PLSCR4 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PLSCR4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3Q5U

Ідентифікатори

Символи

PLSCR4, TRA1, phospholipid scramblase 4

Зовнішні ІД

OMIM: 607612 MGI: 2143267 HomoloGene: 23217 GeneCards: PLSCR4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding • phospholipid scramblase activity • enzyme binding • calcium ion binding • CD4 receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• cellular response to lipopolysaccharide • plasma membrane phospholipid scrambling
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57088


235527

Ensembl


ENSG00000114698


ENSMUSG00000032377

UniProt


Q9NRQ2


P58196

RefSeq (мРНК)


NM_001128304 NM_001128305 NM_001128306 NM_001177304 NM_020353


NM_178711

RefSeq (білок)


NP_001121776 NP_001121777 NP_001121778 NP_001170775 NP_065086


NP_848826

Локус (UCSC)

Хр. 3: 146.19 – 146.25 Mb

Хр. 9: 92.34 – 92.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PLSCR4 (англ. Phospholipid scramblase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 329 амінокислот, а молекулярна маса — 37 005^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGVVPTAPE	QPAGEMENQT	KPPDPRPDAP	PEYNSHFLPG	PPGTAVPPPT
GYPGGLPMGY	YSPQQPSTFP	LYQPVGGIHP	VRYQPGKYPM	PNQSVPITWM
PGPTPMANCP	PGLEYLVQLD	NIHVLQHFEP	LEMMTCFETN	NRYDIKNNSD
QMVYIVTEDT	DDFTRNAYRT	LRPFVLRVTD	CMGREIMTMQ	RPFRCTCCCF
CCPSARQELE	VQCPPGVTIG	FVAEHWNLCR	AVYSIQNEKK	ENVMRVRGPC
STYGCGSDSV	FEVKSLDGIS	NIGSIIRKWN	GLLSAMADAD	HFDIHFPLDL
DVKMKAMIFG	ACFLIDFMYF	ERSPPQRSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

Wiedmer T., Zhou Q., Kwoh D.Y., Sims P.J. (2000). Identification of three new members of the phospholipid scramblase gene family. Biochim. Biophys. Acta. 1467: 244—253. PMID 10930526 DOI:10.1016/S0005-2736(00)00236-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Francis V.G., Gummadi S.N. (2012). Biochemical and functional characterization of human phospholipid scramblase 4 (hPLSCR4). Biol. Chem. 393: 1173—1181. PMID 23089641 DOI:10.1515/hsz-2012-0129

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16497 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NRQ2 (англ.) . Архів оригіналу за 15 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.