PCDH18 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDH18, PCDH68L, protocadherin 18 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608287 MGI: 1920423 HomoloGene: 10389 GeneCards: PCDH18 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • brain development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/eb/PBB_GE_PCDH18_gnf1h00321_at_fs.png/250px-PBB_GE_PCDH18_gnf1h00321_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_569715 NP_001391291 NP_001391292 NP_001391293 NP_001391295
| NP_001391296 NP_001391306 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 137.52 – 137.53 Mb | Хр. 3: 49.7 – 49.71 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDH18 (англ. Protocadherin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 135 амінокислот, а молекулярна маса — 126 149[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHQMNAKMHF | | RFVFALLIVS | | FNHDVLGKNL | | KYRIYEEQRV | | GSVIARLSED |
VADVLLKLPN | | PSTVRFRAMQ | | RGNSPLLVVN | | EDNGEISIGA | | TIDREQLCQK |
NLNCSIEFDV | | ITLPTEHLQL | | FHIEVEVLDI | | NDNSPQFSRS | | LIPIEISESA |
AVGTRIPLDS | | AFDPDVGENS | | LHTYSLSAND | | FFNIEVRTRT | | DGAKYAELIV |
VRELDRELKS | | SYELQLTASD | | MGVPQRSGSS | | ILKISISDSN | | DNSPAFEQQS |
YIIQLLENSP | | VGTLLLDLNA | | TDPDEGANGK | | IVYSFSSHVS | | PKIMETFKID |
SERGHLTLFK | | QVDYEITKSY | | EIDVQAQDLG | | PNSIPAHCKI | | IIKVVDVNDN |
KPEININLMS | | PGKEEISYIF | | EGDPIDTFVA | | LVRVQDKDSG | | LNGEIVCKLH |
GHGHFKLQKT | | YENNYLILTN | | ATLDREKRSE | | YSLTVIAEDR | | GTPSLSTVKH |
FTVQINDIND | | NPPHFQRSRY | | EFVISENNSP | | GAYITTVTAT | | DPDLGENGQV |
TYTILESFIL | | GSSITTYVTI | | DPSNGAIYAL | | RIFDHEEVSQ | | ITFVVEARDG |
GSPKQLVSNT | | TVVLTIIDEN | | DNVPVVIGPA | | LRNNTAEITI | | PKGAESGFHV |
TRIRAIDRDS | | GVNAELSCAI | | VAGNEENIFI | | IDPRSCDIHT | | NVSMDSVPYT |
EWELSVIIQD | | KGNPQLHTKV | | LLKCMIFEYA | | ESVTSTAMTS | | VSQASLDVSM |
IIIISLGAIC | | AVLLVIMVLF | | ATRCNREKKD | | TRSYNCRVAE | | STYQHHPKRP |
SRQIHKGDIT | | LVPTINGTLP | | IRSHHRSSPS | | SSPTLERGQM | | GSRQSHNSHQ |
SLNSLVTISS | | NHVPENFSLE | | LTHATPAVEQ | | VSQLLSMLHQ | | GQYQPRPSFR |
GNKYSRSYRY | | ALQDMDKFSL | | KDSGRGDSEA | | GDSDYDLGRD | | SPIDRLLGEG |
FSDLFLTDGR | | IPAAMRLCTE | | ECRVLGHSDQ | | CWMPPLPSPS | | SDYRSNMFIP |
GEEFPTQPQQ | | QHPHQSLEDD | | AQPADSGEKK | | KSFSTFGKDS | | PNDEDTGDTS |
TSSLLSEMSS | | VFQRLLPPSL | | DTYSECSEVD | | RSNSLERRKG | | PLPAKTVGYP |
QGVAAWAAST | | HFQNPTTNCG | | PPLGTHSSVQ | | PSSKWLPAME | | EIPENYEEDD |
FDNVLNHLND | | GKHELMDASE | | LVAEINKLLQ | | DVRQS |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wolverton T., Lalande M. (2001). Identification and characterization of three members of a novel subclass of protocadherins. Genomics. 76: 66—72. PMID 11549318 DOI:10.1006/geno.2001.6592
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14268 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9HCL0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |