PPM1B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/23/Protein_PPM1B_PDB_2p8e.png/250px-Protein_PPM1B_PDB_2p8e.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PPM1B, PP2C-beta, PP2C-beta-X, PP2CB, PP2CBETA, PPC2BETAX, protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603770 MGI: 101841 HomoloGene: 2027 GeneCards: PPM1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • manganese ion binding • protein serine/threonine phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • каталітична активність • cation binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • цитоплазма • ядерце • гіалоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of defense response to virus • N-terminal protein myristoylation • peptidyl-threonine dephosphorylation • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b9/PBB_GE_PPM1B_213225_at_fs.png/250px-PBB_GE_PPM1B_213225_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001033556 NM_001033557 NM_002706 NM_177968 NM_177969 |
| | NM_001159496 NM_001159497 NM_001159498 NM_011151 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001028729 NP_002697 NP_808907 NP_808908 |
| | NP_001152968 NP_001152969 NP_001152970 NP_035281 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 44.17 – 44.24 Mb | Хр. 17: 85.26 – 85.33 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PPM1B (англ. Protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 52 643[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGAFLDKPKT | | EKHNAHGAGN | | GLRYGLSSMQ | | GWRVEMEDAH | | TAVVGIPHGL |
EDWSFFAVYD | | GHAGSRVANY | | CSTHLLEHIT | | TNEDFRAAGK | | SGSALELSVE |
NVKNGIRTGF | | LKIDEYMRNF | | SDLRNGMDRS | | GSTAVGVMIS | | PKHIYFINCG |
DSRAVLYRNG | | QVCFSTQDHK | | PCNPREKERI | | QNAGGSVMIQ | | RVNGSLAVSR |
ALGDYDYKCV | | DGKGPTEQLV | | SPEPEVYEIL | | RAEEDEFIIL | | ACDGIWDVMS |
NEELCEYVKS | | RLEVSDDLEN | | VCNWVVDTCL | | HKGSRDNMSI | | VLVCFSNAPK |
VSDEAVKKDS | | ELDKHLESRV | | EEIMEKSGEE | | GMPDLAHVMR | | ILSAENIPNL |
PPGGGLAGKR | | NVIEAVYSRL | | NPHRESDGAS | | DEAEESGSQG | | KLVEALRQMR |
INHRGNYRQL | | LEEMLTSYRL | | AKVEGEESPA | | EPAATATSSN | | SDAGNPVTMQ |
ESHTESESGL | | AELDSSNEDA | | GTKMSGEKI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- Marely A.E., Kline A., Crabtree G., Sullivan J.E., Beri R.K. (1998). The cloning expression and tissue distribution of human PP2Cbeta. FEBS Lett. 431: 121—124. PMID 9684878 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00708-X
- Cheng A., Kaldis P., Solomon M.J. (2000). Dephosphorylation of human cyclin-dependent kinases by protein phosphatase type 2Calpha and beta2 isoforms. J. Biol. Chem. 275: 34744—34749. PMID 10934208 DOI:10.1074/jbc.M006210200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Takeuchi T., Kobayashi T., Tamura S., Yokosawa H. (2006). Negative regulation of protein phosphatase 2Cbeta by ISG15 conjugation. FEBS Lett. 580: 4521—4526. PMID 16872604 DOI:10.1016/j.febslet.2006.07.032
- Kaur R., Yuan X., Lu M.L., Balk S.P. (2008). Increased PAK6 expression in prostate cancer and identification of PAK6 associated proteins. Prostate. 68: 1510—1516. PMID 18642328 DOI:10.1002/pros.20787
- Bruce D.L., Macartney T., Yong W., Shou W., Sapkota G.P. (2012). Protein phosphatase 5 modulates SMAD3 function in the transforming growth factor-beta pathway. Cell. Signal. 24: 1999—2006. PMID 22781750 DOI:10.1016/j.cellsig.2012.07.003
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9276 (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O75688 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |