PDLIM7 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDLIM7, LMP1, LMP3, PDZ and LIM domain 7 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605903 MGI: 1914649 HomoloGene: 3980 GeneCards: PDLIM7 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • muscle alpha-actinin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ruffle • цитоскелет • клітинне ядро • stress fiber • focal adhesion • actin cytoskeleton • гіалоплазма • Z discdkac • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • диференціація клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • actin cytoskeleton organization • осифікація • axon guidance • heart development • muscle structure development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3d/PBB_GE_PDLIM7_203370_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDLIM7_203370_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/54/PBB_GE_PDLIM7_203369_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDLIM7_203369_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/19/PBB_GE_PDLIM7_214266_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDLIM7_214266_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005451 NM_203352 NM_203353 NM_213636 |
| | NM_001114087 NM_001114088 NM_026131 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_005442 NP_976227 NP_998801 |
| | NP_001107559 NP_001107560 NP_080407 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 177.48 – 177.5 Mb | Хр. 13: 55.64 – 55.66 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDLIM7 (англ. PDZ and LIM domain 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 49 845[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSFKVVLEG | | PAPWGFRLQG | | GKDFNVPLSI | | SRLTPGGKAA | | QAGVAVGDWV |
LSIDGENAGS | | LTHIEAQNKI | | RACGERLSLG | | LSRAQPVQSK | | PQKASAPAAD |
PPRYTFAPSV | | SLNKTARPFG | | APPPADSAPQ | | QNGQPLRPLV | | PDASKQRLME |
NTEDWRPRPG | | TGQSRSFRIL | | AHLTGTEFMQ | | DPDEEHLKKS | | SQVPRTEAPA |
PASSTPQEPW | | PGPTAPSPTS | | RPPWAVDPAF | | AERYAPDKTS | | TVLTRHSQPA |
TPTPLQSRTS | | IVQAAAGGVP | | GGGSNNGKTP | | VCHQCHKVIR | | GRYLVALGHA |
YHPEEFVCSQ | | CGKVLEEGGF | | FEEKGAIFCP | | PCYDVRYAPS | | CAKCKKKITG |
EIMHALKMTW | | HVHCFTCAAC | | KTPIRNRAFY | | MEEGVPYCER | | DYEKMFGTKC |
HGCDFKIDAG | | DRFLEALGFS | | WHDTCFVCAI | | CQINLEGKTF | | YSKKDRPLCK |
SHAFSHV |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як остеогенез, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Liu Y., Hair G.A., Boden S.D., Viggeswarapu M., Titus L. (2002). Overexpressed LIM mineralization proteins do not require LIM domains to induce bone. J. Bone Miner. Res. 17: 406—414. PMID 11874232 DOI:10.1359/jbmr.2002.17.3.406
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Durick K., Gill G.N., Taylor S.S. (1998). Shc and Enigma are both required for mitogenic signaling by Ret/ptc2. Mol. Cell. Biol. 18: 2298—2308. PMID 9528800 DOI:10.1128/MCB.18.4.2298
- Guy P.M., Kenny D.A., Gill G.N. (1999). The PDZ domain of the LIM protein enigma binds to beta-tropomyosin. Mol. Biol. Cell. 10: 1973—1984. PMID 10359609 DOI:10.1091/mbc.10.6.1973
- Wu R.-Y., Gill G.N. (1994). LIM domain recognition of a tyrosine-containing tight turn. J. Biol. Chem. 269: 25085—25090. PMID 7929196
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22958 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NR12 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |