PCDHA4 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/22/Protein_PCDHA4_PDB_1wuz.png/250px-Protein_PCDHA4_PDB_1wuz.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHA4, CNR1, CNRN1, CRNR1, PCDH-ALPHA4, protocadherin alpha 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606310 MGI: 1298406 HomoloGene: 130626 GeneCards: PCDHA4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • синапс |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 140.81 – 141.01 Mb | Хр. 18: 37.09 – 37.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHA4 (англ. Protocadherin alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 947 амінокислот, а молекулярна маса — 102 293[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEFSWGSGQE | | SRRLLLLLLL | | LAAWEAGNGQ | | LHYSVSEEAK | | HGTFVGRIAQ |
DLGLELAELV | | PRLFRVASKG | | RGGLLEVNLQ | | NGILFVNSRI | | DREELCRRSA |
ECSIHLEVIV | | DRPLQVFHVD | | VEVRDINDNP | | PVFPATQKNL | | SIAESRPLDS |
RFPLEGASDA | | DIGENALLTY | | RLSPNEYFSL | | EKPPDDELVK | | GLGLILRKSL |
DREEAPEIFL | | VLTATDGGKP | | ELTGTVQLLI | | TVLDANDNAP | | AFDRTIYKVR |
LLENVPNGTL | | VIKLNASDLD | | EGLNGDIVYS | | FSNDISPNVK | | SKFHIDPITG |
QIIVKGYIDF | | EESKSYEIIV | | EGIDKGQLPL | | SGHCRVIVEV | | EDNNDNVPDL |
EFKSLSLPIR | | EDAPLGTVIA | | LISVSDKDMG | | VNGLVTCSLT | | SHVPFKLVST |
FKNYYSLVLD | | SALDRESVSA | | YELVVTARDG | | GSPSLWATAS | | VSVEVADVND |
NAPAFAQPEY | | TVFVKENNPP | | GCHIFTVSAW | | DADAQENALV | | SYSLVERRVG |
ERALSSYVSV | | HAESGKVYAL | | QPLDHEELEL | | LQFQVTARDA | | GVPPLGSNVT |
LQVFVLDEND | | NAPALLAPRA | | GGTGGAVSEL | | VPWSVGVGHV | | VAKVRAVDAD |
SGYNAWLSYE | | LQPGTGGARI | | PFRVGLYTGE | | ISTTRALDET | | DAPRHRLLVL |
VKDHGEPALT | | ATATVLVSLV | | ESGQAPKASS | | RALVGAVGPD | | AALVDVNVYL |
IIAICAVSSL | | LVLTLLLYTA | | LRCSALPTEG | | ACAPGKPTLV | | CSSAVGSWSY |
SQQRRPRVCS | | GEGPPKTDLM | | AFSPSLPDSR | | DREDQLQTTE | | ESFAKPRQPN |
PDWRYSASLR | | AGMHSSVHLE | | EAGILRAGPG | | GPDQQWPTVS | | SATPEPEAGE |
VSPPVGAGVN | | SNSWTFKYGP | | GNPKQSGPGE | | LPDKFIIPGS | | PAIISIRQEP |
TNSQIDKSDF | | ITFGKKEETK | | KKKKKKKGNK | | TQEKKEKGNS | | TTDNSDQ |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8670 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UN74 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |