QKI

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4JVH

Ідентифікатори

Символи

QKI, Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, KH domain containing, RNA binding, KH domain containing RNA binding

Зовнішні ІД

OMIM: 609590 MGI: 97837 HomoloGene: 11059 GeneCards: QKI

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • синапс
Біологічний процес	• диференціація клітин • mRNA transport • mRNA processing • васкулогенез • multicellular organism development • axon ensheathment • muscle cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • long-chain fatty acid biosynthetic process • Сплайсинг РНК • spermatid development • myelination • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • regulation of translation • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9444


19317

Ensembl


ENSG00000112531


ENSMUSG00000062078

UniProt


Q96PU8


Q9QYS9

RefSeq (мРНК)


NM_001301085 NM_006775 NM_206853 NM_206854 NM_206855


NM_001159516 NM_001159517 NM_021881

RefSeq (білок)


NP_001288014 NP_006766 NP_996735 NP_996736 NP_996737


NP_001152988 NP_001152989 NP_068681

Локус (UCSC)

Хр. 6: 163.41 – 163.58 Mb

Хр. 17: 10.42 – 10.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

QKI (англ. QKI, KH domain containing RNA binding) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 671^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVGEMETKEK	PKPTPDYLMQ	LMNDKKLMSS	LPNFCGIFNH	LERLLDEEIS
RVRKDMYNDT	LNGSTEKRSA	ELPDAVGPIV	QLQEKLYVPV	KEYPDFNFVG
RILGPRGLTA	KQLEAETGCK	IMVRGKGSMR	DKKKEEQNRG	KPNWEHLNED
LHVLITVEDA	QNRAEIKLKR	AVEEVKKLLV	PAAEGEDSLK	KMQLMELAIL
NGTYRDANIK	SPALAFSLAA	TAQAAPRIIT	GPAPVLPPAA	LRTPTPAGPT
IMPLIRQIQT	AVMPNGTPHP	TAAIVPPGPE	AGLIYTPYEY	PYTLAPATSI
LEYPIEPSGV	LGAVATKVRR	HDMRVHPYQR	IVTADRAATG	N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. Mol. Biol. Cell. 14: 274—287. PMID 12529443 DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484
Aberg K., Saetre P., Jareborg N., Jazin E. (2006). Human QKI, a potential regulator of mRNA expression of human oligodendrocyte-related genes involved in schizophrenia. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 7482—7487. PMID 16641098 DOI:10.1073/pnas.0601213103

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21100 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96PU8 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.