PCDHB11 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHB11, ME2, PCDH-BETA11, protocadherin beta 11 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606337 MGI: 2136759 HomoloGene: 134302 GeneCards: PCDHB11 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • synapse assembly • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e4/PBB_GE_PCDHB11_208504_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_PCDHB11_208504_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.2 – 141.2 Mb | Хр. 18: 37.65 – 37.65 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHB11 (англ. Protocadherin beta 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 87 088[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MENQGTRTQQ | | IRQVLLLFVL | | LGMSQAGSET | | WSFSVAEEMQ | | SGSFVGNLAK |
DLGLKVRELS | | SRGARVVSND | | KKQRLQLDIN | | TGDLLLSETL | | DREELCGSIE |
PCVLHLQVLM | | QNPTQFLQIE | | LQVRDINDHS | | PIFSEKQMLL | | EIPENSPVGA |
VFLLESAKDL | | DVGINAVKSY | | TISPNSHFHI | | KMRVIPDNRK | | YPELVLDKAL |
DYEELPELSF | | ILSALDGGSP | | PRSGTALVRV | | VVVDINDNSP | | EFEQAFYEVK |
IRENSILGSL | | ILIVSAWDLD | | SGTNGEICYT | | FSHASEDIRK | | TFEINQKSGE |
ITLRAPLDFE | | TIESYSIIIQ | | ATDGGGLFGK | | STVIIHVIDV | | NDNAPEITVS |
SITSPIPENT | | PETVVMVFSI | | QDIDSGDNGR | | IVCSIPEDLP | | FVLKSSVENY |
YTLETERPLD | | RESTAEYNIT | | ITVTDLGIPR | | LKTEHNTTVL | | VSDVNDNAPT |
FTQTSYTLFV | | RENNSPALHI | | GSVSATDRDS | | GTNAQVNYSL | | LPPQDLHLPL |
ASLVSINTDN | | GHLFALRSLD | | YEALQAFDFR | | VGATDRGSPA | | LSSEALVRVL |
VLDANDNSPF | | VLYPLQNGSA | | PCTELVPRAA | | EPGYLVTKVV | | AVDGDSGQNA |
WLSYQLLKAT | | EPGLFGVWAH | | NGEVRTARLL | | SERDAAKHRL | | VVLVKDNGEP |
PRSATATLQV | | LLVDGFSQPY | | LPLPEAAPAQ | | AQADSLTVYL | | VVALASVSSL |
FLFSVLLFVA | | VRLCRRSRAA | | SVGSCSVPKG | | PFPGHLVDVS | | GTGTLSQSYQ |
YEVCLTGGSE | | TNEFKFLKPV | | IPNIQAKGLG | | KNSEENSTFR | | NSFGFNF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8682 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5F2 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |