PCDHA9

Ідентифікатори

Символи

PCDHA9, PCDH-ALPHA9, protocadherin alpha 9

Зовнішні ІД

OMIM: 606315 MGI: 2681879 HomoloGene: 129614 GeneCards: PCDHA9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9752


353235

Ensembl


ENSG00000204961


ENSMUSG00000103800

UniProt


Q9Y5H5


Q91Y12

RefSeq (мРНК)


NM_031857 NM_014005


NM_201243

RefSeq (білок)


NP_054724 NP_114063


NP_957695

Локус (UCSC)

Хр. 5: 140.85 – 141.01 Mb

Хр. 18: 37.13 – 37.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHA9 (англ. Protocadherin alpha 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 402^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLYSSRGDPE	GQPLLLSLLI	LAMWVVGSGQ	LHYSVPEEAE	HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV	PRLFQLDSKG	RGDLLEVNLQ	NGILFVNSRI	DREELCGRSA
ECSIHLEVIV	DRPLQVFHVD	VEVKDINDNP	PVFPATQKNL	FIAESRPLDS
RFPLEGASDA	DIGENALLTY	RLSPNEYFFL	DVPTSNQQVK	PLGLVLRKLL
DREETPELHL	LLTATDGGKP	ELTGTVQLLI	TVLDNNDNAP	VFDRTLYTVK
LPENVSIGTL	VIHPNASDLD	EGLNGDIIYS	FSSDVSPDIK	SKFHMDPLSG
AITVIGHMDF	EESRAHKIPV	EAVDKGFPPL	AGHCTLLVEV	VDVNDNAPQL
TIKTLSVPVK	EDAQLGTVIA	LISVIDLDAD	ANGQVTCSLT	PHVPFKLVST
YKNYYSLVLD	RALDRESVSA	YELVVTARDG	GSPSLWATAR	VSVEVADVND
NAPAFAQSEY	TVFVKENNPP	GCHIFTVSAR	DADAQENALV	SYSLVERRLG
ERSLSSYVSV	HAESGKVYAL	QPLDHEELEL	LQFQVSARDA	GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND	NAPALLTPRM	RGTDGAVSEM	VLRSVGAGVV	VGKVRAVDAD
SGYNAWLSYE	LQPETASASI	PFRVGLYTGE	ISTTRALDET	DAPRQRLLVL
VKDHGEPALT	ATATVLVSLV	ESGQAPKSSS	RASVGATGPE	VTLVDVNVYL
IIAICAVSSL	LVLTLLLYTV	LRCSAMPTEG	ECAPGKPTLV	CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS	GEGKQKTDLM	AFSPGLSPCA	GSTERTGEPS	ASSDSTGKPR
QPNPDWRYSA	SLRAGMHSSV	HLEEAGILRA	GPGGPDQQWP	TVSSATPEPE
AGEVSPPVGA	GVNSNSWTFK	YGPGNPKQSG	PGELPDKFII	PGSPAIISIR
QEPTNSQIDK	SDFITFGKKE	ETKKKKKKKK	GNKTQEKKEK	GNSTTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8675 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5H5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.