PKHD1

Ідентифікатори

Символи

PKHD1, ARPKD, FCYT, TIGM1, polycystic kidney and hepatic disease 1 (autosomal recessive), fibrocystin/polyductin, FPC, PKD4, PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin

Зовнішні ІД

OMIM: 606702 MGI: 2155808 HomoloGene: 16336 GeneCards: PKHD1

Пов'язані генетичні захворювання

рак простати^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • ciliary basal body • центросома • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • веретено поділу • хромосома • apical plasma membrane • anchored component of external side of plasma membrane • perinuclear region of cytoplasm • mitotic spindle • центромера • екзосома • цитоскелет • війка
Біологічний процес	• negative regulation of protein kinase B signaling • regulation of centrosome duplication • regulation of TOR signaling • розвиток нирки • cellular calcium ion homeostasis • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of cell population proliferation • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • homeostatic process • cilium assembly • cell-cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5314


241035

Ensembl


ENSG00000170927


ENSMUSG00000043760

UniProt


P08F94


E9PZ36

RefSeq (мРНК)


NM_138694 NM_170724


NM_153179

RefSeq (білок)


NP_619639 NP_733842


NP_694819

Локус (UCSC)

Хр. 6: 51.62 – 52.09 Mb

Хр. 1: 20.13 – 20.69 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PKHD1 (англ. PKHD1, fibrocystin/polyductin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 074 амінокислот, а молекулярна маса — 446 702^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAWLISLMS	IEVLLLAVRH	LSLHIEPEEG	SLAGGTWITV	IFDGLELGVL
YPNNGSQLEI	HLVNVNMVVP	ALRSVPCDVF	PVFLDLPVVT	CRTRSVLSEA
HEGLYFLEAY	FGGQLVSSPN	PGPRDSCTFK	FSKAQTPIVH	QVYPPSGVPG
KLIHVYGWII	TGRLETFDFD	AEYIDSPVIL	EAQGDKWVTP	CSLINRQMGS
CYPIQEDHGL	GTLQCHVEGD	YIGSQNVSFS	VFNKGKSMVH	KKAWLISAKQ
DLFLYQTHSE	ILSVFPETGS	LGGRTNITIT	GDFFDNSAQV	TIAGIPCDIR
HVSPRKIECT	TRAPGKDVRL	TTPQPGNRGL	LFEVGDAVEG	LELTEATPGY
RWQIVPNASS	PFGFWSQEGQ	PFRARLSGFF	VAPETNNYTF	WIQADSQASL
HFSWSEEPRT	KVKVASISVG	TADWFDSWEQ	NRDEGTWQQK	TPKLELLGGA
MYYLEAEHHG	IAPSRGMRIG	VQIHNTWLNP	DVVTTYLREK	HQIRVRAQRL
PEVQVLNVSG	RGNFFLTWDN	VSSQPIPANA	TAHLIQTTIE	ELLAVKCKLE
PLWSNILLRL	GFERGPEVSN	SDGDLTSGTE	PFCGRFSLRQ	PRHLVLTPPA
AQKGYRLDQY	THLCLAYKGH	MNKILKMIVS	FTIGFQNMVK	NTTCDWSLTR
TSPESWQFDC	TDLWETCVRC	FGDLQPPPAN	SPVLVHQINL	LPLAQETGLF
YVDEIIIADT	NVTVSQADSG	TARPGGNLVE	SVSVVGSPPV	YSVTSWLAGC
GTELPLITAR	SVPTEGTEEG	SGLVLVTTQR	RQRTSPPLGG	HFRIQLPNTV
ISDVPVQISA	HHLHQLLQNN	ADDFTSRYLN	ASDFTVKEDL	YTCYEHVWTL
SWSTQIGDLP	NFIRVSDENL	TGVNPAAATR	VVYDGGVFLG	PIFGDMLATA
NQHTQVVVRV	NDVPAHCPGS	CSFQYLQGST	PCVHSVWYSI	DGDINLMIYI
TGTGFSGDSQ	FLQVTVNKTS	CKVIFSNQTN	VVCQTDLLPV	GMHRILMLVR
PSGLAISATG	EDLFLNVKPR	LDMVEPSRAA	DIGGLWATIR	GSSLEGVSLI
LFGSYSCAIN	VATSNSSRIQ	CKVPPRGKDG	RIVNVTVIRG	DYSAVLPRAF
TYVSSLNPVI	VTLSRNISNI	AGGETLVIGV	ARLMNYTDLD	VEVHVQDALA
PVHTQSAWGL	EVALPPLPAG	LHRISVSING	VSIHSQGVDL	HIQYLTEVFS
IEPCCGSLLG	GTILSISGIG	FSRDPALVWV	LVGNRSCDIV	NLTEASIWCE
TLPAPQIPDA	GAPTVPAAVE	VWAGNRFFAR	GPSPSLVGKG	FTFMYEAAAT
PVVTAMQGEI	TNSSLSLHVG	GSNLSNSVIL	LGNLNCDVET	QSFQGNVSLS
GCSIPLHSLE	AGIYPLQVRQ	KQMGFANMSV	VLQQFAVMPR	IMAIFPSQGS
ACGGTILTVR	GLLLNSRRRS	VRVDLSGPFT	CVILSLGDHT	ILCQVSLEGD
PLPGASFSLN	VTVLVNGLTS	ECQGNCTLFI	REEASPVMDA	LSTNTSGSLT
TVLIRGQRLA	TTADEPMVFV	DDQLPCNVTF	FNASHVVCQT	RDLAPGPHYL
SVFYTRNGYA	CSGNVSRHFY	IMPQVFHYFP	KNFSLHGGSL	LTIEGTGLRG
QNTTSVYIDQ	QTCLTVNIGA	ELIRCIVPTG	NGSVALEIEV	DGLWYHIGVI
GYNKAFTPEL	ISISQSDDIL	TFAVAQISGA	ANIDIFIGMS	PCVGVSGNHT
VLQCVVPSLP	AGEYHVRGYD	CIRGWASSAL	VFTSRVIITA	VTENFGCLGG
RLVHVFGAGF	SPGNVSAAVC	GAPCRVLANA	TVSAFSCLVL	PLDVSLAFLC
GLKREEDSCE	AARHTYVQCD	LTVAMATEQL	LESWPYLYIC	EESSQCLFVP
DHWAESMFPS	FSGLFISPKL	ERDEVLIYNS	SCNITMETEA	EMECETPNQP
ITVKITEIRK	RWGQNTQGNF	SLQFCRRWSR	THSWFPERLP	QDGDNVTVEN
GQLLLLDTNT	SILNLLHIKG	GKLIFMAPGP	IELRAHAILV	SDGGELRIGS
EDKPFQGRAQ	ITLYGSSYST	PFFPYGVKFL	AVRNGTLSLH	GSLPEVIVTC
LRATAHALDT	VLALEDAVDW	NPGDEVVIIS	GTGVKGAKPM	EEIVTVETVQ
DTDLYLKSPL	RYSHNFTENW	VAGEHHILKA	TVALLSRSIT	IQGNLTNERE
KLLVSCQEAN	APEGNLQHCL	YSMSEKMLGS	RDMGARVIVQ	SFPEEPSQVQ
LKGVQFQVLG	QAFHKHLSSL	TLVGAMRESF	IQGCTVRNSF	SRGLSMCGTL
GLKVDSNVFY	NILGHALLVG	TCTEMRYISW	EAIHGRKDDW	SGHGNIIRNN
VIIQVSGAEG	LSNPEMLTPS	GIYICSPTNV	IEGNRVCGAG	YGYFFHLMTN
QTSQAPLLSF	TQNIAHSCTR	YGLFVYPKFQ	PPWDNVTGTT	LFQSFTVWES
AGGAQIFRSS	NLRLKNFKVY	SCRDFGIDVL	ESDANTSVTD	SLLLGHFAHK
GSLCMSSGIK	TPKRWELMVS	NTTFVNFDLI	NCVAIRTCSD	CSQGQGGFTV
KTSQLKFTNS	SNLVAFPFPH	AAILEDLDGS	LSGKNRSHIL	ASMETLSASC
LVNSSFGRVV	HGSACGGGVL	FHRMSIGLAN	TPEVSYDLTM	TDSRNKTTTV
NYVRDTLSNP	RGWMALLLDQ	ETYSLQSENL	WINRSLQYSA	TFDNFAPGNY
LLLVHTDLPP	YPDILLRCGS	RVGLSFPFLP	SPGQNQGCDW	FFNSQLRQLT
YLVSGEGQVQ	VILRVKEGMP	PTISASTSAP	ESALKWSLPE	TWQGVEEGWG
GYNNTIPGPG	DDVLILPNRT	VLVDTDLPFF	KGLYVMGTLD	FPVDRSNVLS
VACMVIAGGE	LKVGTLENPL	EKEQKLLILL	RASEGVFCDR	MNGIHIDPGT
IGVYGKVHLY	SAYPKNSWTH	LGADIASGNE	RIIVEDAVDW	RPHDKIVLSS
SSYEPHEAEV	LTVKEVKGHH	VRIYERLKHR	HIGSVHVTED	GRHIRLAAEV
GLLTRNIQIQ	PDVSCRGRLF	VGSFRKSSRE	EFSGVLQLLN	VEIQNFGSPL
YSSVEFSNVS	AGSWIISSTL	HQSCGGGIHA	AASHGVLLND	NIVFGTAGHG
IDLEGQAYTV	TNNLVVLMTQ	PAWSTIWVAG	IKVNQVKDIN	LHGNVVAGSE
RLGFHIRGHK	CSSCELLWSD	NVAHSSLHGL	HLYKESGLDN	CTRISGFLAF
KNFDYGAMLH	VENSVEIENI	TLVDNTIGLL	AVVYVFSAPQ	NSVKKVQIVL
RNSVIVATSS	SFDCIQDKVK	PHSANLTSTD	RAPSNPRGGR	IGILWPVFTS
EPNQWPQEPW	HKVRNDHSIS	GIMKLQDVTF	SSFVKSCYSD	DLDVCILPNA
ENSGIMHPIT	AERTRMLKIK	DKNKFYFPSL	QPRKDLGKVV	CPELDCASPR
KYLFKDLDGR	ALGLPPPVSV	FPKTEAEWTA	SFFNAGTFRE	EQKCTYQFLM
QGFICKQTDQ	VVLILDSADA	IWAIQKLYPV	VSVTSGFVDV	FSSVNANIPC
STSGSVSTFY	SILPIRQITK	VCFMDQTPQV	LRFFLLGNKS	TSKLLLAVFY
HELQSPHVFL	GESFIPPTLV	QSASLLLNES	IGANYFNIMD	NLLYVVLQGE
EPIEIRSGVS	IHLALTVMVS	VLEKGWEIVI	LERLTNFLQI	GQNQIRFIHE
MPGHEETLKA	IADSRAKRKR	NCPTVTCTSH	YRRVGQRRPL	MMEMNSHRAS
PPMTVETISK	VIVIEIGDSP	TVRSTGMISS	LSSNKLQNLA	HRVITAQQTG
VLENVLNMTI	GALLVTQSKG	VIGYGNTSSF	KTGNLIYIRP	YALSILVQPS
DGEVGNELPV	QPQLVFLDEQ	NRRVESLGPP	SEPWTISASL	EGASDSVLKG
CTQAETQDGY	VSFYNLAVLI	SGSNWHFIFT	VTSPPGVNFT	ARSKPFAVLP
VTRKEKSTII	LAASLSSVAS	WLALSCLVCC	WLKRSKSRKT	KPEEIPESQT
NNQNIHIHIS	SKRRESQGPK	KEDTVVGEDM	RMKVMLGKVN	QCPHQLMNGV
SRRKVSRHIV	REEEAAVPAP	GTTGITSHGH	ICAPGAPAQQ	VYLQETGNWK
EGQEQLLRYQ	LAGQNQLLLL	CPDFRQERQQ	LPGQSRLSKQ	SGSLGLSQEK
KASCGATEAF	CLHSVHPETI	QEQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, хромосомах, війках, центромерах.

Патологія

Мутації цього гена можуть викликати Autosomal recessive polycystic kidney disease^[en]. Ген PKHD1 кодує фіброцистин, що міститься в епітеліальних клітинах як ниркових канальців, так і жовчних проток. Мутація в PKHD1 (може бути аутосомно-рецесивною або спонтанною мутацією), що призводить до дефіциту фіброцистину, викликає характерне полікістозне розширення обох нирок^[6].

Література

Wang S., Luo Y., Wilson P.D., Witman G.B., Zhou J. (2004). The autosomal recessive polycystic kidney disease protein is localized to primary cilia, with concentration in the basal body area. J. Am. Soc. Nephrol. 15: 592—602. PMID 14978161 DOI:10.1097/01.ASN.0000113793.12558.1D

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PKHD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9016 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P08F94 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ Hiratsuka et al. "Organoid-on-a-chip model of human ARPKD reveals mechanosensing pathomechanisms for drug discovery" / Hiratsuka et al.// Sci. Adv. — 2022. — Vol.8 — P.1-16