ODF2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ODF2, CT134, ODF2/1, ODF2/2, ODF84, outer dense fiber of sperm tails 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602015 MGI: 1098824 HomoloGene: 1907 GeneCards: ODF2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ciliary basal body • гіалоплазма • cell projection • spindle pole • outer dense fiber • ciliary transition fiber • центр організації мікротрубочок • Центріоль • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • центросома • війка • motile cilium • sperm flagellum • centriolar subdistal appendage |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • multicellular organism development • G2/M transition of mitotic cell cycle • Сперматогенез • spermatid development • regulation of cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0034613 protein localization • centriole-centriole cohesion • cilium organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3e/PBB_GE_ODF2_210415_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ODF2_210415_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001242352 NM_001242353 NM_001242354 NM_002540 NM_153432
| NM_153433 NM_153435 NM_153436 NM_153437 NM_153439 NM_153440 NM_001351577 NM_001351578 NM_001351579 NM_001351580 NM_001351581 NM_001351582 NM_001351583 NM_001351584 NM_001351585 NM_001351586 NM_001351587 NM_001351588 |
| NM_001113213 NM_001113214 NM_001177659 NM_001177661 NM_013615
| NM_001355136 NM_001355137 NM_001355138 NM_001369060 NM_001374179 NM_001374180 NM_001374181 NM_001374182 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001229281 NP_001229282 NP_001229283 NP_002531 NP_702910
| NP_702911 NP_702913 NP_702914 NP_702915 NP_702917 NP_702918 NP_001338506 NP_001338507 NP_001338508 NP_001338509 NP_001338510 NP_001338511 NP_001338512 NP_001338513 NP_001338514 NP_001338515 NP_001338516 NP_001338517 |
| NP_001106684 NP_001106685 NP_001171130 NP_001171132 NP_038643
| NP_001342065 NP_001342066 NP_001342067 NP_001355989 NP_001361108 NP_001361109 NP_001361110 NP_001361111 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 128.46 – 128.5 Mb | Хр. 2: 29.78 – 29.82 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ODF2 (англ. Outer dense fiber of sperm tails 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 829 амінокислот, а молекулярна маса — 95 401[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSASSSGGSP | | RFPSCGKNGV | | TSLTQKKVLR | | APCGAPSVTV | | TKSHKRGMKG |
DTVNVRRSVR | | VKTKVPWMPP | | GKSSARPVGC | | KWENPPHCLE | | ITPPSSEKLV |
SVMRLSDLST | | EDDDSGHCKM | | NRYDKKIDSL | | MNAVGCLKSE | | VKMQKGERQM |
AKRFLEERKE | | ELEEVAHELA | | ETEHENTVLR | | HNIERMKEEK | | DFTILQKKHL |
QQEKECLMSK | | LVEAEMDGAA | | AAKQVMALKD | | TIGKLKTEKQ | | MTCTDINTLT |
RQKELLLQKL | | STFEETNRTL | | RDLLREQHCK | | EDSERLMEQQ | | GALLKRLAEA |
DSEKARLLLL | | LQDKDKEVEE | | LLQEIQCEKA | | QAKTASELSK | | SMESMRGHLQ |
AQLRSKEAEN | | SRLCMQIKNL | | ERSGNQHKAE | | VEAIMEQLKE | | LKQKGDRDKE |
SLKKAIRAQK | | ERAEKSEEYA | | EQLHVQLADK | | DLYVAEALST | | LESWRSRYNQ |
VVKEKGDLEL | | EIIVLNDRVT | | DLVNQQQTLE | | EKMREDRDSL | | VERLHRQTAE |
YSAFKLENER | | LKASFAPMED | | KLNQAHLEVQ | | QLKASVKNYE | | GMIDNYKSQV |
MKTRLEADEV | | AAQLERCDKE | | NKILKDEMNK | | EIEAARRQFQ | | SQLADLQQLP |
DILKITEAKL | | AECQDQLQGY | | ERKNIDLTAI | | ISDLRSRIEH | | QGDKLEMARE |
KHQASQKENK | | QLSLKVDELE | | RKLEATSAQN | | IEFLQVIAKR | | EEAIHQSQLR |
LEEKTRECGT | | LARQLESAIE | | DARRQVEQTK | | EHALSKERAA | | QNKILDLETQ |
LSRTKTELSQ | | LRRSRDDADR | | RYQSRLQDLK | | DRLEQSESTN | | RSMQNYVQFL |
KSSYANVFGD | | GPYSTFLTSS | | PIRSRSPPA |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.
Література
- Petersen C., Fuezesi L., Hoyer-Fender S. (1999). Outer dense fibre proteins from human sperm tail: molecular cloning and expression analyses of two cDNA transcripts encoding proteins of approximately 70 kDa. Mol. Hum. Reprod. 5: 627—635. PMID 10381817 DOI:10.1093/molehr/5.7.627
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8114 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5BJF6 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |