POPDC2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

POPDC2

Ідентифікатори

Символи

POPDC2, POP2, popeye domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605823 MGI: 1930150 HomoloGene: 11147 GeneCards: POPDC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• молекулярна функція • cAMP binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • Сарколема • клітинна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• регуляція серцевого ритму • GO:0022610 життєдіяльність • heart development • skeletal muscle tissue development • regulation of membrane potential • striated muscle cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64091


64082

Ensembl


ENSG00000121577


ENSMUSG00000022803

UniProt


Q9HBU9


Q9ES82

RefSeq (мРНК)


NM_001308333 NM_022135 NM_001369919


NM_001081984 NM_022318

RefSeq (білок)


NP_001295262 NP_071418 NP_001356848


NP_001075453 NP_071713

Локус (UCSC)

Хр. 3: 119.64 – 119.67 Mb

Хр. 16: 38.18 – 38.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POPDC2 (англ. Popeye domain containing 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 40 448^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSANSSRVGQ	LLLQGSACIR	WKQDVEGAVY	HLANCLLLLG	FMGGSGVYGC
FYLFGFLSAG	YLCCVLWGWF	SACGLDIVLW	SFLLAVVCLL	QLAHLVYRLR
EDTLPEEFDL	LYKTLCLPLQ	VPLQTYKEIV	HCCEEQVLTL	ATEQTYAVEG
ETPINRLSLL	LSGRVRVSQD	GQFLHYIFPY	QFMDSPEWES	LQPSEEGVFQ
VTLTAETSCS	YISWPRKSLH	LLLTKERYIS	CLFSALLGYD	ISEKLYTLND
KLFAKFGLRF	DIRLPSLYHV	LGPTAADAGP	ESEKGDEEVC	EPAVSPPQAT
PTSLQQTPPC	STPPATTNFP	APPTRARLSR	PDSGILASRI	PLQSYSQVIS
RGQAPLAPTH	TPEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17648 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HBU9 (англ.) . Архів оригіналу за 25 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.