PTBP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CQ1, 2MJU, 4CQ1

Ідентифікатори

Символи

PTBP2, PTBLP, brPTB, nPTB, polypyrimidine tract binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 608449 MGI: 1860489 HomoloGene: 23162 GeneCards: PTBP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA binding • pre-mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• growth cone • spliceosomal complex • neuronal cell body • клітинне ядро
Біологічний процес	• mRNA splice site selection • cerebellum development • mRNA processing • Сплайсинг РНК • spinal cord development • regulation of neural precursor cell proliferation • negative regulation of RNA splicing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


58155


56195

Ensembl


ENSG00000117569


ENSMUSG00000028134

UniProt


Q9UKA9


Q91Z31

RefSeq (мРНК)

NM_001300985 NM_001300986 NM_001300987 NM_001300988 NM_001300989
NM_001300990 NM_021190


NM_019550 NM_001310711

RefSeq (білок)

NP_001287914 NP_001287915 NP_001287916 NP_001287917 NP_001287918
NP_001287919 NP_067013


NP_001297640 NP_062423

Локус (UCSC)

Хр. 1: 96.72 – 96.82 Mb

Хр. 3: 119.51 – 119.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTBP2 (англ. Polypyrimidine tract binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 57 491^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDGIVTEVAV	GVKRGSDELL	SGSVLSSPNS	NMSSMVVTAN	GNDSKKFKGE
DKMDGAPSRV	LHIRKLPGEV	TETEVIALGL	PFGKVTNILM	LKGKNQAFLE
LATEEAAITM	VNYYSAVTPH	LRNQPIYIQY	SNHKELKTDN	TLNQRAQAVL
QAVTAVQTAN	TPLSGTTVSE	SAVTPAQSPV	LRIIIDNMYY	PVTLDVLHQI
FSKFGAVLKI	ITFTKNNQFQ	ALLQYGDPVN	AQQAKLALDG	QNIYNACCTL
RIDFSKLVNL	NVKYNNDKSR	DYTRPDLPSG	DGQPALDPAI	AAAFAKETSL
LAVPGALSPL	AIPNAAAAAA	AAAAGRVGMP	GVSAGGNTVL	LVSNLNEEMV
TPQSLFTLFG	VYGDVQRVKI	LYNKKDSALI	QMADGNQSQL	AMNHLNGQKM
YGKIIRVTLS	KHQTVQLPRE	GLDDQGLTKD	FGNSPLHRFK	KPGSKNFQNI
FPPSATLHLS	NIPPSVAEED	LRTLFANTGG	TVKAFKFFQD	HKMALLQMAT
VEEAIQALID	LHNYNLGENH	HLRVSFSKST	I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Tateiwa H., Gotoh N., Ichikawa M., Kikuchi T., Yoshimura N. (2001). Molecular cloning and characterization of human PTB-like protein: a possible retinal autoantigen of cancer-associated retinopathy. J. Neuroimmunol. 120: 161—169. PMID 11694331 DOI:10.1016/S0165-5728(01)00427-1
Rahman L., Bliskovski V., Reinhold W., Zajac-Kaye M. (2002). Alternative splicing of brain-specific PTB defines a tissue-specific isoform pattern that predicts distinct functional roles. Genomics. 80: 245—249. PMID 12213192 DOI:10.1006/geno.2002.6826
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mitchell S.A., Spriggs K.A., Coldwell M.J., Jackson R.J., Willis A.E. (2003). The Apaf-1 internal ribosome entry segment attains the correct structural conformation for function via interactions with PTB and unr. Mol. Cell. 11: 757—771. PMID 12667457 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00093-5

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17662 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UKA9 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.