PSMB2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4R3O, 4R67, 1IRU, 5A0Q

Ідентифікатори

Символи

PSMB2, HC7-I, proteasome subunit beta 2, proteasome 20S subunit beta 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602175 MGI: 1347045 HomoloGene: 2088 GeneCards: PSMB2

Реагує на сполуку

Карфілзоміб, ixazomib, Oprozomib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • threonine-type endopeptidase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • proteasome core complex • proteasome core complex, beta-subunit complex
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • GO:1904578 response to organic cyclic compound • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • протеоліз • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • response to organonitrogen compound • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • GO:0022415 viral process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • proteasomal protein catabolic process • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5690


26445

Ensembl


ENSG00000126067


ENSMUSG00000028837

UniProt


P49721


Q9R1P3

RefSeq (мРНК)


NM_002794 NM_001199779 NM_001199780


NM_011970

RefSeq (білок)


NP_001186708 NP_001186709 NP_002785


NP_036100

Локус (UCSC)

Хр. 1: 35.6 – 35.64 Mb

Хр. 4: 126.57 – 126.6 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMB2 (англ. Proteasome subunit beta 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 836^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEYLIGIQGP	DYVLVASDRV	AASNIVQMKD	DHDKMFKMSE	KILLLCVGEA
GDTVQFAEYI	QKNVQLYKMR	NGYELSPTAA	ANFTRRNLAD	CLRSRTPYHV
NLLLAGYDEH	EGPALYYMDY	LAALAKAPFA	AHGYGAFLTL	SILDRYYTPT
ISRERAVELL	RKCLEELQKR	FILNLPTFSV	RIIDKNGIHD	LDNISFPKQG
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nothwang H.G., Tamura T., Tanaka K., Ichihara A. (1994). Sequence analyses and inter-species comparisons of three novel human proteasomal subunits, HsN3, HsC7-I and HsC10-II, confine potential proteolytic active-site residues. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 361—368. PMID 7918633 DOI:10.1016/0167-4781(94)90060-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kristensen P., Johnsen A.H., Uerkvitz W., Tanaka K., Hendil K.B. (1994). Human proteasome subunits from 2-dimensional gels identified by partial sequencing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1785—1789. PMID 7811265 DOI:10.1006/bbrc.1994.2876
Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176
da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core. Nat. Commun. 6: 7573—7573. PMID 26133119 DOI:10.1038/ncomms8573

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Proteasome 20S subunit beta 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9539 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P49721 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.