PCDHA2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8e/Protein_PCDHA2_PDB_1wuz.png/250px-Protein_PCDHA2_PDB_1wuz.png) |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHA2, PCDH-ALPHA2, protocadherin alpha 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606308 MGI: 2681880 HomoloGene: 135719 GeneCards: PCDHA2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/61/PBB_GE_PCDHA2_211365_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PCDHA2_211365_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_031496 NM_018905 NM_031495 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_061728 NP_113683 NP_113684 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 140.79 – 141.01 Mb | Хр. 18: 37.07 – 37.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHA2 (англ. Protocadherin alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 948 амінокислот, а молекулярна маса — 102 063[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASSIRRGRG | | AWTRLLSLLL | | LAAWEVGSGQ | | LRYSVPEEAK | | HGTFVGRIAQ |
DLGLELEELV | | PRLFRVASKR | | HGDLLEVNLQ | | NGILFVNSRI | | DREELCGRSA |
ECSIHVEVIV | | DRPLQVFHVE | | VEVKDINDNP | | PIFPMTVKTI | | RFPESRLLDS |
RFPLEGASDA | | DIGVNALLSY | | KLSSSEFFFL | | DIQANDELSE | | SLSLVLGKSL |
DREETAEVNL | | LLVATDGGKP | | ELTGTVQILI | | KVLDVNDNEP | | TFAQSVYKVK |
LLENTANGTL | | VVKLNASDAD | | EGPNSEIVYS | | LGSDVSSTIQ | | TKFTIDPISG |
EIRTKGKLDY | | EEAKSYEIQV | | TATDKGTPSM | | SGHCKISLKL | | VDINDNTPEV |
SITSLSLPIS | | ENASLGTVIA | | LITVSDRDSG | | TNGHVTCSLT | | PHVPFKLVST |
FKNYYSLVLD | | SALDRESVSA | | YELVVTARDG | | GSPSLWATTS | | VSIEVADVND |
NAPAFAQPEY | | TVFVKENNPP | | GCHIFTVSAW | | DADAQENALV | | SYSLVERRVG |
ERALSSYVSV | | HAESGKVYAL | | QPLDHEEVEL | | LQFQVSARDA | | GVPPLGSNVT |
LQVFVLDEND | | NAPALLAPRA | | GTAAGAVSEL | | VPWSVGAGHV | | VAKVRAVDAD |
SGYNAWLSYE | | LQLGTGSARI | | PFRVGLYTGE | | ISTTRALDEA | | DSPRHRLLVL |
VKDHGEPALT | | ATATVLVSLV | | ESGQAPKASS | | RAWVGAAGSE | | ATLVDVNVYL |
IIAICAVSSL | | LVLTVLLYTA | | LRCSVPPTEG | | ARAPGKPTLV | | CSSAVGSWSY |
SQQRRQRVCS | | GEDPPKTDLM | | AFSPSLSQGP | | DSAEEKQLSE | | SEYVGKPRQP |
NPDWRYSASL | | RAGMHSSVHL | | EEAGILRAGP | | GGPDQQWPTV | | SSATPEPEAG |
EVSPPVGAGV | | NSNSWTFKYG | | PGNPKQSGPG | | ELPDKFIIPG | | SPAIISIRQE |
PTNSQIDKSD | | FITFGKKEET | | KKKKKKKKGN | | KTQEKKEKGN | | STTDNSDQ |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8668 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5H9 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |