PSMA7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4R3O, 4R67, 1IRU, 5A0Q

Ідентифікатори

Символи

PSMA7, C6, HSPC, RC6-1, XAPC7, HEL-S-276, proteasome subunit alpha 7, proteasome 20S subunit alpha 7

Зовнішні ІД

OMIM: 606607 MGI: 1347070 HomoloGene: 105299 GeneCards: PSMA7

Реагує на сполуку

Карфілзоміб, ixazomib, Oprozomib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • threonine-type endopeptidase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • proteasome core complex • postsynapse • proteasome core complex, alpha-subunit complex
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • протеоліз • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0022415 viral process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • proteasomal protein catabolic process • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5688


26444

Ensembl


ENSG00000101182


ENSMUSG00000027566

UniProt


O14818


Q9Z2U0

RefSeq (мРНК)


NM_152255 NM_002792


NM_001289476 NM_011969

RefSeq (білок)


NP_002783


NP_001276405 NP_036099

Локус (UCSC)

Хр. 20: 62.14 – 62.14 Mb

Хр. 2: 179.68 – 179.68 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMA7 (англ. Proteasome subunit alpha 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 27 887^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYDRAITVF	SPDGHLFQVE	YAQEAVKKGS	TAVGVRGRDI	VVLGVEKKSV
AKLQDERTVR	KICALDDNVC	MAFAGLTADA	RIVINRARVE	CQSHRLTVED
PVTVEYITRY	IASLKQRYTQ	SNGRRPFGIS	ALIVGFDFDG	TPRLYQTDPS
GTYHAWKANA	IGRGAKSVRE	FLEKNYTDEA	IETDDLTIKL	VIKALLEVVQ
SGGKNIELAV	MRRDQSLKIL	NPEEIEKYVA	EIEKEKEENE	KKKQKKAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Dong J., Chen W., Welford A., Wandinger-Ness A. (2004). The proteasome alpha-subunit XAPC7 interacts specifically with Rab7 and late endosomes. J. Biol. Chem. 279: 21334—21342. PMID 14998988 DOI:10.1074/jbc.M401022200
Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176
da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core. Nat. Commun. 6: 7573—7573. PMID 26133119 DOI:10.1038/ncomms8573

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Proteasome 20S subunit alpha 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9536 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O14818 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.