PCDHB15

Ідентифікатори

Символи

PCDHB15, PCDH-BETA15, protocadherin beta 15

Зовнішні ІД

OMIM: 606341 MGI: 2136760 HomoloGene: 113752 GeneCards: PCDHB15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of plasma membrane • мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана • photoreceptor connecting cilium
Біологічний процес	• нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • chemical synaptic transmission • synapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56121


93893

Ensembl


ENSG00000113248


ENSMUSG00000073591

UniProt


Q9Y5E8


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_018935


NM_053147

RefSeq (білок)


NP_061758


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.25 – 141.25 Mb

Хр. 18: 37.65 – 37.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB15 (англ. Protocadherin beta 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 787 амінокислот, а молекулярна маса — 86 329^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPAGERFPE	QRQVLILLLL	LEVTLAGWEP	RRYSVMEETE	RGSFVANLAN
DLGLGVGELA	ERGARVVSED	NEQGLQLDLQ	TGQLILNEKL	DREKLCGPTE
PCIMHFQVLL	KKPLEVFRAE	LLVTDINDHS	PEFPEREMTL	KIPETSSLGT
VFPLKKARDL	DVGSNNVQNY	NISPNSHFHV	STRTRGDGRK	YPELVLDTEL
DREEQAELRL	TLTAVDGGSP	PRSGTVQILI	LVLDANDNAP	EFVQALYEVQ
VPENSPVGSL	VVKVSARDLD	TGTNGEISYS	LYYSSQEIDK	PFELSSLSGE
IRLIKKLDFE	TMSSYDLDIE	ASDGGGLSGK	CSVSVKVLDV	NDNFPELSIS
SLTSPIPENS	PETEVALFRI	RDRDSGENGK	MICSIQDDVP	FKLKPSVENF
YRLVTEGALD	RETRAEYNIT	ITITDLGTPR	LKTEQSITVL	VSDVNDNAPA
FTQTSYTLFV	RENNSPALHI	GSVSATDRDS	GTNAQVTYSL	LPPRDPHLPL
TSLVSINTDN	GHLFALQSLD	YEALQAFEFR	VGATDRGFPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNGSA	PCTELVPRAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDVAKHRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLQV	LLVDGFSQPY	LPLPEAAPAQ	AQADSLTVYL	VVALASVSSL
FLFSVFLFVA	VRLCRRSRAA	SVGRCSVPEG	PFPGHLVDVS	GTGTLSQSYQ
YEVCLTGGSE	SNDFKFLKPI	FPNIVSQDSR	RKSEFLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8686 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5E8 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.