POLR2H

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2F3I, 5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6

Ідентифікатори

Символи

POLR2H, RPABC3, RPB17, RPB8, polymerase (RNA) II subunit H, RNA polymerase II subunit H, RNA polymerase II, I and III subunit H

Зовнішні ІД

OMIM: 606023 MGI: 2384309 HomoloGene: 4540 GeneCards: POLR2H

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • DNA binding • RNA polymerase I activity • RNA polymerase II activity • RNA polymerase III activity • single-stranded DNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • РНК-полімераза II • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase III complex • RNA polymerase I complex • protein-DNA complex
Біологічний процес	• 7-methylguanosine mRNA capping • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • mRNA splicing, via spliceosome • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription-coupled nucleotide-excision repair • termination of RNA polymerase I transcription • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription by RNA polymerase II • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase III • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • transcription, DNA-templated • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter • positive regulation of type I interferon production • somatic stem cell population maintenance • positive regulation of viral transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5437


245841

Ensembl


ENSG00000163882


ENSMUSG00000021018

UniProt


P52434


Q923G2

RefSeq (мРНК)

NM_001278698 NM_001278699 NM_001278700 NM_001278714 NM_001278715
NM_006232 NM_001346879


NM_145632 NM_001356423

RefSeq (білок)

NP_001265627 NP_001265628 NP_001265629 NP_001265643 NP_001265644
NP_001333808 NP_006223


NP_663607 NP_001343352

Локус (UCSC)

Хр. 3: 184.36 – 184.37 Mb

Хр. 16: 20.54 – 20.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLR2H (англ. RNA polymerase II subunit H) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 150 амінокислот, а молекулярна маса — 17 143^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGILFEDIF	DVKDIDPEGK	KFDRVSRLHC	ESESFKMDLI	LDVNIQIYPV
DLGDKFRLVI	ASTLYEDGTL	DDGEYNPTDD	RPSRADQFEY	VMYGKVYRIE
GDETSTEAAT	RLSAYVSYGG	LLMRLQGDAN	NLHGFEVDSR	VYLLMKKLAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

McKune K., Moore P.A., Hull M.W., Woychik N.A. (1995). Six human RNA polymerase subunits functionally substitute for their yeast counterparts. Mol. Cell. Biol. 15: 6895—6900. PMID 8524256 DOI:10.1128/MCB.15.12.6895
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9195 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P52434 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.