PUF60
PUF60 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PUF60, FIR, RoBPI, SIAHBP1, VRJS, poly(U) binding splicing factor 60KDa, poly(U) binding splicing factor 60 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604819 MGI: 1915209 HomoloGene: 8614 GeneCards: PUF60 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
syndromic intellectual disability, Verheij syndrome[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 143.82 – 143.83 Mb | Хр. 15: 75.94 – 75.95 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PUF60 (англ. Poly(U) binding splicing factor 60) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 559 амінокислот, а молекулярна маса — 59 875[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MATATIALQV | NGQQGGGSEP | AAAAAVVAAG | DKWKPPQGTD | SIKMENGQST | ||||
AAKLGLPPLT | PEQQEALQKA | KKYAMEQSIK | SVLVKQTIAH | QQQQLTNLQM | ||||
AAVTMGFGDP | LSPLQSMAAQ | RQRALAIMCR | VYVGSIYYEL | GEDTIRQAFA | ||||
PFGPIKSIDM | SWDSVTMKHK | GFAFVEYEVP | EAAQLALEQM | NSVMLGGRNI | ||||
KVGRPSNIGQ | AQPIIDQLAE | EARAFNRIYV | ASVHQDLSDD | DIKSVFEAFG | ||||
KIKSCTLARD | PTTGKHKGYG | FIEYEKAQSS | QDAVSSMNLF | DLGGQYLRVG | ||||
KAVTPPMPLL | TPATPGGLPP | AAAVAAAAAT | AKITAQEAVA | GAAVLGTLGT | ||||
PGLVSPALTL | AQPLGTLPQA | VMAAQAPGVI | TGVTPARPPI | PVTIPSVGVV | ||||
NPILASPPTL | GLLEPKKEKE | EEELFPESER | PEMLSEQEHM | SISGSSARHM | ||||
VMQKLLRKQE | STVMVLRNMV | DPKDIDDDLE | GEVTEECGKF | GAVNRVIIYQ | ||||
EKQGEEEDAE | IIVKIFVEFS | IASETHKAIQ | ALNGRWFAGR | KVVAEVYDQE | ||||
RFDNSDLSA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Bouffard P., Barbar E., Briere F., Boire G. (2000). Interaction cloning and characterization of RoBPI, a novel protein binding to human Ro ribonucleoproteins. RNA. 6: 66—78. PMID 10668799 DOI:10.1017/S1355838200990277
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Page-McCaw P.S., Amonlirdviman K., Sharp P.A. (1999). PUF60: a novel U2AF65-related splicing activity. RNA. 5: 1548—1560. PMID 10606266 DOI:10.1017/S1355838299991938
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Hastings M.L., Allemand E., Duelli D.M., Myers M.P., Krainer A.R. (2007). Control of pre-mRNA splicing by the general splicing factors PUF60 and U2AF. PLoS ONE. 2: E538—E538. PMID 17579712 DOI:10.1371/journal.pone.0000538
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PUF60 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17042 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UHX1 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 8
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |