PPFIA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PPFIA1, LIP.1, LIP1, LIPRIN, PTPRF interacting protein alpha 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611054 MGI: 1924750 HomoloGene: 20802 GeneCards: PPFIA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity |
---|
Клітинна компонента | • presynaptic active zone • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • аксон • дендрит (нейробіологія) • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • cell-matrix adhesion • negative regulation of stress fiber assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of protein localization to plasma membrane • GO:0010554 neurotransmitter secretion • glutamate secretion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/56/PBB_GE_PPFIA1_202066_at_fs.png/250px-PBB_GE_PPFIA1_202066_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6f/PBB_GE_PPFIA1_210235_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PPFIA1_210235_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/74/PBB_GE_PPFIA1_202065_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PPFIA1_202065_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000131626 ENSG00000288198 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_003626 NM_177423 NM_001378006 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_003617 NP_803172 NP_001364935 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 70.27 – 70.39 Mb | Хр. 7: 144.03 – 144.11 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PPFIA1 (англ. PTPRF interacting protein alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 202 амінокислот, а молекулярна маса — 135 779[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMCEVMPTIS | | EAEGPPGGGG | | GHGSGSPSQP | | DADSHFEQLM | | VSMLEERDRL |
LDTLRETQET | | LALTQGKLHE | | VGHERDSLQR | | QLNTALPQEF | | AALTKELNVC |
REQLLEREEE | | IAELKAERNN | | TRLLLEHLEC | | LVSRHERSLR | | MTVVKRQAQS |
PAGVSSEVEV | | LKALKSLFEH | | HKALDEKVRE | | RLRVALERCS | | LLEEELGATH |
KELMILKEQN | | NQKKTLTDGV | | LDINHEQENT | | PSTSGKRSSD | | GSLSHEEDLA |
KVIELQEIIS | | KQSREQSQMK | | ERLASLSSHV | | TELEEDLDTA | | RKDLIKSEEM |
NTKLQRDVRE | | AMAQKEDMEE | | RITTLEKRYL | | AAQREATSVH | | DLNDKLENEI |
ANKDSMHRQT | | EDKNRQLQER | | LELAEQKLQQ | | TLRKAETLPE | | VEAELAQRVA |
ALSKAEERHG | | NIEERLRQME | | AQLEEKNQEL | | QRARQREKMN | | EEHNKRLSDT |
VDKLLSESNE | | RLQLHLKERM | | AALEDKNSLL | | REVESAKKQL | | EETQHDKDQL |
VLNIEALRAE | | LDHMRLRGAS | | LHHGRPHLGS | | VPDFRFPMAD | | GHTDSYSTSA |
VLRRPQKGRL | | AALRDEPSKV | | QTLNEQDWER | | AQQASVLANV | | AQAFESDADV |
SDGEDDRDTL | | LSSVDLLSPS | | GQADAHTLAM | | MLQEQLDAIN | | KEIRLIQEEK |
ENTEQRAEEI | | ESRVGSGSLD | | NLGRFRSMSS | | IPPYPASSLA | | SSSPPGSGRS |
TPRRIPHSPA | | REVDRLGVMT | | LLPPSREEVR | | DDKTTIKCET | | SPPSSPRALR |
LDRLHKGALH | | TVSHEDIRDI | | RNSTGSQDGP | | VSNPSSSNSS | | QDSLHKAPKK |
KGIKSSIGRL | | FGKKEKGRPG | | QTGKEALGQA | | GVSETDNSSQ | | DALGLSKLGG |
QAEKNRKLQK | | KHELLEEARR | | QGLPFAQWDG | | PTVVVWLELW | | VGMPAWYVAA |
CRANVKSGAI | | MSALSDTEIQ | | REIGISNPLH | | RLKLRLAIQE | | IMSLTSPSAP |
PTSRTTLAYG | | DMNHEWIGNE | | WLPSLGLPQY | | RSYFMECLVD | | ARMLDHLTKK |
DLRGQLKMVD | | SFHRNSFQCG | | IMCLRRLNYD | | RKELERKREE | | SQSEIKDVLV |
WSNDRVIRWI | | LSIGLKEYAN | | NLIESGVHGA | | LLALDETFDF | | SALALLLQIP |
TQNTQARAVL | | EREFNNLLVM | | GTDRRFDEDD | | DKSFRRAPSW | | RKKFRPKDIR |
GLAAGSAETL | | PANFRVTSSM | | SSPSMQPKKM | | QMDGNVSGTQ | | RLDSATVRTY |
SC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pulido R., Serra-Pages C., Tang M., Streuli M. (1995). The LAR/PTP delta/PTP sigma subfamily of transmembrane protein-tyrosine-phosphatases: multiple human LAR, PTP delta, and PTP sigma isoforms are expressed in a tissue-specific manner and associate with the LAR-interacting protein LIP.1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11686—11690. PMID 8524829 DOI:10.1073/pnas.92.25.11686
- Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9245 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13136 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |