| PICALM |
|---|
 |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | PICALM, CALM, CLTH, LAP, phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 603025 MGI: 2385902 HomoloGene: 111783 GeneCards: PICALM |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| хвороба Альцгеймера[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • clathrin heavy chain binding
• clathrin adaptor activity
• clathrin binding
• 1-phosphatidylinositol binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• phospholipid binding
• cadherin binding
• SNARE binding
• amyloid-beta binding
• phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
• tau protein binding
• low-density lipoprotein particle receptor binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • clathrin coat of coated pit
• комплекс Ґольджі
• postsynaptic membrane
• мембрана
• neurofibrillary tangle
• neuronal cell body
• clathrin-coated pit
• AP-2 adaptor complex
• presynaptic membrane
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• клітинне ядро
• clathrin-coated vesicle
• внутрішньоклітинний
• везикула
• perinuclear region of cytoplasm
• гіалоплазма
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• early endosome
• клітинна мембрана
• cell surface
• intrinsic component of membrane
• clathrin-coated endocytic vesicle
• endosome to plasma membrane transport vesicle
• Синаптичні бульбашки
• extrinsic component of presynaptic endocytic zone membrane
|
|---|
| Біологічний процес | • regulation of endocytosis
• ендоцитоз
• iron ion homeostasis
• receptor internalization
• positive regulation of neuron death
• regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process
• negative regulation of gene expression
• regulation of protein localization
• negative regulation of receptor-mediated endocytosis
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• endosomal transport
• clathrin coat assembly
• проліферація
• vesicle-mediated transport
• аксоноґенеза
• кровотворення
• clathrin-dependent endocytosis
• negative regulation of metalloendopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process
• synaptic vesicle maturation
• positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process
• vesicle cargo loading
• рецептор-опосередкований ендоцитоз
• dendrite morphogenesis
• positive regulation of amyloid-beta formation
• membrane organization
• iron ion import across plasma membrane
• vesicle budding from membrane
• learning or memory
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• GO:0034622 protein-containing complex assembly
• regulation of vesicle size
• membrane bending
• amyloid-beta clearance by transcytosis
• regulation of amyloid-beta formation
• negative regulation of protein localization to plasma membrane
• clathrin-coated pit assembly
• negative regulation of protein localization to cell surface
• synaptic vesicle budding from presynaptic endocytic zone membrane
• synaptic vesicle endocytosis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_001008660
NM_001206946
NM_001206947
NM_007166 |
| NM_001252520
NM_001252521
NM_001252522
NM_001252523
NM_001252524
| NM_146194
NM_001360867 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001008660
NP_001193875
NP_001193876
NP_009097
NP_001008660.1 |
| NP_001239449
NP_001239450
NP_001239451
NP_001239452
NP_001239453
| NP_666306
NP_001347796 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 11: 85.96 – 86.07 Mb | Хр. 7: 89.78 – 89.86 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PICALM (англ. Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 652 амінокислот, а молекулярна маса — 70 755[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MSGQSLTDRI | | TAAQHSVTGS | | AVSKTVCKAT | | THEIMGPKKK | | HLDYLIQCTN |
| EMNVNIPQLA | | DSLFERTTNS | | SWVVVFKSLI | | TTHHLMVYGN | | ERFIQYLASR |
| NTLFNLSNFL | | DKSGLQGYDM | | STFIRRYSRY | | LNEKAVSYRQ | | VAFDFTKVKR |
| GADGVMRTMN | | TEKLLKTVPI | | IQNQMDALLD | | FNVNSNELTN | | GVINAAFMLL |
| FKDAIRLFAA | | YNEGIINLLE | | KYFDMKKNQC | | KEGLDIYKKF | | LTRMTRISEF |
| LKVAEQVGID | | RGDIPDLSQA | | PSSLLDALEQ | | HLASLEGKKI | | KDSTAASRAT |
| TLSNAVSSLA | | STGLSLTKVD | | EREKQAALEE | | EQARLKALKE | | QRLKELAKKP |
| HTSLTTAASP | | VSTSAGGIMT | | APAIDIFSTP | | SSSNSTSKLP | | NDLLDLQQPT |
| FHPSVHPMST | | ASQVASTWGD | | PFSATVDAVD | | DAIPSLNPFL | | TKSSGDVHLS |
| ISSDVSTFTT | | RTPTHEMFVG | | FTPSPVAQPH | | PSAGLNVDFE | | SVFGNKSTNV |
| IVDSGGFDEL | | GGLLKPTVAS | | QNQNLPVAKL | | PPSKLVSDDL | | DSSLANLVGN |
| LGIGNGTTKN | | DVNWSQPGEK | | KLTGGSNWQP | | KVAPTTAWNA | | ATMAPPVMAY |
| PATTPTGMIG | | YGIPPQMGSV | | PVMTQPTLIY | | SQPVMRPPNP | | FGPVSGAQIQ |
| FM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tebar F., Bohlander S.K., Sorkin A. (1999). Clathrin assembly lymphoid myeloid leukemia (CALM) protein: localization in endocytic-coated pits, interactions with clathrin, and the impact of overexpression on clathrin-mediated traffic. Mol. Biol. Cell. 10: 2687—2702. PMID 10436022 DOI:10.1091/mbc.10.8.2687
- Archangelo L.F., Glaesner J., Krause A., Bohlander S.K. (2006). The novel CALM interactor CATS influences the subcellular localization of the leukemogenic fusion protein CALM/AF10. Oncogene. 25: 4099—4109. PMID 16491119 DOI:10.1038/sj.onc.1209438
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PICALM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15514 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13492 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
