OPTC : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

OPTC

Ідентифікатори

Символи

OPTC, OPT, opticin

Зовнішні ІД

OMIM: 605127 MGI: 2151113 HomoloGene: 8652 GeneCards: OPTC

Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	• extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця
Біологічний процес	• extracellular matrix disassembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26254


269120

Ensembl


ENSG00000188770


ENSMUSG00000010311

UniProt


Q9UBM4


Q920A0

RefSeq (мРНК)


NM_014359

NM_001160420 NM_001160421 NM_001160422 NM_054076 NM_001395557
NM_001395558

RefSeq (білок)


NP_055174

NP_001153892 NP_001153893 NP_001153894 NP_473417 NP_001382486
NP_001382487

Локус (UCSC)

Хр. 1: 203.49 – 203.51 Mb

Хр. 1: 133.82 – 133.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OPTC (англ. Opticin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 261^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLAFLSLL	ALVLQETGTA	SLPRKERKRR	EEQMPREGDS	FEVLPLRNDV
LNPDNYGEVI	DLSNYEELTD	YGDQLPEVKV	TSLAPATSIS	PAKSTTAPGT
PSSNPTMTRP	TTAGLLLSSQ	PNHGLPTCLV	CVCLGSSVYC	DDIDLEDIPP
LPRRTAYLYA	RFNRISRIRA	EDFKGLTKLK	RIDLSNNLIS	SIDNDAFRLL
HALQDLILPE	NQLEALPVLP	SGIEFLDVRL	NRLQSSGIQP	AAFRAMEKLQ
FLYLSDNLLD	SIPGPLPLSL	RSVHLQNNLI	ETMQRDVFCD	PEEHKHTRRQ
LEDIRLDGNP	INLSLFPSAY	FCLPRLPIGR	FT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Friedman J.S., Ducharme R., Raymond V., Walter M.A. (2000). Isolation of a novel iris-specific and leucine-rich repeat protein (oculoglycan) using differential selection. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 41: 2059—2066. PMID 10892843

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8158 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UBM4 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.