PCID2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3T5X

Ідентифікатори

Символи

PCID2, F10, PCI domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 613713 MGI: 2443003 HomoloGene: 10168 GeneCards: PCID2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерна пора • transcription export complex 2 • компонент клітини • клітинне ядро • цитоплазма • nuclear pore nuclear basket
Біологічний процес	• positive regulation of B cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint • negative regulation of apoptotic process • spleen development • regulation of mRNA stability • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity • posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • poly(A)+ mRNA export from nucleus • protein transport • mRNA transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55795


234069

Ensembl


ENSG00000126226


ENSMUSG00000038542

UniProt


Q5JVF3


Q8BFV2

RefSeq (мРНК)

NM_001127202 NM_001127203 NM_001258212 NM_001258213 NM_018386
NM_001320655 NM_001320656 NM_001320657 NM_001320659 NM_001320660 NM_001353091 NM_001353092 NM_001353093 NM_001353094 NM_001353095


NM_178708

RefSeq (білок)

NP_001120674 NP_001120675 NP_001245142 NP_001307584 NP_001307585
NP_001307586 NP_001307588 NP_001307589 NP_060856 NP_001340020 NP_001340021 NP_001340022 NP_001340023 NP_001340024


NP_848823

Локус (UCSC)

Хр. 13: 113.18 – 113.21 Mb

Хр. 8: 13.13 – 13.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCID2 (англ. PCI domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 46 030^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHITINQYL	QQVYEAIDSR	DGASCAELVS	FKHPHVANPR	LQMASPEEKC
QQVLEPPYDE	MFAAHLRCTY	AVGNHDFIEA	YKCQTVIVQS	FLRAFQAHKE
ENWALPVMYA	VALDLRVFAN	NADQQLVKKG	KSKVGDMLEK	AAELLMSCFR
VCASDTRAGI	EDSKKWGMLF	LVNQLFKIYF	KINKLHLCKP	LIRAIDSSNL
KDDYSTAQRV	TYKYYVGRKA	MFDSDFKQAE	EYLSFAFEHC	HRSSQKNKRM
ILIYLLPVKM	LLGHMPTVEL	LKKYHLMQFA	EVTRAVSEGN	LLLLHEALAK
HEAFFIRCGI	FLILEKLKII	TYRNLFKKVY	LLLKTHQLSL	DAFLVALKFM
QVEDVDIDEV	QCILANLIYM	GHVKGYISHQ	HQKLVVSKQN	PFPPLSTVC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25653 (англ.) . Процитовано 20 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q5JVF3 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.