OTUD4

Ідентифікатори

Символи

OTUD4, DUBA6, HIN1, HSHIN1, OTU deubiquitinase 4

Зовнішні ІД

OMIM: 611744 MGI: 1098801 HomoloGene: 35370 GeneCards: OTUD4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • RNA binding • GO:0032947 molecular adaptor activity • Lys63-specific deubiquitinase activity
Клітинна компонента	• компонент клітини • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• protein K48-linked deubiquitination • протеоліз • процес імунної системи • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • вроджений імунітет • protein K63-linked deubiquitination • positive regulation of DNA demethylation • regulation of protein K48-linked deubiquitination • negative regulation of interleukin-1-mediated signaling pathway • protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54726


73945

Ensembl


ENSG00000164164


ENSMUSG00000036990

UniProt


Q01804


B2RRE7

RefSeq (мРНК)


NM_001102653 NM_017493 NM_199324 NM_001366057 NM_001366058


NM_001081164 NM_001256033

RefSeq (білок)


NP_001096123 NP_059963 NP_001352986 NP_001352987


NP_001074633 NP_001242962

Локус (UCSC)

Хр. 4: 145.11 – 145.18 Mb

Хр. 8: 80.37 – 80.4 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OTUD4 (англ. OTU deubiquitinase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 114 амінокислот, а молекулярна маса — 124 045^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAAVGVPDG	GDQGGAGPRE	DATPMDAYLR	KLGLYRKLVA	KDGSCLFRAV
AEQVLHSQSR	HVEVRMACIH	YLRENREKFE	AFIEGSFEEY	LKRLENPQEW
VGQVEISALS	LMYRKDFIIY	REPNVSPSQV	TENNFPEKVL	LCFSNGNHYD
IVYPIKYKES	SAMCQSLLYE	LLYEKVFKTD	VSKIVMELDT	LEVADEDNSE
ISDSEDDSCK	SKTAAAAADV	NGFKPLSGNE	QLKNNGNSTS	LPLSRKVLKS
LNPAVYRNVE	YEIWLKSKQA	QQKRDYSIAA	GLQYEVGDKC	QVRLDHNGKF
LNADVQGIHS	ENGPVLVEEL	GKKHTSKNLK	APPPESWNTV	SGKKMKKPST
SGQNFHSDVD	YRGPKNPSKP	IKAPSALPPR	LQHPSGVRQH	AFSSHSSGSQ
SQKFSSEHKN	LSRTPSQIIR	KPDRERVEDF	DHTSRESNYF	GLSPEERREK
QAIEESRLLY	EIQNRDEQAF	PALSSSSVNQ	SASQSSNPCV	QRKSSHVGDR
KGSRRRMDTE	ERKDKDSIHG	HSQLDKRPEP	STLENITDDK	YATVSSPSKS
KKLECPSPAE	QKPAEHVSLS	NPAPLLVSPE	VHLTPAVPSL	PATVPAWPSE
PTTFGPTGVP	APIPVLSVTQ	TLTTGPDSAV	SQAHLTPSPV	PVSIQAVNQP
LMPLPQTLSL	YQDPLYPGFP	CNEKGDRAIV	PPYSLCQTGE	DLPKDKNILR
FFFNLGVKAY	SCPMWAPHSY	LYPLHQAYLA	ACRMYPKVPV	PVYPHNPWFQ
EAPAAQNESD	CTCTDAHFPM	QTEASVNGQM	PQPEIGPPTF	SSPLVIPPSQ
VSESHGQLSY	QADLESETPG	QLLHADYEES	LSGKNMFPQP	SFGPNPFLGP
VPIAPPFFPH	VWYGYPFQGF	IENPVMRQNI	VLPSDEKGEL	DLSLENLDLS
KDCGSVSTVD	EFPEARGEHV	HSLPEASVSS	KPDEGRTEQS	SQTRKADTAL
ASIPPVAEGK	AHPPTQILNR	ERETVPVELE	PKRTIQSLKE	KTEKVKDPKT
AADVVSPGAN	SVDSRVQRPK	EESSEDENEV	SNILRSGRSK	QFYNQTYGSR
KYKSDWGYSG	RGGYQHVRSE	ESWKGQPSRS	RDEGYQYHRN	VRGRPFRGDR
RRSGMGDGHR	GQHT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.

Література

Raineri I., Senn H.-P. (1992). HIV-1 promotor insertion revealed by selective detection of chimeric provirus-host gene transcripts. Nucleic Acids Res. 20: 6261—6266. PMID 1475186 DOI:10.1093/nar/20.23.6261
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24949 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q01804 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.