PPFIA1

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1N7F

Ідентифікатори

Символи

PPFIA1, LIP.1, LIP1, LIPRIN, PTPRF interacting protein alpha 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611054 MGI: 1924750 HomoloGene: 20802 GeneCards: PPFIA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity
Клітинна компонента	• presynaptic active zone • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • аксон • дендрит (нейробіологія) • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• cell-matrix adhesion • negative regulation of stress fiber assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of protein localization to plasma membrane • GO:0010554 neurotransmitter secretion • glutamate secretion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8500


233977

Ensembl


ENSG00000131626 ENSG00000288198


ENSMUSG00000037519

UniProt


Q13136


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_003626 NM_177423 NM_001378006


NM_001033319 NM_001195086

RefSeq (білок)


NP_003617 NP_803172 NP_001364935


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 11: 70.27 – 70.39 Mb

Хр. 7: 144.03 – 144.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPFIA1 (англ. PTPRF interacting protein alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 202 амінокислот, а молекулярна маса — 135 779^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMCEVMPTIS	EAEGPPGGGG	GHGSGSPSQP	DADSHFEQLM	VSMLEERDRL
LDTLRETQET	LALTQGKLHE	VGHERDSLQR	QLNTALPQEF	AALTKELNVC
REQLLEREEE	IAELKAERNN	TRLLLEHLEC	LVSRHERSLR	MTVVKRQAQS
PAGVSSEVEV	LKALKSLFEH	HKALDEKVRE	RLRVALERCS	LLEEELGATH
KELMILKEQN	NQKKTLTDGV	LDINHEQENT	PSTSGKRSSD	GSLSHEEDLA
KVIELQEIIS	KQSREQSQMK	ERLASLSSHV	TELEEDLDTA	RKDLIKSEEM
NTKLQRDVRE	AMAQKEDMEE	RITTLEKRYL	AAQREATSVH	DLNDKLENEI
ANKDSMHRQT	EDKNRQLQER	LELAEQKLQQ	TLRKAETLPE	VEAELAQRVA
ALSKAEERHG	NIEERLRQME	AQLEEKNQEL	QRARQREKMN	EEHNKRLSDT
VDKLLSESNE	RLQLHLKERM	AALEDKNSLL	REVESAKKQL	EETQHDKDQL
VLNIEALRAE	LDHMRLRGAS	LHHGRPHLGS	VPDFRFPMAD	GHTDSYSTSA
VLRRPQKGRL	AALRDEPSKV	QTLNEQDWER	AQQASVLANV	AQAFESDADV
SDGEDDRDTL	LSSVDLLSPS	GQADAHTLAM	MLQEQLDAIN	KEIRLIQEEK
ENTEQRAEEI	ESRVGSGSLD	NLGRFRSMSS	IPPYPASSLA	SSSPPGSGRS
TPRRIPHSPA	REVDRLGVMT	LLPPSREEVR	DDKTTIKCET	SPPSSPRALR
LDRLHKGALH	TVSHEDIRDI	RNSTGSQDGP	VSNPSSSNSS	QDSLHKAPKK
KGIKSSIGRL	FGKKEKGRPG	QTGKEALGQA	GVSETDNSSQ	DALGLSKLGG
QAEKNRKLQK	KHELLEEARR	QGLPFAQWDG	PTVVVWLELW	VGMPAWYVAA
CRANVKSGAI	MSALSDTEIQ	REIGISNPLH	RLKLRLAIQE	IMSLTSPSAP
PTSRTTLAYG	DMNHEWIGNE	WLPSLGLPQY	RSYFMECLVD	ARMLDHLTKK
DLRGQLKMVD	SFHRNSFQCG	IMCLRRLNYD	RKELERKREE	SQSEIKDVLV
WSNDRVIRWI	LSIGLKEYAN	NLIESGVHGA	LLALDETFDF	SALALLLQIP
TQNTQARAVL	EREFNNLLVM	GTDRRFDEDD	DKSFRRAPSW	RKKFRPKDIR
GLAAGSAETL	PANFRVTSSM	SSPSMQPKKM	QMDGNVSGTQ	RLDSATVRTY
SC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pulido R., Serra-Pages C., Tang M., Streuli M. (1995). The LAR/PTP delta/PTP sigma subfamily of transmembrane protein-tyrosine-phosphatases: multiple human LAR, PTP delta, and PTP sigma isoforms are expressed in a tissue-specific manner and associate with the LAR-interacting protein LIP.1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11686—11690. PMID 8524829 DOI:10.1073/pnas.92.25.11686
Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9245 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13136 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.