTYEL
MRCLEDLTSR	RPVHGESDTE	QLQDDDIETT	KVEMLRLSLA	RNLARAIIRE
GSLEGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8734 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BW27 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.