POM121 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | POM121, P145, POM121A, POM121 transmembrane nucleoporin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615753 MGI: 2137624 HomoloGene: 70878 GeneCards: POM121 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • nuclear localization sequence binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • nuclear envelope • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • nuclear pore central transport channel • nuclear pore nuclear basket • нуклеоплазма • ядерна мембрана • ядерна пора • host cell |
---|
Біологічний процес | • mRNA transport • protein transport • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • RNA export from nucleus • protein import into nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b8/PBB_GE_POM121_213360_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_POM121_213360_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/88/PBB_GE_POM121_212178_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_POM121_212178_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001257190 NM_172020 NM_001367610 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001244119 NP_742017 NP_001354539 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 72.88 – 72.95 Mb | Хр. 5: 135.4 – 135.42 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
POM121 (англ. POM121 transmembrane nucleoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 249 амінокислот, а молекулярна маса — 127 720[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSPAAAAAGA | | GERRRPIASV | | RDGRGRGCGG | | PARAVLLGLS | | LVGLLLYLVP |
AAAALAWLTV | | GATAAWWGLS | | REPRGSRPLS | | SFVRKARHRR | | PLSSFVRKAR |
HRRTLFASPL | | AKSTANGNLL | | EPRTLLEGPD | | PAELLLMGSY | | LGKPGPPQPA |
AAPEGQDLRD | | RPGRRPPARP | | APRSPPPRSP | | PPRSPPPSPP | | THRAHHVYPS |
LPTPLLRPSR | | RPSPRDCGTL | | PNRFVITPRR | | RYPIHQAQYS | | CLGVLPTVCW |
NGYHKKAVLS | | PRNSRMVCSP | | VTVRIAPPDR | | RFSRSAIPEQ | | IISSTLSSPS |
SNAPDPCAKE | | TVLSALKEKE | | KKRTVEEEDQ | | IFLDGQENKR | | RRHDSSGSGH |
SAFEPLVANG | | VPASFVPKPG | | SLKRGLNSQS | | SDDHLNKRSR | | SSSMSSLTGA |
YASGIPSSSR | | NAITSSYSST | | RGISQLWKRN | | GPSSSPFSSP | | ASSRSQTPER |
PAKKIREEEL | | CHHSSSSTPL | | AADRESQGEK | | AADTTPRKKQ | | NSNSQSTPGS |
SGQRKRKVQL | | LPSRRGEQLT | | LPPPPQLGYS | | ITAEDLDLEK | | KASLQWFNQA |
LEDKSDAASN | | SVTETPPITQ | | PSFTFTLPAA | | APASPPTSLL | | APSTNPLLES |
LKKMQTPPSL | | PPCPESAGAA | | TTEALSPPKT | | PSLLPPLGLS | | QSGPPGLLPS |
PSFDSKPPTT | | LLGLIPAPSM | | VPATDTKAPP | | TLQAETATKP | | QATSAPSPAP |
KQSFLFGTQN | | TSPSSPAAPA | | ASSAPPMFKP | | IFTAPPKSEK | | EGPTPPGPSV |
TATAPSSSSL | | PTTTSTTAPT | | FQPVFSSMGP | | PASVPLPAPF | | FKQTTTPATA |
PTTTAPLFTG | | LASATSAVAP | | ITSASPSTDS | | ASKPAFGFGI | | NSVSSSSVST |
TTSTATAASQ | | PFLFGAPQAS | | AASFTPAMGS | | IFQFGKPPAL | | PTTTTVTTFS |
QSLHTAVPTA | | TSSSAADFSG | | FGSTLATSAP | | ATSSQPTLTF | | SNTSTPTFNI |
PFGSSAKSPL | | PSYPGANPQP | | AFGAAEGQPP | | GAAKPALAPS | | FGSSFTFGNS |
AAPAAAPTPA | | PPSMIKVVPA | | YVPTPIHPIF | | GGATHSAFGL | | KATASAFGAP |
ASSQPAFGGS | | TAVFFGAATS | | SGFGATTQTA | | SSGSSSSVFG | | STTPSPFTFG |
GSAAPAGSGS | | FGINVATPGS | | STTTGAFSFG | | AGQSGSTATS | | TPFAGGLGQN |
ALGTTGQSTP | | FAFNVSSTTE | | SKPVFGGTAT | | PTFGLNTPAP | | GVGTSGSSLS |
FGASSAPAQG | | FVGVAPFGSA | | ALSFSIGAGS | | KTPGARQRLQ | | ARRQHTRKK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, комплексі ядерної пори.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19702 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96HA1 (англ.) . Архів оригіналу за 31 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |