PICALM |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/58/Protein_PICALM_PDB_1hf8.png/250px-Protein_PICALM_PDB_1hf8.png) |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PICALM, CALM, CLTH, LAP, phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603025 MGI: 2385902 HomoloGene: 111783 GeneCards: PICALM |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хвороба Альцгеймера[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • clathrin heavy chain binding • clathrin adaptor activity • clathrin binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • cadherin binding • SNARE binding • amyloid-beta binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • tau protein binding • low-density lipoprotein particle receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • clathrin coat of coated pit • комплекс Ґольджі • postsynaptic membrane • мембрана • neurofibrillary tangle • neuronal cell body • clathrin-coated pit • AP-2 adaptor complex • presynaptic membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • clathrin-coated vesicle • внутрішньоклітинний • везикула • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • early endosome • клітинна мембрана • cell surface • intrinsic component of membrane • clathrin-coated endocytic vesicle • endosome to plasma membrane transport vesicle • Синаптичні бульбашки • extrinsic component of presynaptic endocytic zone membrane |
---|
Біологічний процес | • regulation of endocytosis • ендоцитоз • iron ion homeostasis • receptor internalization • positive regulation of neuron death • regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • negative regulation of gene expression • regulation of protein localization • negative regulation of receptor-mediated endocytosis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • endosomal transport • clathrin coat assembly • проліферація • vesicle-mediated transport • аксоноґенеза • кровотворення • clathrin-dependent endocytosis • negative regulation of metalloendopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • synaptic vesicle maturation • positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • vesicle cargo loading • рецептор-опосередкований ендоцитоз • dendrite morphogenesis • positive regulation of amyloid-beta formation • membrane organization • iron ion import across plasma membrane • vesicle budding from membrane • learning or memory • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0034622 protein-containing complex assembly • regulation of vesicle size • membrane bending • amyloid-beta clearance by transcytosis • regulation of amyloid-beta formation • negative regulation of protein localization to plasma membrane • clathrin-coated pit assembly • negative regulation of protein localization to cell surface • synaptic vesicle budding from presynaptic endocytic zone membrane • synaptic vesicle endocytosis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9d/PBB_GE_PICALM_212506_at_fs.png/250px-PBB_GE_PICALM_212506_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/19/PBB_GE_PICALM_215236_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PICALM_215236_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/37/PBB_GE_PICALM_212511_at_fs.png/250px-PBB_GE_PICALM_212511_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001008660 NM_001206946 NM_001206947 NM_007166 |
| NM_001252520 NM_001252521 NM_001252522 NM_001252523 NM_001252524
| NM_146194 NM_001360867 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001008660 NP_001193875 NP_001193876 NP_009097 NP_001008660.1 |
| NP_001239449 NP_001239450 NP_001239451 NP_001239452 NP_001239453
| NP_666306 NP_001347796 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 85.96 – 86.07 Mb | Хр. 7: 89.78 – 89.86 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PICALM (англ. Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 652 амінокислот, а молекулярна маса — 70 755[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGQSLTDRI | | TAAQHSVTGS | | AVSKTVCKAT | | THEIMGPKKK | | HLDYLIQCTN |
EMNVNIPQLA | | DSLFERTTNS | | SWVVVFKSLI | | TTHHLMVYGN | | ERFIQYLASR |
NTLFNLSNFL | | DKSGLQGYDM | | STFIRRYSRY | | LNEKAVSYRQ | | VAFDFTKVKR |
GADGVMRTMN | | TEKLLKTVPI | | IQNQMDALLD | | FNVNSNELTN | | GVINAAFMLL |
FKDAIRLFAA | | YNEGIINLLE | | KYFDMKKNQC | | KEGLDIYKKF | | LTRMTRISEF |
LKVAEQVGID | | RGDIPDLSQA | | PSSLLDALEQ | | HLASLEGKKI | | KDSTAASRAT |
TLSNAVSSLA | | STGLSLTKVD | | EREKQAALEE | | EQARLKALKE | | QRLKELAKKP |
HTSLTTAASP | | VSTSAGGIMT | | APAIDIFSTP | | SSSNSTSKLP | | NDLLDLQQPT |
FHPSVHPMST | | ASQVASTWGD | | PFSATVDAVD | | DAIPSLNPFL | | TKSSGDVHLS |
ISSDVSTFTT | | RTPTHEMFVG | | FTPSPVAQPH | | PSAGLNVDFE | | SVFGNKSTNV |
IVDSGGFDEL | | GGLLKPTVAS | | QNQNLPVAKL | | PPSKLVSDDL | | DSSLANLVGN |
LGIGNGTTKN | | DVNWSQPGEK | | KLTGGSNWQP | | KVAPTTAWNA | | ATMAPPVMAY |
PATTPTGMIG | | YGIPPQMGSV | | PVMTQPTLIY | | SQPVMRPPNP | | FGPVSGAQIQ |
FM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tebar F., Bohlander S.K., Sorkin A. (1999). Clathrin assembly lymphoid myeloid leukemia (CALM) protein: localization in endocytic-coated pits, interactions with clathrin, and the impact of overexpression on clathrin-mediated traffic. Mol. Biol. Cell. 10: 2687—2702. PMID 10436022 DOI:10.1091/mbc.10.8.2687
- Archangelo L.F., Glaesner J., Krause A., Bohlander S.K. (2006). The novel CALM interactor CATS influences the subcellular localization of the leukemogenic fusion protein CALM/AF10. Oncogene. 25: 4099—4109. PMID 16491119 DOI:10.1038/sj.onc.1209438
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PICALM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15514 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13492 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |