PRDM2
PRDM2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PRDM2, HUMHOXY1, KMT8, MTB-ZF, RIZ, RIZ1, RIZ2, PR domain 2, PR/SET domain 2, KMT8A | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601196 MGI: 107628 HomoloGene: 40822 GeneCards: PRDM2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 13.7 – 13.83 Mb | Хр. 4: 143.11 – 143.21 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PRDM2 (англ. PR/SET domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 718 амінокислот, а молекулярна маса — 188 915[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNQNTTEPVA | ATETLAEVPE | HVLRGLPEEV | RLFPSAVDKT | RIGVWATKPI | ||||
LKGKKFGPFV | GDKKKRSQVK | NNVYMWEVYY | PNLGWMCIDA | TDPEKGNWLR | ||||
YVNWACSGEE | QNLFPLEINR | AIYYKTLKPI | APGEELLVWY | NGEDNPEIAA | ||||
AIEEERASAR | SKRSSPKSRK | GKKKSQENKN | KGNKIQDIQL | KTSEPDFTSA | ||||
NMRDSAEGPK | EDEEKPSASA | LEQPATLQEV | ASQEVPPELA | TPAPAWEPQP | ||||
EPDERLEAAA | CEVNDLGEEE | EEEEEEDEEE | EEDDDDDELE | DEGEEEASMP | ||||
NENSVKEPEI | RCDEKPEDLL | EEPKTTSEET | LEDCSEVTPA | MQIPRTKEEA | ||||
NGDVFETFMF | PCQHCERKFT | TKQGLERHMH | IHISTVNHAF | KCKYCGKAFG | ||||
TQINRRRHER | RHEAGLKRKP | SQTLQPSEDL | ADGKASGENV | ASKDDSSPPS | ||||
LGPDCLIMNS | EKASQDTINS | SVVEENGEVK | ELHPCKYCKK | VFGTHTNMRR | ||||
HQRRVHERHL | IPKGVRRKGG | LEEPQPPAEQ | AQATQNVYVP | STEPEEEGEA | ||||
DDVYIMDISS | NISENLNYYI | DGKIQTNNNT | SNCDVIEMES | ASADLYGINC | ||||
LLTPVTVEIT | QNIKTTQVPV | TEDLPKEPLG | STNSEAKKRR | TASPPALPKI | ||||
KAETDSDPMV | PSCSLSLPLS | ISTTEAVSFH | KEKSVYLSSK | LKQLLQTQDK | ||||
LTPAGISATE | IAKLGPVCVS | APASMLPVTS | SRFKRRTSSP | PSSPQHSPAL | ||||
RDFGKPSDGK | AAWTDAGLTS | KKSKLESHSD | SPAWSLSGRD | ERETVSPPCF | ||||
DEYKMSKEWT | ASSAFSSVCN | QQPLDLSSGV | KQKAEGTGKT | PVQWESVLDL | ||||
SVHKKHCSDS | EGKEFKESHS | VQPTCSAVKK | RKPTTCMLQK | VLLNEYNGID | ||||
LPVENPADGT | RSPSPCKSLE | AQPDPDLGPG | SGFPAPTVES | TPDVCPSSPA | ||||
LQTPSLSSGQ | LPPLLIPTDP | SSPPPCPPVL | TVATPPPPLL | PTVPLPAPSS | ||||
SASPHPCPSP | LSNATAQSPL | PILSPTVSPS | PSPIPPVEPL | MSAASPGPPT | ||||
LSSSSSSSSS | SSSFSSSSSS | SSPSPPPLSA | ISSVVSSGDN | LEASLPMISF | ||||
KQEELENEGL | KPREEPQSAA | EQDVVVQETF | NKNFVCNVCE | SPFLSIKDLT | ||||
KHLSIHAEEW | PFKCEFCVQL | FKDKTDLSEH | RFLLHGVGNI | FVCSVCKKEF | ||||
AFLCNLQQHQ | RDLHPDKVCT | HHEFESGTLR | PQNFTDPSKA | HVEHMQSLPE | ||||
DPLETSKEEE | ELNDSSEELY | TTIKIMASGI | KTKDPDVRLG | LNQHYPSFKP | ||||
PPFQYHHRNP | MGIGVTATNF | TTHNIPQTFT | TAIRCTKCGK | GVDNMPELHK | ||||
HILACASASD | KKRYTPKKNP | VPLKQTVQPK | NGVVVLDNSG | KNAFRRMGQP | ||||
KRLNFSVELS | KMSSNKLKLN | ALKKKNQLVQ | KAILQKNKSA | KQKADLKNAC | ||||
ESSSHICPYC | NREFTYIGSL | NKHAAFSCPK | KPLSPPKKKV | SHSSKKGGHS | ||||
SPASSDKNSN | SNHRRRTADA | EIKMQSMQTP | LGKTRARSSG | PTQVPLPSSS | ||||
FRSKQNVKFA | ASVKSKKPSS | SSLRNSSPIR | MAKITHVEGK | KPKAVAKNHS | ||||
AQLSSKTSRS | LHVRVQKSKA | VLQSKSTLAS | KKRTDRFNIK | SRERSGGPVT | ||||
RSLQLAAAAD | LSENKREDGS | AKQELKDFSY | SLRLASRCSP | PAAPYITRQY | ||||
RKVKAPAAAQ | FQGPFFKE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- Buyse I.M., Shao G., Huang S. (1995). The retinoblastoma protein binds to RIZ, a zinc-finger protein that shares an epitope with the adenovirus E1A protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 4467—4471. PMID 7538672 DOI:10.1073/pnas.92.10.4467
- Liu L., Shao G., Steele-Perkins G., Huang S. (1997). The retinoblastoma interacting zinc finger gene RIZ produces a PR domain-lacking product through an internal promoter. J. Biol. Chem. 272: 2984—2991. PMID 9006946 DOI:10.1074/jbc.272.5.2984
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shapiro V.S., Lee P., Winoto A. (1995). Identification and cloning of the G3B cDNA encoding a 3' segment of a protein binding to GATA-3. Gene. 163: 329—330. PMID 7590293 DOI:10.1016/0378-1119(95)00420-B
- Muraosa Y., Takahashi K., Yoshizawa M., Shibahara S. (1996). cDNA cloning of a novel protein containing two zinc-finger domains that may function as a transcription factor for the human heme-oxygenase-1 gene. Eur. J. Biochem. 235: 471—479. PMID 8654390 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.00471.x
- Kim K.-C., Geng L., Huang S. (2003). Inactivation of a histone methyltransferase by mutations in human cancers. Cancer Res. 63: 7619—7623. PMID 14633678
Примітки
Див. також
- Хромосома 1
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |