PCDHA4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WUZ

Ідентифікатори

Символи

PCDHA4, CNR1, CNRN1, CRNR1, PCDH-ALPHA4, protocadherin alpha 4

Зовнішні ІД

OMIM: 606310 MGI: 1298406 HomoloGene: 130626 GeneCards: PCDHA4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • синапс
Біологічний процес	• адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56144


12936

Ensembl


ENSG00000204967


ENSMUSG00000104252

UniProt


Q9UN74


O88689

RefSeq (мРНК)


NM_031500 NM_018907


NM_007766

RefSeq (білок)


NP_061730 NP_113688


NP_001167625

Локус (UCSC)

Хр. 5: 140.81 – 141.01 Mb

Хр. 18: 37.09 – 37.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHA4 (англ. Protocadherin alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 947 амінокислот, а молекулярна маса — 102 293^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFSWGSGQE	SRRLLLLLLL	LAAWEAGNGQ	LHYSVSEEAK	HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV	PRLFRVASKG	RGGLLEVNLQ	NGILFVNSRI	DREELCRRSA
ECSIHLEVIV	DRPLQVFHVD	VEVRDINDNP	PVFPATQKNL	SIAESRPLDS
RFPLEGASDA	DIGENALLTY	RLSPNEYFSL	EKPPDDELVK	GLGLILRKSL
DREEAPEIFL	VLTATDGGKP	ELTGTVQLLI	TVLDANDNAP	AFDRTIYKVR
LLENVPNGTL	VIKLNASDLD	EGLNGDIVYS	FSNDISPNVK	SKFHIDPITG
QIIVKGYIDF	EESKSYEIIV	EGIDKGQLPL	SGHCRVIVEV	EDNNDNVPDL
EFKSLSLPIR	EDAPLGTVIA	LISVSDKDMG	VNGLVTCSLT	SHVPFKLVST
FKNYYSLVLD	SALDRESVSA	YELVVTARDG	GSPSLWATAS	VSVEVADVND
NAPAFAQPEY	TVFVKENNPP	GCHIFTVSAW	DADAQENALV	SYSLVERRVG
ERALSSYVSV	HAESGKVYAL	QPLDHEELEL	LQFQVTARDA	GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND	NAPALLAPRA	GGTGGAVSEL	VPWSVGVGHV	VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE	LQPGTGGARI	PFRVGLYTGE	ISTTRALDET	DAPRHRLLVL
VKDHGEPALT	ATATVLVSLV	ESGQAPKASS	RALVGAVGPD	AALVDVNVYL
IIAICAVSSL	LVLTLLLYTA	LRCSALPTEG	ACAPGKPTLV	CSSAVGSWSY
SQQRRPRVCS	GEGPPKTDLM	AFSPSLPDSR	DREDQLQTTE	ESFAKPRQPN
PDWRYSASLR	AGMHSSVHLE	EAGILRAGPG	GPDQQWPTVS	SATPEPEAGE
VSPPVGAGVN	SNSWTFKYGP	GNPKQSGPGE	LPDKFIIPGS	PAIISIRQEP
TNSQIDKSDF	ITFGKKEETK	KKKKKKKGNK	TQEKKEKGNS	TTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8670 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UN74 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.