PCDH10 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDH10, OL-PCDH, PCDH19, protocadherin 10 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608286 MGI: 1338042 HomoloGene: 74967 GeneCards: PCDH10 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001098170 NM_001098171 NM_001098172 NM_011043 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 133.15 – 133.21 Mb | Хр. 3: 45.33 – 45.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDH10 (англ. Protocadherin 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 112 936[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MIVLLLFALL | | WMVEGVFSQL | | HYTVQEEQEH | | GTFVGNIAED | | LGLDITKLSA |
RGFQTVPNSR | | TPYLDLNLET | | GVLYVNEKID | | REQICKQSPS | | CVLHLEVFLE |
NPLELFQVEI | | EVLDINDNPP | | SFPEPDLTVE | | ISESATPGTR | | FPLESAFDPD |
VGTNSLRDYE | | ITPNSYFSLD | | VQTQGDGNRF | | AELVLEKPLD | | REQQAVHRYV |
LTAVDGGGGG | | GVGEGGGGGG | | GAGLPPQQQR | | TGTALLTIRV | | LDSNDNVPAF |
DQPVYTVSLP | | ENSPPGTLVI | | QLNATDPDEG | | QNGEVVYSFS | | SHISPRAREL |
FGLSPRTGRL | | EVSGELDYEE | | SPVYQVYVQA | | KDLGPNAVPA | | HCKVLVRVLD |
ANDNAPEISF | | STVKEAVSEG | | AAPGTVVALF | | SVTDRDSEEN | | GQVQCELLGD |
VPFRLKSSFK | | NYYTIVTEAP | | LDREAGDSYT | | LTVVARDRGE | | PALSTSKSIQ |
VQVSDVNDNA | | PRFSQPVYDV | | YVTENNVPGA | | YIYAVSATDR | | DEGANAQLAY |
SILECQIQGM | | SVFTYVSINS | | ENGYLYALRS | | FDYEQLKDFS | | FQVEARDAGS |
PQALAGNATV | | NILIVDQNDN | | APAIVAPLPG | | RNGTPAREVL | | PRSAEPGYLL |
TRVAAVDADD | | GENARLTYSI | | VRGNEMNLFR | | MDWRTGELRT | | ARRVPAKRDP |
QRPYELVIEV | | RDHGQPPLSS | | TATLVVQLVD | | GAVEPQGGGG | | SGGGGSGEHQ |
RPSRSGGGET | | SLDLTLILII | | ALGSVSFIFL | | LAMIVLAVRC | | QKEKKLNIYT |
CLASDCCLCC | | CCCGGGGSTC | | CGRQARARKK | | KLSKSDIMLV | | QSSNVPSNPA |
QVPIEESGGF | | GSHHHNQNYC | | YQVCLTPESA | | KTDLMFLKPC | | SPSRSTDTEH |
NPCGAIVTGY | | TDQQPDIISN | | GSILSNETKH | | QRAELSYLVD | | RPRRVNSSAF |
QEADIVSSKD | | SGHGDSEQGD | | SDHDATNRAQ | | SAGMDLFSNC | | TEECKALGHS |
DRCWMPSFVP | | SDGRQAADYR | | SNLHVPGMDS | | VPDTEVFETP | | EAQPGAERSF |
STFGKEKALH | | STLERKELDG | | LLTNTRAPYK | | PPYLTRKRIC |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- Wolverton T., Lalande M. (2001). Identification and characterization of three members of a novel subclass of protocadherins. Genomics. 76: 66—72. PMID 11549318 DOI:10.1006/geno.2001.6592
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13404 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P2E7 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |