ODF2

Ідентифікатори

Символи

ODF2, CT134, ODF2/1, ODF2/2, ODF84, outer dense fiber of sperm tails 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602015 MGI: 1098824 HomoloGene: 1907 GeneCards: ODF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ciliary basal body • гіалоплазма • cell projection • spindle pole • outer dense fiber • ciliary transition fiber • центр організації мікротрубочок • Центріоль • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • центросома • війка • motile cilium • sperm flagellum • centriolar subdistal appendage
Біологічний процес	• диференціація клітин • multicellular organism development • G2/M transition of mitotic cell cycle • Сперматогенез • spermatid development • regulation of cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0034613 protein localization • centriole-centriole cohesion • cilium organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4957


18286

Ensembl


ENSG00000136811


ENSMUSG00000026790

UniProt


Q5BJF6


A3KGV1

RefSeq (мРНК)

NM_001242352 NM_001242353 NM_001242354 NM_002540 NM_153432
NM_153433 NM_153435 NM_153436 NM_153437 NM_153439 NM_153440 NM_001351577 NM_001351578 NM_001351579 NM_001351580 NM_001351581 NM_001351582 NM_001351583 NM_001351584 NM_001351585 NM_001351586 NM_001351587 NM_001351588

NM_001113213 NM_001113214 NM_001177659 NM_001177661 NM_013615
NM_001355136 NM_001355137 NM_001355138 NM_001369060 NM_001374179 NM_001374180 NM_001374181 NM_001374182

RefSeq (білок)

NP_001229281 NP_001229282 NP_001229283 NP_002531 NP_702910
NP_702911 NP_702913 NP_702914 NP_702915 NP_702917 NP_702918 NP_001338506 NP_001338507 NP_001338508 NP_001338509 NP_001338510 NP_001338511 NP_001338512 NP_001338513 NP_001338514 NP_001338515 NP_001338516 NP_001338517

NP_001106684 NP_001106685 NP_001171130 NP_001171132 NP_038643
NP_001342065 NP_001342066 NP_001342067 NP_001355989 NP_001361108 NP_001361109 NP_001361110 NP_001361111

Локус (UCSC)

Хр. 9: 128.46 – 128.5 Mb

Хр. 2: 29.78 – 29.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ODF2 (англ. Outer dense fiber of sperm tails 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 829 амінокислот, а молекулярна маса — 95 401^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSASSSGGSP	RFPSCGKNGV	TSLTQKKVLR	APCGAPSVTV	TKSHKRGMKG
DTVNVRRSVR	VKTKVPWMPP	GKSSARPVGC	KWENPPHCLE	ITPPSSEKLV
SVMRLSDLST	EDDDSGHCKM	NRYDKKIDSL	MNAVGCLKSE	VKMQKGERQM
AKRFLEERKE	ELEEVAHELA	ETEHENTVLR	HNIERMKEEK	DFTILQKKHL
QQEKECLMSK	LVEAEMDGAA	AAKQVMALKD	TIGKLKTEKQ	MTCTDINTLT
RQKELLLQKL	STFEETNRTL	RDLLREQHCK	EDSERLMEQQ	GALLKRLAEA
DSEKARLLLL	LQDKDKEVEE	LLQEIQCEKA	QAKTASELSK	SMESMRGHLQ
AQLRSKEAEN	SRLCMQIKNL	ERSGNQHKAE	VEAIMEQLKE	LKQKGDRDKE
SLKKAIRAQK	ERAEKSEEYA	EQLHVQLADK	DLYVAEALST	LESWRSRYNQ
VVKEKGDLEL	EIIVLNDRVT	DLVNQQQTLE	EKMREDRDSL	VERLHRQTAE
YSAFKLENER	LKASFAPMED	KLNQAHLEVQ	QLKASVKNYE	GMIDNYKSQV
MKTRLEADEV	AAQLERCDKE	NKILKDEMNK	EIEAARRQFQ	SQLADLQQLP
DILKITEAKL	AECQDQLQGY	ERKNIDLTAI	ISDLRSRIEH	QGDKLEMARE
KHQASQKENK	QLSLKVDELE	RKLEATSAQN	IEFLQVIAKR	EEAIHQSQLR
LEEKTRECGT	LARQLESAIE	DARRQVEQTK	EHALSKERAA	QNKILDLETQ
LSRTKTELSQ	LRRSRDDADR	RYQSRLQDLK	DRLEQSESTN	RSMQNYVQFL
KSSYANVFGD	GPYSTFLTSS	PIRSRSPPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

Petersen C., Fuezesi L., Hoyer-Fender S. (1999). Outer dense fibre proteins from human sperm tail: molecular cloning and expression analyses of two cDNA transcripts encoding proteins of approximately 70 kDa. Mol. Hum. Reprod. 5: 627—635. PMID 10381817 DOI:10.1093/molehr/5.7.627
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8114 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5BJF6 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.