PDLIM7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2Q3G

Ідентифікатори

Символи

PDLIM7, LMP1, LMP3, PDZ and LIM domain 7

Зовнішні ІД

OMIM: 605903 MGI: 1914649 HomoloGene: 3980 GeneCards: PDLIM7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • muscle alpha-actinin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ruffle • цитоскелет • клітинне ядро • stress fiber • focal adhesion • actin cytoskeleton • гіалоплазма • Z discdkac • filamentous actin
Біологічний процес	• multicellular organism development • диференціація клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • actin cytoskeleton organization • осифікація • axon guidance • heart development • muscle structure development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9260


67399

Ensembl


ENSG00000196923


ENSMUSG00000021493

UniProt


Q9NR12


Q3TJD7

RefSeq (мРНК)


NM_005451 NM_203352 NM_203353 NM_213636


NM_001114087 NM_001114088 NM_026131

RefSeq (білок)


NP_005442 NP_976227 NP_998801


NP_001107559 NP_001107560 NP_080407

Локус (UCSC)

Хр. 5: 177.48 – 177.5 Mb

Хр. 13: 55.64 – 55.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDLIM7 (англ. PDZ and LIM domain 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 49 845^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSFKVVLEG	PAPWGFRLQG	GKDFNVPLSI	SRLTPGGKAA	QAGVAVGDWV
LSIDGENAGS	LTHIEAQNKI	RACGERLSLG	LSRAQPVQSK	PQKASAPAAD
PPRYTFAPSV	SLNKTARPFG	APPPADSAPQ	QNGQPLRPLV	PDASKQRLME
NTEDWRPRPG	TGQSRSFRIL	AHLTGTEFMQ	DPDEEHLKKS	SQVPRTEAPA
PASSTPQEPW	PGPTAPSPTS	RPPWAVDPAF	AERYAPDKTS	TVLTRHSQPA
TPTPLQSRTS	IVQAAAGGVP	GGGSNNGKTP	VCHQCHKVIR	GRYLVALGHA
YHPEEFVCSQ	CGKVLEEGGF	FEEKGAIFCP	PCYDVRYAPS	CAKCKKKITG
EIMHALKMTW	HVHCFTCAAC	KTPIRNRAFY	MEEGVPYCER	DYEKMFGTKC
HGCDFKIDAG	DRFLEALGFS	WHDTCFVCAI	CQINLEGKTF	YSKKDRPLCK
SHAFSHV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як остеогенез, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Liu Y., Hair G.A., Boden S.D., Viggeswarapu M., Titus L. (2002). Overexpressed LIM mineralization proteins do not require LIM domains to induce bone. J. Bone Miner. Res. 17: 406—414. PMID 11874232 DOI:10.1359/jbmr.2002.17.3.406
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Durick K., Gill G.N., Taylor S.S. (1998). Shc and Enigma are both required for mitogenic signaling by Ret/ptc2. Mol. Cell. Biol. 18: 2298—2308. PMID 9528800 DOI:10.1128/MCB.18.4.2298
Guy P.M., Kenny D.A., Gill G.N. (1999). The PDZ domain of the LIM protein enigma binds to beta-tropomyosin. Mol. Biol. Cell. 10: 1973—1984. PMID 10359609 DOI:10.1091/mbc.10.6.1973
Wu R.-Y., Gill G.N. (1994). LIM domain recognition of a tyrosine-containing tight turn. J. Biol. Chem. 269: 25085—25090. PMID 7929196

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22958 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NR12 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.