PCDHB12

Ідентифікатори

Символи

PCDHB12, PCDH-BETA12, protocadherin beta 12

Зовнішні ІД

OMIM: 606338 MGI: 2136757 HomoloGene: 128411 GeneCards: PCDHB12

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • synapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56124


93890

Ensembl


ENSG00000120328


ENSMUSG00000043313

UniProt


Q9Y5F1


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_018932


NM_053144

RefSeq (білок)


NP_061755


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.21 – 141.21 Mb

Хр. 18: 37.63 – 37.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB12 (англ. Protocadherin beta 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 795 амінокислот, а молекулярна маса — 86 770^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENGGAGTLQ	IRQVLLFFVL	LGMSQAGSET	GNFLVMEELQ	SGSFVGNLAK
TLGLEVSELS	SRGARVVSND	NKECLQLDTN	TGDLLLREML	DREELCGSNE
PCVLYFQVLM	KNPTQFLQIE	LQVRDINDHS	PVFLEKEMLL	EIPENSPVGA
VFLLESAKDL	DVGINAVKSY	TINPNSHFHV	KIRVNPDNRK	YPELVLDKAL
DYEERPELSF	ILTALDGGSP	PRSGTALVRV	VVVDINDNSP	EFEQAFYEVK
ILENSILGSL	VVTVSAWDLD	SGTNSELSYT	FSHASEDIRK	TFEINQKSGD
ITLTAPLDFE	AIESYSIIIQ	ATDGGGLFGK	STVRIQVMDV	NDNAPEITVS
SITSPIPENT	PETVVMVFRI	RDRDSGDNGK	MVCSIPEDIP	FVLKSSVNNY
YTLETERPLD	RESRAEYNIT	ITVTDLGTPR	LKTEHNITVL	VSDVNDNAPA
FTQTSYALFV	RENNSPALHI	GSISATDRDS	GTNAQVNYSL	LPSQDPHLPL
ASLVSINADN	GHLFALRSLD	YEALQGFQFR	VGATDHGSPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNGSA	PCTELVPWAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDAAKHRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLHV	LLVDGFSQPY	LPLPEAAPAQ	AQADSLTVYL	VVALASVSSL
FLFSVLLFVA	VRLCRRSRAA	PVGRCSVPEG	PFPGHLVDVS	GTGTLSQSYH
YEVCVTGGSR	SNKFKFLKPI	IPNFLPQSTG	SEVEENPPFQ	NNLGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8683 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5F1 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.