PCDHB11

Ідентифікатори

Символи

PCDHB11, ME2, PCDH-BETA11, protocadherin beta 11

Зовнішні ІД

OMIM: 606337 MGI: 2136759 HomoloGene: 134302 GeneCards: PCDHB11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • synapse assembly • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56125


93892

Ensembl


ENSG00000197479


ENSMUSG00000044022

UniProt


Q9Y5F2


Q91V48

RefSeq (мРНК)


NM_018931


NM_053146

RefSeq (білок)


NP_061754


NP_444376

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.2 – 141.2 Mb

Хр. 18: 37.65 – 37.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB11 (англ. Protocadherin beta 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 87 088^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENQGTRTQQ	IRQVLLLFVL	LGMSQAGSET	WSFSVAEEMQ	SGSFVGNLAK
DLGLKVRELS	SRGARVVSND	KKQRLQLDIN	TGDLLLSETL	DREELCGSIE
PCVLHLQVLM	QNPTQFLQIE	LQVRDINDHS	PIFSEKQMLL	EIPENSPVGA
VFLLESAKDL	DVGINAVKSY	TISPNSHFHI	KMRVIPDNRK	YPELVLDKAL
DYEELPELSF	ILSALDGGSP	PRSGTALVRV	VVVDINDNSP	EFEQAFYEVK
IRENSILGSL	ILIVSAWDLD	SGTNGEICYT	FSHASEDIRK	TFEINQKSGE
ITLRAPLDFE	TIESYSIIIQ	ATDGGGLFGK	STVIIHVIDV	NDNAPEITVS
SITSPIPENT	PETVVMVFSI	QDIDSGDNGR	IVCSIPEDLP	FVLKSSVENY
YTLETERPLD	RESTAEYNIT	ITVTDLGIPR	LKTEHNTTVL	VSDVNDNAPT
FTQTSYTLFV	RENNSPALHI	GSVSATDRDS	GTNAQVNYSL	LPPQDLHLPL
ASLVSINTDN	GHLFALRSLD	YEALQAFDFR	VGATDRGSPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNGSA	PCTELVPRAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDAAKHRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLQV	LLVDGFSQPY	LPLPEAAPAQ	AQADSLTVYL	VVALASVSSL
FLFSVLLFVA	VRLCRRSRAA	SVGSCSVPKG	PFPGHLVDVS	GTGTLSQSYQ
YEVCLTGGSE	TNEFKFLKPV	IPNIQAKGLG	KNSEENSTFR	NSFGFNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8682 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5F2 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.