OPTC |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | OPTC, OPT, opticin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605127 MGI: 2151113 HomoloGene: 8652 GeneCards: OPTC |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця |
---|
Біологічний процес | • extracellular matrix disassembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a2/PBB_GE_OPTC_gnf1h00162_at_fs.png/250px-PBB_GE_OPTC_gnf1h00162_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001160420 NM_001160421 NM_001160422 NM_054076 NM_001395557
| NM_001395558 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001153892 NP_001153893 NP_001153894 NP_473417 NP_001382486
| NP_001382487 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 203.49 – 203.51 Mb | Хр. 1: 133.82 – 133.84 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
OPTC (англ. Opticin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 261[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRLLAFLSLL | | ALVLQETGTA | | SLPRKERKRR | | EEQMPREGDS | | FEVLPLRNDV |
LNPDNYGEVI | | DLSNYEELTD | | YGDQLPEVKV | | TSLAPATSIS | | PAKSTTAPGT |
PSSNPTMTRP | | TTAGLLLSSQ | | PNHGLPTCLV | | CVCLGSSVYC | | DDIDLEDIPP |
LPRRTAYLYA | | RFNRISRIRA | | EDFKGLTKLK | | RIDLSNNLIS | | SIDNDAFRLL |
HALQDLILPE | | NQLEALPVLP | | SGIEFLDVRL | | NRLQSSGIQP | | AAFRAMEKLQ |
FLYLSDNLLD | | SIPGPLPLSL | | RSVHLQNNLI | | ETMQRDVFCD | | PEEHKHTRRQ |
LEDIRLDGNP | | INLSLFPSAY | | FCLPRLPIGR | | FT |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Friedman J.S., Ducharme R., Raymond V., Walter M.A. (2000). Isolation of a novel iris-specific and leucine-rich repeat protein (oculoglycan) using differential selection. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 41: 2059—2066. PMID 10892843
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8158 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UBM4 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |