PTBP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CQ1, 2MJU, 4CQ1 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTBP2, PTBLP, brPTB, nPTB, polypyrimidine tract binding protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608449 MGI: 1860489 HomoloGene: 23162 GeneCards: PTBP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • mRNA binding • pre-mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • growth cone • spliceosomal complex • neuronal cell body • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • mRNA splice site selection • cerebellum development • mRNA processing • Сплайсинг РНК • spinal cord development • regulation of neural precursor cell proliferation • negative regulation of RNA splicing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001300985 NM_001300986 NM_001300987 NM_001300988 NM_001300989
| NM_001300990 NM_021190 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001287914 NP_001287915 NP_001287916 NP_001287917 NP_001287918
| NP_001287919 NP_067013 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 96.72 – 96.82 Mb | Хр. 3: 119.51 – 119.58 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTBP2 (англ. Polypyrimidine tract binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 57 491[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDGIVTEVAV | | GVKRGSDELL | | SGSVLSSPNS | | NMSSMVVTAN | | GNDSKKFKGE |
DKMDGAPSRV | | LHIRKLPGEV | | TETEVIALGL | | PFGKVTNILM | | LKGKNQAFLE |
LATEEAAITM | | VNYYSAVTPH | | LRNQPIYIQY | | SNHKELKTDN | | TLNQRAQAVL |
QAVTAVQTAN | | TPLSGTTVSE | | SAVTPAQSPV | | LRIIIDNMYY | | PVTLDVLHQI |
FSKFGAVLKI | | ITFTKNNQFQ | | ALLQYGDPVN | | AQQAKLALDG | | QNIYNACCTL |
RIDFSKLVNL | | NVKYNNDKSR | | DYTRPDLPSG | | DGQPALDPAI | | AAAFAKETSL |
LAVPGALSPL | | AIPNAAAAAA | | AAAAGRVGMP | | GVSAGGNTVL | | LVSNLNEEMV |
TPQSLFTLFG | | VYGDVQRVKI | | LYNKKDSALI | | QMADGNQSQL | | AMNHLNGQKM |
YGKIIRVTLS | | KHQTVQLPRE | | GLDDQGLTKD | | FGNSPLHRFK | | KPGSKNFQNI |
FPPSATLHLS | | NIPPSVAEED | | LRTLFANTGG | | TVKAFKFFQD | | HKMALLQMAT |
VEEAIQALID | | LHNYNLGENH | | HLRVSFSKST | | I |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Tateiwa H., Gotoh N., Ichikawa M., Kikuchi T., Yoshimura N. (2001). Molecular cloning and characterization of human PTB-like protein: a possible retinal autoantigen of cancer-associated retinopathy. J. Neuroimmunol. 120: 161—169. PMID 11694331 DOI:10.1016/S0165-5728(01)00427-1
- Rahman L., Bliskovski V., Reinhold W., Zajac-Kaye M. (2002). Alternative splicing of brain-specific PTB defines a tissue-specific isoform pattern that predicts distinct functional roles. Genomics. 80: 245—249. PMID 12213192 DOI:10.1006/geno.2002.6826
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mitchell S.A., Spriggs K.A., Coldwell M.J., Jackson R.J., Willis A.E. (2003). The Apaf-1 internal ribosome entry segment attains the correct structural conformation for function via interactions with PTB and unr. Mol. Cell. 11: 757—771. PMID 12667457 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00093-5
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17662 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UKA9 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |