PDCD4 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fb/Protein_PDCD4_PDB_2ggf.png/250px-Protein_PDCD4_PDB_2ggf.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2KZT, 2GGF, 2RG8, 2ZU6, 3EIJ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDCD4, H731, programmed cell death 4 (neoplastic transformation inhibitor), programmed cell death 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608610 MGI: 107490 HomoloGene: 7879 GeneCards: PDCD4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of protein metabolic process • negative regulation of cell cycle • negative regulation of apoptotic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of JUN kinase activity • positive regulation of smooth muscle cell apoptotic process • negative regulation of myofibroblast differentiation • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of endothelial cell apoptotic process • BMP signaling pathway • epithelial to mesenchymal transition involved in cardiac fibroblast development • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation • positive regulation of inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • interleukin-12-mediated signaling pathway • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/ac/PBB_GE_PDCD4_212593_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDCD4_212593_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4f/PBB_GE_PDCD4_202731_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDCD4_202731_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e4/PBB_GE_PDCD4_202730_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDCD4_202730_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_145341 NM_001199492 NM_014456 |
| | NM_001168491 NM_001168492 NM_011050 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186421 NP_055271 NP_663314 |
| | NP_001161963 NP_001161964 NP_035180 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 110.87 – 110.9 Mb | Хр. 19: 53.88 – 53.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDCD4 (англ. Programmed cell death 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 51 735[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDVENEQILN | | VNPADPDNLS | | DSLFSGDEEN | | AGTEEIKNEI | | NGNWISASSI |
NEARINAKAK | | RRLRKNSSRD | | SGRGDSVSDS | | GSDALRSGLT | | VPTSPKGRLL |
DRRSRSGKGR | | GLPKKGGAGG | | KGVWGTPGQV | | YDVEEVDVKD | | PNYDDDQENC |
VYETVVLPLD | | ERAFEKTLTP | | IIQEYFEHGD | | TNEVAEMLRD | | LNLGEMKSGV |
PVLAVSLALE | | GKASHREMTS | | KLLSDLCGTV | | MSTTDVEKSF | | DKLLKDLPEL |
ALDTPRAPQL | | VGQFIARAVG | | DGILCNTYID | | SYKGTVDCVQ | | ARAALDKATV |
LLSMSKGGKR | | KDSVWGSGGG | | QQSVNHLVKE | | IDMLLKEYLL | | SGDISEAEHC |
LKELEVPHFH | | HELVYEAIIM | | VLESTGESTF | | KMILDLLKSL | | WKSSTITVDQ |
MKRGYERIYN | | EIPDINLDVP | | HSYSVLERFV | | EECFQAGIIS | | KQLRDLCPSR |
GRKRFVSEGD | | GGRLKPESY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yoshinaga H., Matsuhashi S., Fujiyama C., Masaki Z. (1999). Novel human PDCD4 (H731) gene expressed in proliferative cells is expressed in the small duct epithelial cells of the breast as revealed by an anti-H731 antibody. Pathol. Int. 49: 1067—1077. PMID 10632927 DOI:10.1046/j.1440-1827.1999.00995.x
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Matsuhashi S., Yoshinaga H., Yatsuki H., Tsugita A., Hori K. (1997). Isolation of a novel gene from a human cell line with Pr-28 MAb which recognizes a nuclear antigen involved in the cell cycle. Res. Commun. Biochem. Cell Mol. Biol. 1: 109—120.
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8763 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q53EL6 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |