PCDHB5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHB5, PCDH-BETA5, protocadherin beta 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606331 MGI: 2136745 HomoloGene: 88834 GeneCards: PCDHB5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • synapse assembly • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • адгезія клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.14 – 141.14 Mb | Хр. 18: 37.54 – 37.55 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHB5 (англ. Protocadherin beta 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 795 амінокислот, а молекулярна маса — 86 423[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
METALAKTPQ | | KRQVMFLAIL | | LLLWEAGSEA | | VRYSIPEETE | | SGYSVANLAK |
DLGLGVGELA | | TRGARMHYKG | | NKELLQLDIK | | TGNLLLYEKL | | DREVMCGATE |
PCILHFQLLL | | ENPVQFFQTD | | LQLTDINDHA | | PEFPEKEMLL | | KIPESTQPGT |
VFPLKIAQDF | | DIGSNTVQNY | | TISPNSHFHV | | ATHNRGDGRK | | YPELVLDKAL |
DREERPELSL | | TLTALDGGAP | | PRSGTTTIRI | | VVLDNNDNAP | | EFLQSFYEVQ |
VPENSPLNSL | | VVVVSARDLD | | AGAYGSVAYA | | LFQGDEVTQP | | FVIDEKTAEI |
RLKRALDFEA | | TPYYNVEIVA | | TDGGGLSGKC | | TVAIEVVDVN | | DNAPELTMST |
LSSPTPENAP | | ETVVAVFSVS | | DPDSGDNGRM | | ICSIQNDLPF | | LLKPTLKNFY |
TLVTQRTLDR | | ESQAEYNITI | | TVTDMGTPRL | | KTEHNITVLV | | SDVNDNAPAF |
TQTSYTLFVR | | ENNSPALHIG | | SVSATDRDSG | | TNAQVTYSLL | | PPQNPHLRLA |
SLVSINADNG | | HLFALRSLDY | | EALQAFEFRV | | GATDRGSPAL | | SSEALVRVLV |
LDANDNSPFV | | LYPLQNGSAP | | CTELVPRAAE | | PGYLVTKVVA | | VDGDSGQNAW |
LSYQLLKATE | | PGLFSMWAHN | | GEVRTARLLS | | ERDAAKHRLV | | VLVKDNGEPP |
RSATATLHVL | | LVDGFSQPYL | | PLPEAAPAQA | | QADSLTVYLV | | VALASVSSLF |
LFSVLLFVAV | | RLCRRSRAAS | | VGRCSVPEGP | | FPGHLVDVSG | | TGTLSQSYHY |
EVCLTGDSGA | | GEFKFLKPII | | PNLLPQGAGE | | EIGKTAAFRN | | SFGLN |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8690 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5E4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |