PARVA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2K2R, 2VZC, 2VZD, 2VZG, 2VZI, 3KMU, 3KMW, 3REP

Ідентифікатори

Символи

PARVA, CH-ILKBP, MXRA2, parvin alpha

Зовнішні ІД

OMIM: 608120 MGI: 1931144 HomoloGene: 10077 GeneCards: PARVA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • Z discdkac • цитоскелет • focal adhesion • actin cytoskeleton • клітинне ядро • lamellipodium
Біологічний процес	• actin cytoskeleton reorganization • cilium assembly • smooth muscle cell chemotaxis • heterotypic cell-cell adhesion • sprouting angiogenesis • outflow tract septum morphogenesis • establishment or maintenance of cell polarity • хемотаксис • actin-mediated cell contraction • адгезія клітин • cell projection organization • Ангіогенез • regulation of cell shape • substrate adhesion-dependent cell spreading • cell projection assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55742


57342

Ensembl


ENSG00000197702


ENSMUSG00000030770

UniProt


Q9NVD7


Q9EPC1

RefSeq (мРНК)


NM_018222


NM_020606

RefSeq (білок)


NP_060692


NP_065631

Локус (UCSC)

Хр. 11: 12.38 – 12.54 Mb

Хр. 7: 112.03 – 112.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PARVA (англ. Parvin alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 42 244^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATSPQKSPS	VPKSPTPKSP	PSRKKDDSFL	GKLGGTLARR	KKAKEVSELQ
EEGMNAINLP	LSPIPFELDP	EDTMLEENEV	RTMVDPNSRS	DPKLQELMKV
LIDWINDVLV	GERIIVKDLA	EDLYDGQVLQ	KLFEKLESEK	LNVAEVTQSE
IAQKQKLQTV	LEKINETLKL	PPRSIKWNVD	SVHAKSLVAI	LHLLVALSQY
FRAPIRLPDH	VSIQVVVVQK	REGILQSRQI	QEEITGNTEA	LSGRHERDAF
DTLFDHAPDK	LNVVKKTLIT	FVNKHLNKLN	LEVTELETQF	ADGVYLVLLM
GLLEGYFVPL	HSFFLTPDSF	EQKVLNVSFA	FELMQDGGLE	KPKPRPEDIV
NCDLKSTLRV	LYNLFTKYRN	VE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, пдтримання форми клітини, ангіогенез, хемотаксис, біогенез та деградація війок, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.

Література

Tu Y., Huang Y., Zhang Y., Hua Y., Wu C. (2001). A new focal adhesion protein that interacts with integrin-linked kinase and regulates cell adhesion and spreading. J. Cell Biol. 153: 585—598. PMID 11331308 DOI:10.1083/jcb.153.3.585
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Aboulaich N., Vainonen J.P., Stralfors P., Vener A.V. (2004). Vectorial proteomics reveal targeting, phosphorylation and specific fragmentation of polymerase I and transcript release factor (PTRF) at the surface of caveolae in human adipocytes. Biochem. J. 383: 237—248. PMID 15242332 DOI:10.1042/BJ20040647
Nikolopoulos S.N., Turner C.E. (2000). Actopaxin, a new focal adhesion protein that binds paxillin LD motifs and actin and regulates cell adhesion. J. Cell Biol. 151: 1435—1448. PMID 11134073 DOI:10.1083/jcb.151.7.1435
Korenbaum E., Olski T.M., Noegel A.A. (2001). Genomic organization and expression profile of the parvin family of focal adhesion proteins in mice and humans. Gene. 279: 69—79. PMID 11722847 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00743-0
Zhang Y., Chen K., Tu Y., Wu C. (2004). Distinct roles of two structurally closely related focal adhesion proteins, alpha-parvins and beta-parvins, in regulation of cell morphology and survival. J. Biol. Chem. 279: 41695—41705. PMID 15284246 DOI:10.1074/jbc.M401563200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14652 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NVD7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 червня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.