OTULIN |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3ZNV, 3ZNX, 3ZNZ, 4KSJ, 4KSK, 4KSL, 4OYK, 4P0B | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | OTULIN, FAM105B, GUM, OTU deubiquitinase with linear linkage specificity, AIPDS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615712 MGI: 3577015 HomoloGene: 106591 GeneCards: OTULIN |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
otulipenia[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cysteine-type peptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • LUBAC complex • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • процес імунної системи • Wnt signaling pathway • протеоліз • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • Ангіогенез • canonical Wnt signaling pathway • sprouting angiogenesis • protein linear deubiquitination • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • вроджений імунітет • negative regulation of inflammatory response • regulation of canonical Wnt signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 14.66 – 14.7 Mb | Хр. 15: 27.54 – 27.63 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
OTULIN (англ. OTU deubiquitinase with linear linkage specificity) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 263[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRGTMPQPE | | AWPGASCAET | | PAREAAATAR | | DGGKAAASGQ | | PRPEMQCPAE |
HEEDMYRAAD | | EIEKEKELLI | | HERGASEPRL | | SVAPEMDIMD | | YCKKEWRGNT |
QKATCMKMGY | | EEVSQKFTSI | | RRVRGDNYCA | | LRATLFQAMS | | QAVGLPPWLQ |
DPELMLLPEK | | LISKYNWIKQ | | WKLGLKFDGK | | NEDLVDKIKE | | SLTLLRKKWA |
GLAEMRTAEA | | RQIACDELFT | | NEAEEYSLYE | | AVKFLMLNRA | | IELYNDKEKG |
KEVPFFSVLL | | FARDTSNDPG | | QLLRNHLNQV | | GHTGGLEQVE | | MFLLAYAVRH |
TIQVYRLSKY | | NTEEFITVYP | | TDPPKDWPVV | | TLIAEDDRHY | | NIPVRVCEET |
SL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, ангіогенез, убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з OTULIN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25118 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96BN8 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |