POGZ

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E72, 2N3A

Ідентифікатори

Символи

POGZ, ZNF280E, ZNF635, ZNF635m, MRD37, WHSUS, pogo transposable element with ZNF domain, pogo transposable element derived with ZNF domain

Зовнішні ІД

OMIM: 614787 MGI: 2442117 HomoloGene: 9022 GeneCards: POGZ

Пов'язані генетичні захворювання

White-Sutton syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • хромосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • histone methyltransferase complex
Біологічний процес	• kinetochore assembly • клітинний цикл • mitotic sister chromatid cohesion • поділ клітини • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23126


229584

Ensembl


ENSG00000143442


ENSMUSG00000038902

UniProt


Q7Z3K3


Q8BZH4

RefSeq (мРНК)


NM_001194937 NM_001194938 NM_015100 NM_145796 NM_207171


NM_001165948 NM_172683 NM_001368811 NM_001368812

RefSeq (білок)


NP_001181866 NP_001181867 NP_055915 NP_665739 NP_997054


NP_001159420 NP_766271 NP_001355740 NP_001355741

Локус (UCSC)

Хр. 1: 151.4 – 151.46 Mb

Хр. 3: 94.74 – 94.79 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POGZ (англ. Pogo transposable element derived with ZNF domain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 410 амінокислот, а молекулярна маса — 155 344^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADTDLFMEC	EEEELEPWQK	ISDVIEDSVV	EDYNSVDKTT	TVSVSQQPVS
APVPIAAHAS	VAGHLSTSTT	VSSSGAQNSD	STKKTLVTLI	ANNNAGNPLV
QQGGQPLILT	QNPAPGLGTM	VTQPVLRPVQ	VMQNANHVTS	SPVASQPIFI
TTQGFPVRNV	RPVQNAMNQV	GIVLNVQQGQ	TVRPITLVPA	PGTQFVKPTV
GVPQVFSQMT	PVRPGSTMPV	RPTTNTFTTV	IPATLTIRST	VPQSQSQQTK
STPSTSTTPT	ATQPTSLGQL	AVQSPGQSNQ	TTNPKLAPSF	PSPPAVSIAS
FVTVKRPGVT	GENSNEVAKL	VNTLNTIPSL	GQSPGPVVVS	NNSSAHGSQR
TSGPESSMKV	TSSIPVFDLQ	DGGRKICPRC	NAQFRVTEAL	RGHMCYCCPE
MVEYQKKGKS	LDSEPSVPSA	AKPPSPEKTA	PVASTPSSTP	IPALSPPTKV
PEPNENVGDA	VQTKLIMLVD	DFYYGRDGGK	VAQLTNFPKV	ATSFRCPHCT
KRLKNNIRFM	NHMKHHVELD	QQNGEVDGHT	ICQHCYRQFS	TPFQLQCHLE
NVHSPYESTT	KCKICEWAFE	SEPLFLQHMK	DTHKPGEMPY	VCQVCQYRSS
LYSEVDVHFR	MIHEDTRHLL	CPYCLKVFKN	GNAFQQHYMR	HQKRNVYHCN
KCRLQFLFAK	DKIEHKLQHH	KTFRKPKQLE	GLKPGTKVTI	RASRGQPRTV
PVSSNDTPPS	ALQEAAPLTS	SMDPLPVFLY	PPVQRSIQKR	AVRKMSVMGR
QTCLECSFEI	PDFPNHFPTY	VHCSLCRYST	CCSRAYANHM	INNHVPRKSP
KYLALFKNSV	SGIKLACTSC	TFVTSVGDAM	AKHLVFNPSH	RSSSILPRGL
TWIAHSRHGQ	TRDRVHDRNV	KNMYPPPSFP	TNKAATVKSA	GATPAEPEEL
LTPLAPALPS	PASTATPPPT	PTHPQALALP	PLATEGAECL	NVDDQDEGSP
VTQEPELASG	GGGSGGVGKK	EQLSVKKLRV	VLFALCCNTE	QAAEHFRNPQ
RRIRRWLRRF	QASQGENLEG	KYLSFEAEEK	LAEWVLTQRE	QQLPVNEETL
FQKATKIGRS	LEGGFKISYE	WAVRFMLRHH	LTPHARRAVA	HTLPKDVAEN
AGLFIDFVQR	QIHNQDLPLS	MIVAIDEISL	FLDTEVLSSD	DRKENALQTV
GTGEPWCDVV	LAILADGTVL	PTLVFYRGQM	DQPANMPDSI	LLEAKESGYS
DDEIMELWST	RVWQKHTACQ	RSKGMLVMDC	HRTHLSEEVL	AMLSASSTLP
AVVPAGCSSK	IQPLDVCIKR	TVKNFLHKKW	KEQAREMADT	ACDSDVLLQL
VLVWLGEVLG	VIGDCPELVQ	RSFLVASVLP	GPDGNINSPT	RNADMQEELI
ASLEEQLKLS	GEHSESSTPR	PRSSPEETIE	PESLHQLFEG	ESETESFYGF
EEADLDLMEI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Large-scale discovery of novel genetic causes of developmental disorders. Nature. 519: 223—228. 2015. PMID 25533962 DOI:10.1038/nature14135

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з POGZ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18801 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q7Z3K3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.