PDZRN3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UHP, 1WH1

Ідентифікатори

Символи

PDZRN3, LNX3, SEMACAP3, SEMCAP3, PDZ domain containing ring finger 3

Зовнішні ІД

OMIM: 609729 MGI: 1933157 HomoloGene: 10328 GeneCards: PDZRN3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• neuromuscular junction • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • цитоплазма • міжклітинні контакти • синапс
Біологічний процес	• neuromuscular junction development • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23024


55983

Ensembl


ENSG00000121440


ENSMUSG00000035357

UniProt


Q9UPQ7


Q69ZS0

RefSeq (мРНК)


NM_015009 NM_001303139 NM_001303140 NM_001303141 NM_001303142


NM_018884

RefSeq (білок)


NP_001290068 NP_001290069 NP_001290070 NP_001290071 NP_055824


NP_061372

Локус (UCSC)

Хр. 3: 73.38 – 73.62 Mb

Хр. 6: 101.13 – 101.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDZRN3 (англ. PDZ domain containing ring finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот, а молекулярна маса — 119 596^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGFELDRFDG	DVDPDLKCAL	CHKVLEDPLT	TPCGHVFCAG	CVLPWVVQEG
SCPARCRGRL	SAKELNHVLP	LKRLILKLDI	KCAYATRGCG	RVVKLQQLPE
HLERCDFAPA	RCRHAGCGQV	LLRRDVEAHM	RDACDARPVG	RCQEGCGLPL
THGEQRAGGH	CCARALRAHN	GALQARLGAL	HKALKKEALR	AGKREKSLVA
QLAAAQLELQ	MTALRYQKKF	TEYSARLDSL	SRCVAAPPGG	KGEETKSLTL
VLHRDSGSLG	FNIIGGRPSV	DNHDGSSSEG	IFVSKIVDSG	PAAKEGGLQI
HDRIIEVNGR	DLSRATHDQA	VEAFKTAKEP	IVVQVLRRTP	RTKMFTPPSE
SQLVDTGTQT	DITFEHIMAL	TKMSSPSPPV	LDPYLLPEEH	PSAHEYYDPN
DYIGDIHQEM	DREELELEEV	DLYRMNSQDK	LGLTVCYRTD	DEDDIGIYIS
EIDPNSIAAK	DGRIREGDRI	IQINGIEVQN	REEAVALLTS	EENKNFSLLI
ARPELQLDEG	WMDDDRNDFL	DDLHMDMLEE	QHHQAMQFTA	SVLQQKKHDE
DGGTTDTATI	LSNQHEKDSG	VGRTDESTRN	DESSEQENNG	DDATASSNPL
AGQRKLTCSQ	DTLGSGDLPF	SNESFISADC	TDADYLGIPV	DECERFRELL
ELKCQVKSAT	PYGLYYPSGP	LDAGKSDPES	VDKELELLNE	ELRSIELECL
SIVRAHKMQQ	LKEQYRESWM	LHNSGFRNYN	TSIDVRRHEL	SDITELPEKS
DKDSSSAYNT	GESCRSTPLT	LEISPDNSLR	RAAEGISCPS	SEGAVGTTEA
YGPASKNLLS	ITEDPEVGTP	TYSPSLKELD	PNQPLESKER	RASDGSRSPT
PSQKLGSAYL	PSYHHSPYKH	AHIPAHAQHY	QSYMQLIQQK	SAVEYAQSQM
SLVSMCKDLS	SPTPSEPRME	WKVKIRSDGT	RYITKRPVRD	RLLRERALKI
REERSGMTTD	DDAVSEMKMG	RYWSKEERKQ	HLVKAKEQRR	RREFMMQSRL
DCLKEQQAAD	DRKEMNILEL	SHKKMMKKRN	KKIFDNWMTI	QELLTHGTKS
PDGTRVYNSF	LSVTTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of PDZRN3 and PDZRN4 genes in silico. Int. J. Mol. Med. 13: 607—613. PMID 15010864

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17704 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UPQ7 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.