PCDHA2

Ідентифікатори

Символи

PCDHA2, PCDH-ALPHA2, protocadherin alpha 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606308 MGI: 2681880 HomoloGene: 135719 GeneCards: PCDHA2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56146


353234

Ensembl


ENSG00000204969


ENSMUSG00000104148

UniProt


Q9Y5H9


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_031496 NM_018905 NM_031495


NM_198117

RefSeq (білок)


NP_061728 NP_113683 NP_113684


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 5: 140.79 – 141.01 Mb

Хр. 18: 37.07 – 37.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHA2 (англ. Protocadherin alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 948 амінокислот, а молекулярна маса — 102 063^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSIRRGRG	AWTRLLSLLL	LAAWEVGSGQ	LRYSVPEEAK	HGTFVGRIAQ
DLGLELEELV	PRLFRVASKR	HGDLLEVNLQ	NGILFVNSRI	DREELCGRSA
ECSIHVEVIV	DRPLQVFHVE	VEVKDINDNP	PIFPMTVKTI	RFPESRLLDS
RFPLEGASDA	DIGVNALLSY	KLSSSEFFFL	DIQANDELSE	SLSLVLGKSL
DREETAEVNL	LLVATDGGKP	ELTGTVQILI	KVLDVNDNEP	TFAQSVYKVK
LLENTANGTL	VVKLNASDAD	EGPNSEIVYS	LGSDVSSTIQ	TKFTIDPISG
EIRTKGKLDY	EEAKSYEIQV	TATDKGTPSM	SGHCKISLKL	VDINDNTPEV
SITSLSLPIS	ENASLGTVIA	LITVSDRDSG	TNGHVTCSLT	PHVPFKLVST
FKNYYSLVLD	SALDRESVSA	YELVVTARDG	GSPSLWATTS	VSIEVADVND
NAPAFAQPEY	TVFVKENNPP	GCHIFTVSAW	DADAQENALV	SYSLVERRVG
ERALSSYVSV	HAESGKVYAL	QPLDHEEVEL	LQFQVSARDA	GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND	NAPALLAPRA	GTAAGAVSEL	VPWSVGAGHV	VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE	LQLGTGSARI	PFRVGLYTGE	ISTTRALDEA	DSPRHRLLVL
VKDHGEPALT	ATATVLVSLV	ESGQAPKASS	RAWVGAAGSE	ATLVDVNVYL
IIAICAVSSL	LVLTVLLYTA	LRCSVPPTEG	ARAPGKPTLV	CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS	GEDPPKTDLM	AFSPSLSQGP	DSAEEKQLSE	SEYVGKPRQP
NPDWRYSASL	RAGMHSSVHL	EEAGILRAGP	GGPDQQWPTV	SSATPEPEAG
EVSPPVGAGV	NSNSWTFKYG	PGNPKQSGPG	ELPDKFIIPG	SPAIISIRQE
PTNSQIDKSD	FITFGKKEET	KKKKKKKKGN	KTQEKKEKGN	STTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8668 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5H9 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.