PHAX : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PHAX

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XC7

Ідентифікатори

Символи

PHAX, RNUXA, phosphorylated adaptor for RNA export

Зовнішні ІД

OMIM: 604924 MGI: 1891839 HomoloGene: 10558 GeneCards: PHAX

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • toxic substance binding • RNA binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • Тільце Кахаля • клітинне ядро • гіалоплазма • neuronal cell body • цитоплазма • центросома
Біологічний процес	• protein transport • snRNA export from nucleus • snRNA transcription by RNA polymerase II • nuclear export
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51808


56698

Ensembl


ENSG00000164902


ENSMUSG00000008301

UniProt


Q9H814


Q9JJT9

RefSeq (мРНК)


NM_032177


NM_001162989 NM_019996

RefSeq (білок)


NP_115553


NP_001156461 NP_064380

Локус (UCSC)

Хр. 5: 126.6 – 126.63 Mb

Хр. 18: 56.7 – 56.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PHAX (англ. Phosphorylated adaptor for RNA export) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 394 амінокислот, а молекулярна маса — 44 403^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALEVGDMED	GQLSDSDSDM	TVAPSDRPLQ	LPKVLGGDSA	MRAFQNTATA
CAPVSHYRAV	ESVDSSEESF	SDSDDDSCLW	KRKRQKCFNP	PPKPEPFQFG
QSSQKPPVAG	GKKINNIWGA	VLQEQNQDAV	ATELGILGME	GTIDRSRQSE
TYNYLLAKKL	RKESQEHTKD	LDKELDEYMH	GGKKMGSKEE	ENGQGHLKRK
RPVKDRLGNR	PEMNYKGRYE	ITAEDSQEKV	ADEISFRLQE	PKKDLIARVV
RIIGNKKAIE	LLMETAEVEQ	NGGLFIMNGS	RRRTPGGVFL	NLLKNTPSIS
EEQIKDIFYI	ENQKEYENKK	AARKRRTQVL	GKKMKQAIKS	LNFQEDDDTS
RETFASDTNE	ALASLDESQE	GHAEAKLEAE	EAIEVDHSHD	LDIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Segref A., Mattaj I.W., Ohno M. (2001). The evolutionarily conserved region of the U snRNA export mediator PHAX is a novel RNA-binding domain that is essential for U snRNA export. RNA. 7: 351—360. PMID 11333016 DOI:10.1017/S1355838201002278
Mourao A., Varrot A., Mackereth C.D., Cusack S., Sattler M. (2010). Structure and RNA recognition by the snRNA and snoRNA transport factor PHAX. RNA. 16: 1205—1216. PMID 20430857 DOI:10.1261/rna.2009910

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10241 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H814 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.