NUPL2

Ідентифікатори

Символи

NUP42, CG1, NLP-1, NLP_1, hCG1, nucleoporin like 2, NUPL2, nucleoporin 42

Зовнішні ІД

MGI: 2387631 HomoloGene: 40573 GeneCards: NUP42

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclear export signal receptor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • ядерна пора • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • protein export from nucleus • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11097


231042

Ensembl


ENSG00000136243


ENSMUSG00000048439

UniProt


O15504


Q8CIC2

RefSeq (мРНК)


NM_007342 NM_001370443 NM_001370444 NM_001370445 NM_001370446


NM_153092 NM_001346582

RefSeq (білок)


NP_031368 NP_001357372 NP_001357373 NP_001357374 NP_001357375


NP_001333511 NP_694732

Локус (UCSC)

Хр. 7: 23.18 – 23.2 Mb

Хр. 5: 24.37 – 24.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUPL2 (англ. Nucleoporin like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 44 872^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAICQFFLQG	RCRFGDRCWN	EHPGARGAGG	GRQQPQQQPS	GNNRRGWNTT
SQRYSNVIQP	SSFSKSTPWG	GSRDQEKPYF	SSFDSGASTN	RKEGFGLSEN
PFASLSPDEQ	KDEKKLLEGI	VKDMEVWESS	GQWMFSVYSP	VKKKPNISGF
TDISPEELRL	EYHNFLTSNN	LQSYLNSVQR	LINQWRNRVN	ELKSLNISTK
VALLSDVKDG	VNQAAPAFGF	GSSQAATFMS	PGFPVNNSSS	DNAQNFSFKT
NSGFAAASSG	SPAGFGSSPA	FGAAASTSSG	ISTSAPAFGF	GKPEVTSAAS
FSFKSPAASS	FGSPGFSGLP	ASLATGPVRA	PVAPAFGGGS	SVAGFGSPGS
HSHTAFSKPS	SDTFGNSSIS	TSLSASSSII	ATDNVLFTPR	DKLTVEELEQ
FQSKKFTLGK	IPLKPPPLEL	LNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Farjot G., Sergeant A., Mikaelian I. (1999). A new nucleoporin-like protein interacts with both HIV-1 Rev nuclear export signal and CRM-1. J. Biol. Chem. 274: 17309—17317. PMID 10358091 DOI:10.1074/jbc.274.24.17309
Kendirgi F., Rexer D.J., Alcazar-Roman A.R., Onishko H.M., Wente S.R. (2005). Interaction between the shuttling mRNA export factor Gle1 and the nucleoporin hCG1: a conserved mechanism in the export of Hsp70 mRNA. Mol. Biol. Cell. 16: 4304—4315. PMID 16000379 DOI:10.1091/mbc.E04-11-0998

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17010 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O15504 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.