POGZ |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2E72, 2N3A | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | POGZ, ZNF280E, ZNF635, ZNF635m, MRD37, WHSUS, pogo transposable element with ZNF domain, pogo transposable element derived with ZNF domain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614787 MGI: 2442117 HomoloGene: 9022 GeneCards: POGZ |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
White-Sutton syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • хромосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • histone methyltransferase complex |
---|
Біологічний процес | • kinetochore assembly • клітинний цикл • mitotic sister chromatid cohesion • поділ клітини • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bf/PBB_GE_POGZ_212153_at_fs.png/250px-PBB_GE_POGZ_212153_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001194937 NM_001194938 NM_015100 NM_145796 NM_207171 |
| | NM_001165948 NM_172683 NM_001368811 NM_001368812 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001181866 NP_001181867 NP_055915 NP_665739 NP_997054 |
| | NP_001159420 NP_766271 NP_001355740 NP_001355741 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 151.4 – 151.46 Mb | Хр. 3: 94.74 – 94.79 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
POGZ (англ. Pogo transposable element derived with ZNF domain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 410 амінокислот, а молекулярна маса — 155 344[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADTDLFMEC | | EEEELEPWQK | | ISDVIEDSVV | | EDYNSVDKTT | | TVSVSQQPVS |
APVPIAAHAS | | VAGHLSTSTT | | VSSSGAQNSD | | STKKTLVTLI | | ANNNAGNPLV |
QQGGQPLILT | | QNPAPGLGTM | | VTQPVLRPVQ | | VMQNANHVTS | | SPVASQPIFI |
TTQGFPVRNV | | RPVQNAMNQV | | GIVLNVQQGQ | | TVRPITLVPA | | PGTQFVKPTV |
GVPQVFSQMT | | PVRPGSTMPV | | RPTTNTFTTV | | IPATLTIRST | | VPQSQSQQTK |
STPSTSTTPT | | ATQPTSLGQL | | AVQSPGQSNQ | | TTNPKLAPSF | | PSPPAVSIAS |
FVTVKRPGVT | | GENSNEVAKL | | VNTLNTIPSL | | GQSPGPVVVS | | NNSSAHGSQR |
TSGPESSMKV | | TSSIPVFDLQ | | DGGRKICPRC | | NAQFRVTEAL | | RGHMCYCCPE |
MVEYQKKGKS | | LDSEPSVPSA | | AKPPSPEKTA | | PVASTPSSTP | | IPALSPPTKV |
PEPNENVGDA | | VQTKLIMLVD | | DFYYGRDGGK | | VAQLTNFPKV | | ATSFRCPHCT |
KRLKNNIRFM | | NHMKHHVELD | | QQNGEVDGHT | | ICQHCYRQFS | | TPFQLQCHLE |
NVHSPYESTT | | KCKICEWAFE | | SEPLFLQHMK | | DTHKPGEMPY | | VCQVCQYRSS |
LYSEVDVHFR | | MIHEDTRHLL | | CPYCLKVFKN | | GNAFQQHYMR | | HQKRNVYHCN |
KCRLQFLFAK | | DKIEHKLQHH | | KTFRKPKQLE | | GLKPGTKVTI | | RASRGQPRTV |
PVSSNDTPPS | | ALQEAAPLTS | | SMDPLPVFLY | | PPVQRSIQKR | | AVRKMSVMGR |
QTCLECSFEI | | PDFPNHFPTY | | VHCSLCRYST | | CCSRAYANHM | | INNHVPRKSP |
KYLALFKNSV | | SGIKLACTSC | | TFVTSVGDAM | | AKHLVFNPSH | | RSSSILPRGL |
TWIAHSRHGQ | | TRDRVHDRNV | | KNMYPPPSFP | | TNKAATVKSA | | GATPAEPEEL |
LTPLAPALPS | | PASTATPPPT | | PTHPQALALP | | PLATEGAECL | | NVDDQDEGSP |
VTQEPELASG | | GGGSGGVGKK | | EQLSVKKLRV | | VLFALCCNTE | | QAAEHFRNPQ |
RRIRRWLRRF | | QASQGENLEG | | KYLSFEAEEK | | LAEWVLTQRE | | QQLPVNEETL |
FQKATKIGRS | | LEGGFKISYE | | WAVRFMLRHH | | LTPHARRAVA | | HTLPKDVAEN |
AGLFIDFVQR | | QIHNQDLPLS | | MIVAIDEISL | | FLDTEVLSSD | | DRKENALQTV |
GTGEPWCDVV | | LAILADGTVL | | PTLVFYRGQM | | DQPANMPDSI | | LLEAKESGYS |
DDEIMELWST | | RVWQKHTACQ | | RSKGMLVMDC | | HRTHLSEEVL | | AMLSASSTLP |
AVVPAGCSSK | | IQPLDVCIKR | | TVKNFLHKKW | | KEQAREMADT | | ACDSDVLLQL |
VLVWLGEVLG | | VIGDCPELVQ | | RSFLVASVLP | | GPDGNINSPT | | RNADMQEELI |
ASLEEQLKLS | | GEHSESSTPR | | PRSSPEETIE | | PESLHQLFEG | | ESETESFYGF |
EEADLDLMEI |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Large-scale discovery of novel genetic causes of developmental disorders. Nature. 519: 223—228. 2015. PMID 25533962 DOI:10.1038/nature14135
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з POGZ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18801 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z3K3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |