OTULIN

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3ZNV, 3ZNX, 3ZNZ, 4KSJ, 4KSK, 4KSL, 4OYK, 4P0B

Ідентифікатори

Символи

OTULIN, FAM105B, GUM, OTU deubiquitinase with linear linkage specificity, AIPDS

Зовнішні ІД

OMIM: 615712 MGI: 3577015 HomoloGene: 106591 GeneCards: OTULIN

Пов'язані генетичні захворювання

otulipenia^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • LUBAC complex • цитоплазма
Біологічний процес	• процес імунної системи • Wnt signaling pathway • протеоліз • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • Ангіогенез • canonical Wnt signaling pathway • sprouting angiogenesis • protein linear deubiquitination • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • вроджений імунітет • negative regulation of inflammatory response • regulation of canonical Wnt signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


90268


432940

Ensembl


ENSG00000154124


ENSMUSG00000046034

UniProt


Q96BN8


Q3UCV8

RefSeq (мРНК)


NM_138348


NM_001013792

RefSeq (білок)


NP_612357


NP_001013814

Локус (UCSC)

Хр. 5: 14.66 – 14.7 Mb

Хр. 15: 27.54 – 27.63 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OTULIN (англ. OTU deubiquitinase with linear linkage specificity) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 263^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRGTMPQPE	AWPGASCAET	PAREAAATAR	DGGKAAASGQ	PRPEMQCPAE
HEEDMYRAAD	EIEKEKELLI	HERGASEPRL	SVAPEMDIMD	YCKKEWRGNT
QKATCMKMGY	EEVSQKFTSI	RRVRGDNYCA	LRATLFQAMS	QAVGLPPWLQ
DPELMLLPEK	LISKYNWIKQ	WKLGLKFDGK	NEDLVDKIKE	SLTLLRKKWA
GLAEMRTAEA	RQIACDELFT	NEAEEYSLYE	AVKFLMLNRA	IELYNDKEKG
KEVPFFSVLL	FARDTSNDPG	QLLRNHLNQV	GHTGGLEQVE	MFLLAYAVRH
TIQVYRLSKY	NTEEFITVYP	TDPPKDWPVV	TLIAEDDRHY	NIPVRVCEET
SL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, ангіогенез, убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з OTULIN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25118 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96BN8 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.