PHAX |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PHAX, RNUXA, phosphorylated adaptor for RNA export |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604924 MGI: 1891839 HomoloGene: 10558 GeneCards: PHAX |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • toxic substance binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • Тільце Кахаля • клітинне ядро • гіалоплазма • neuronal cell body • цитоплазма • центросома |
---|
Біологічний процес | • protein transport • snRNA export from nucleus • snRNA transcription by RNA polymerase II • nuclear export |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 126.6 – 126.63 Mb | Хр. 18: 56.7 – 56.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PHAX (англ. Phosphorylated adaptor for RNA export) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 394 амінокислот, а молекулярна маса — 44 403[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALEVGDMED | | GQLSDSDSDM | | TVAPSDRPLQ | | LPKVLGGDSA | | MRAFQNTATA |
CAPVSHYRAV | | ESVDSSEESF | | SDSDDDSCLW | | KRKRQKCFNP | | PPKPEPFQFG |
QSSQKPPVAG | | GKKINNIWGA | | VLQEQNQDAV | | ATELGILGME | | GTIDRSRQSE |
TYNYLLAKKL | | RKESQEHTKD | | LDKELDEYMH | | GGKKMGSKEE | | ENGQGHLKRK |
RPVKDRLGNR | | PEMNYKGRYE | | ITAEDSQEKV | | ADEISFRLQE | | PKKDLIARVV |
RIIGNKKAIE | | LLMETAEVEQ | | NGGLFIMNGS | | RRRTPGGVFL | | NLLKNTPSIS |
EEQIKDIFYI | | ENQKEYENKK | | AARKRRTQVL | | GKKMKQAIKS | | LNFQEDDDTS |
RETFASDTNE | | ALASLDESQE | | GHAEAKLEAE | | EAIEVDHSHD | | LDIF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Segref A., Mattaj I.W., Ohno M. (2001). The evolutionarily conserved region of the U snRNA export mediator PHAX is a novel RNA-binding domain that is essential for U snRNA export. RNA. 7: 351—360. PMID 11333016 DOI:10.1017/S1355838201002278
- Mourao A., Varrot A., Mackereth C.D., Cusack S., Sattler M. (2010). Structure and RNA recognition by the snRNA and snoRNA transport factor PHAX. RNA. 16: 1205—1216. PMID 20430857 DOI:10.1261/rna.2009910
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10241 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H814 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |