POLD3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1U76, 3E0J, 2N1G

Ідентифікатори

Символи

POLD3, P66, P68, PPP1R128, polymerase (DNA) delta 3, accessory subunit, DNA polymerase delta 3, accessory subunit

Зовнішні ІД

OMIM: 611415 MGI: 1915217 HomoloGene: 38202 GeneCards: POLD3

Пов'язані генетичні захворювання

колоректальний рак^[1]

Реагує на сполуку

цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA-directed DNA polymerase activity
Клітинна компонента	• delta DNA polymerase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA synthesis involved in DNA repair • реплікація ДНК • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • telomere maintenance • DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA mismatch repair • DNA strand elongation involved in DNA replication • DNA synthesis involved in UV-damage excision repair
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10714


67967

Ensembl


ENSG00000077514


ENSMUSG00000030726

UniProt


Q15054


Q9EQ28

RefSeq (мРНК)


NM_006591 NM_001363597


NM_133692 NM_001368380

RefSeq (білок)


NP_006582 NP_001350526


NP_598453 NP_001355309

Локус (UCSC)

Хр. 11: 74.49 – 74.67 Mb

Хр. 7: 99.73 – 99.77 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLD3 (англ. DNA polymerase delta 3, accessory subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 51 400^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADQLYLENI	DEFVTDQNKI	VTYKWLSYTL	GVHVNQAKQM	LYDYVERKRK
ENSGAQLHVT	YLVSGSLIQN	GHSCHKVAVV	REDKLEAVKS	KLAVTASIHV
YSIQKAMLKD	SGPLFNTDYD	ILKSNLQNCS	KFSAIQCAAA	VPRAPAESSS
SSKKFEQSHL	HMSSETQANN	ELTTNGHGPP	ASKQVSQQPK	GIMGMFASKA
AAKTQETNKE	TKTEAKEVTN	ASAAGNKAPG	KGNMMSNFFG	KAAMNKFKVN
LDSEQAVKEE	KIVEQPTVSV	TEPKLATPAG	LKKSSKKAEP	VKVLQKEKKR
GKRVALSDDE	TKETENMRKK	RRRIKLPESD	SSEDEVFPDS	PGAYEAESPS
PPPPPSPPLE	PVPKTEPEPP	SVKSSSGENK	RKRKRVLKSK	TYLDGEGCIV
TEKVYESESC	TDSEEELNMK	TSSVHRPPAM	TVKKEPREER	KGPKKGTAAL
GKANRQVSIT	GFFQRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hughes P., Tratner I., Ducoux M., Piard K., Baldacci G. (1999). Isolation and identification of the third subunit of mammalian DNA polymerase delta by PCNA-affinity chromatography of mouse FM3A cell extracts. Nucleic Acids Res. 27: 2108—2114. PMID 10219083 DOI:10.1093/nar/27.10.2108
Mo J.-Y., Liu L., Leon A., Mazloum N., Lee M.Y.W.T. (2000). Evidence that DNA polymerase delta isolated by immunoaffinity chromatography exhibits high-molecular weight characteristics and is associated with the KIAA0039 protein and RPA. Biochemistry. 39: 7245—7254. PMID 10852724 DOI:10.1021/bi0000871
Liu L., Rodriguez-Belmonte E.M., Mazloum N., Xie B., Lee M.Y.W.T. (2003). Identification of a novel protein, PDIP38, that interacts with the p50 subunit of DNA polymerase delta and proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 278: 10041—10047. PMID 12522211 DOI:10.1074/jbc.M208694200
Liu G., Warbrick E. (2006). The p66 and p12 subunits of DNA polymerase delta are modified by ubiquitin and ubiquitin-like proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 349: 360—366. PMID 16934752 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.08.049
Meng X., Zhou Y., Lee E.Y., Lee M.Y., Frick D.N. (2010). The p12 subunit of human polymerase delta modulates the rate and fidelity of DNA synthesis. Biochemistry. 49: 3545—3554. PMID 20334433 DOI:10.1021/bi100042b

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLD3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA polymerase delta 3, accessory subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20932 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15054 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.