PUM1
PUM1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PUM1, HSPUM, PUMH, PUMH1, PUML1, pumilio RNA binding family member 1, SCA47 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607204 MGI: 1931749 HomoloGene: 22830 GeneCards: PUM1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
spinocerebellar ataxia 47[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 30.93 – 31.07 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PUM1 (англ. Pumilio RNA binding family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 186 амінокислот, а молекулярна маса — 126 473[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSVACVLKRK | AVLWQDSFSP | HLKHHPQEPA | NPNMPVVLTS | GTGSQAQPQP | ||||
AANQALAAGT | HSSPVPGSIG | VAGRSQDDAM | VDYFFQRQHG | EQLGGGGSGG | ||||
GGYNNSKHRW | PTGDNIHAEH | QVRSMDELNH | DFQALALEGR | AMGEQLLPGK | ||||
KFWETDESSK | DGPKGIFLGD | QWRDSAWGTS | DHSVSQPIMV | QRRPGQSFHV | ||||
NSEVNSVLSP | RSESGGLGVS | MVEYVLSSSP | GDSCLRKGGF | GPRDADSDEN | ||||
DKGEKKNKGT | FDGDKLGDLK | EEGDVMDKTN | GLPVQNGIDA | DVKDFSRTPG | ||||
NCQNSANEVD | LLGPNQNGSE | GLAQLTSTNG | AKPVEDFSNM | ESQSVPLDPM | ||||
EHVGMEPLQF | DYSGTQVPVD | SAAATVGLFD | YNSQQQLFQR | PNALAVQQLT | ||||
AAQQQQYALA | AAHQPHIGLA | PAAFVPNPYI | ISAAPPGTDP | YTAGLAAAAT | ||||
LGPAVVPHQY | YGVTPWGVYP | ASLFQQQAAA | AAAATNSANQ | QTTPQAQQGQ | ||||
QQVLRGGASQ | RPLTPNQNQQ | GQQTDPLVAA | AAVNSALAFG | QGLAAGMPGY | ||||
PVLAPAAYYD | QTGALVVNAG | ARNGLGAPVR | LVAPAPVIIS | SSAAQAAVAA | ||||
AAASANGAAG | GLAGTTNGPF | RPLGTQQPQP | QPQQQPNNNL | ASSSFYGNNS | ||||
LNSNSQSSSL | FSQGSAQPAN | TSLGFGSSSS | LGATLGSALG | GFGTAVANSN | ||||
TGSGSRRDSL | TGSSDLYKRT | SSSLTPIGHS | FYNGLSFSSS | PGPVGMPLPS | ||||
QGPGHSQTPP | PSLSSHGSSS | SLNLGGLTNG | SGRYISAAPG | AEAKYRSASS | ||||
ASSLFSPSST | LFSSSRLRYG | MSDVMPSGRS | RLLEDFRNNR | YPNLQLREIA | ||||
GHIMEFSQDQ | HGSRFIQLKL | ERATPAERQL | VFNEILQAAY | QLMVDVFGNY | ||||
VIQKFFEFGS | LEQKLALAER | IRGHVLSLAL | QMYGCRVIQK | ALEFIPSDQQ | ||||
NEMVRELDGH | VLKCVKDQNG | NHVVQKCIEC | VQPQSLQFII | DAFKGQVFAL | ||||
STHPYGCRVI | QRILEHCLPD | QTLPILEELH | QHTEQLVQDQ | YGNYVIQHVL | ||||
EHGRPEDKSK | IVAEIRGNVL | VLSQHKFASN | VVEKCVTHAS | RTERAVLIDE | ||||
VCTMNDGPHS | ALYTMMKDQY | ANYVVQKMID | VAEPGQRKIV | MHKIRPHIAT | ||||
LRKYTYGKHI | LAKLEKYYMK | NGVDLGPICG | PPNGII |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, диференціація, сперматогенез, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Spassov D.S., Jurecic R. (2002). Cloning and comparative sequence analysis of PUM1 and PUM2 genes, human members of the Pumilio family of RNA-binding proteins. Gene. 299: 195—204. PMID 12459267 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01060-0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Leibovich L., Mandel-Gutfreund Y., Yakhini Z. (2010). A structural-based statistical approach suggests a cooperative activity of PUM1 and miR-410 in human 3'-untranslated regions. Silence. 1: 17—17. PMID 20860814 DOI:10.1186/1758-907X-1-17
- Filipovska A., Razif M.F., Nygaard K.K., Rackham O. (2011). A universal code for RNA recognition by PUF proteins. Nat. Chem. Biol. 7: 425—427. PMID 21572425 DOI:10.1038/nchembio.577
- Miles W.O., Tschop K., Herr A., Ji J.Y., Dyson N.J. (2012). Pumilio facilitates miRNA regulation of the E2F3 oncogene. Genes Dev. 26: 356—368. PMID 22345517 DOI:10.1101/gad.182568.111
- Wang X., Zamore P.D., Hall T.M.T. (2001). Crystal structure of a Pumilio homology domain. Mol. Cell. 7: 855—865. PMID 11336708 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00229-5
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PUM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14957 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q14671 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
- Хромосома 1
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |