PCDH18

Ідентифікатори

Символи

PCDH18, PCDH68L, protocadherin 18

Зовнішні ІД

OMIM: 608287 MGI: 1920423 HomoloGene: 10389 GeneCards: PCDH18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• brain development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54510


73173

Ensembl


ENSG00000189184


ENSMUSG00000037892

UniProt


Q9HCL0


Q8VHR0

RefSeq (мРНК)


NM_001300828 NM_019035


NM_130448

RefSeq (білок)


NP_001287757 NP_061908

NP_569715 NP_001391291 NP_001391292 NP_001391293 NP_001391295
NP_001391296 NP_001391306

Локус (UCSC)

Хр. 4: 137.52 – 137.53 Mb

Хр. 3: 49.7 – 49.71 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDH18 (англ. Protocadherin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 135 амінокислот, а молекулярна маса — 126 149^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHQMNAKMHF	RFVFALLIVS	FNHDVLGKNL	KYRIYEEQRV	GSVIARLSED
VADVLLKLPN	PSTVRFRAMQ	RGNSPLLVVN	EDNGEISIGA	TIDREQLCQK
NLNCSIEFDV	ITLPTEHLQL	FHIEVEVLDI	NDNSPQFSRS	LIPIEISESA
AVGTRIPLDS	AFDPDVGENS	LHTYSLSAND	FFNIEVRTRT	DGAKYAELIV
VRELDRELKS	SYELQLTASD	MGVPQRSGSS	ILKISISDSN	DNSPAFEQQS
YIIQLLENSP	VGTLLLDLNA	TDPDEGANGK	IVYSFSSHVS	PKIMETFKID
SERGHLTLFK	QVDYEITKSY	EIDVQAQDLG	PNSIPAHCKI	IIKVVDVNDN
KPEININLMS	PGKEEISYIF	EGDPIDTFVA	LVRVQDKDSG	LNGEIVCKLH
GHGHFKLQKT	YENNYLILTN	ATLDREKRSE	YSLTVIAEDR	GTPSLSTVKH
FTVQINDIND	NPPHFQRSRY	EFVISENNSP	GAYITTVTAT	DPDLGENGQV
TYTILESFIL	GSSITTYVTI	DPSNGAIYAL	RIFDHEEVSQ	ITFVVEARDG
GSPKQLVSNT	TVVLTIIDEN	DNVPVVIGPA	LRNNTAEITI	PKGAESGFHV
TRIRAIDRDS	GVNAELSCAI	VAGNEENIFI	IDPRSCDIHT	NVSMDSVPYT
EWELSVIIQD	KGNPQLHTKV	LLKCMIFEYA	ESVTSTAMTS	VSQASLDVSM
IIIISLGAIC	AVLLVIMVLF	ATRCNREKKD	TRSYNCRVAE	STYQHHPKRP
SRQIHKGDIT	LVPTINGTLP	IRSHHRSSPS	SSPTLERGQM	GSRQSHNSHQ
SLNSLVTISS	NHVPENFSLE	LTHATPAVEQ	VSQLLSMLHQ	GQYQPRPSFR
GNKYSRSYRY	ALQDMDKFSL	KDSGRGDSEA	GDSDYDLGRD	SPIDRLLGEG
FSDLFLTDGR	IPAAMRLCTE	ECRVLGHSDQ	CWMPPLPSPS	SDYRSNMFIP
GEEFPTQPQQ	QHPHQSLEDD	AQPADSGEKK	KSFSTFGKDS	PNDEDTGDTS
TSSLLSEMSS	VFQRLLPPSL	DTYSECSEVD	RSNSLERRKG	PLPAKTVGYP
QGVAAWAAST	HFQNPTTNCG	PPLGTHSSVQ	PSSKWLPAME	EIPENYEEDD
FDNVLNHLND	GKHELMDASE	LVAEINKLLQ	DVRQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wolverton T., Lalande M. (2001). Identification and characterization of three members of a novel subclass of protocadherins. Genomics. 76: 66—72. PMID 11549318 DOI:10.1006/geno.2001.6592

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14268 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HCL0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.