QKI |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1e/Protein_QKI_PDB_2bl5.png/250px-Protein_QKI_PDB_2bl5.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | QKI, Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, KH domain containing, RNA binding, KH domain containing RNA binding |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609590 MGI: 97837 HomoloGene: 11059 GeneCards: QKI |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • SH3 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинне ядро • синапс |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • mRNA transport • mRNA processing • васкулогенез • multicellular organism development • axon ensheathment • muscle cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • long-chain fatty acid biosynthetic process • Сплайсинг РНК • spermatid development • myelination • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • regulation of translation • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/06/PBB_GE_QKI_212636_at_fs.png/250px-PBB_GE_QKI_212636_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2f/PBB_GE_QKI_214541_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_QKI_214541_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e0/PBB_GE_QKI_212263_at_fs.png/250px-PBB_GE_QKI_212263_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001301085 NM_006775 NM_206853 NM_206854 NM_206855 |
| | NM_001159516 NM_001159517 NM_021881 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001288014 NP_006766 NP_996735 NP_996736 NP_996737 |
| | NP_001152988 NP_001152989 NP_068681 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 163.41 – 163.58 Mb | Хр. 17: 10.42 – 10.54 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
QKI (англ. QKI, KH domain containing RNA binding) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 671[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVGEMETKEK | | PKPTPDYLMQ | | LMNDKKLMSS | | LPNFCGIFNH | | LERLLDEEIS |
RVRKDMYNDT | | LNGSTEKRSA | | ELPDAVGPIV | | QLQEKLYVPV | | KEYPDFNFVG |
RILGPRGLTA | | KQLEAETGCK | | IMVRGKGSMR | | DKKKEEQNRG | | KPNWEHLNED |
LHVLITVEDA | | QNRAEIKLKR | | AVEEVKKLLV | | PAAEGEDSLK | | KMQLMELAIL |
NGTYRDANIK | | SPALAFSLAA | | TAQAAPRIIT | | GPAPVLPPAA | | LRTPTPAGPT |
IMPLIRQIQT | | AVMPNGTPHP | | TAAIVPPGPE | | AGLIYTPYEY | | PYTLAPATSI |
LEYPIEPSGV | | LGAVATKVRR | | HDMRVHPYQR | | IVTADRAATG | | N |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. Mol. Biol. Cell. 14: 274—287. PMID 12529443 DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484
- Aberg K., Saetre P., Jareborg N., Jazin E. (2006). Human QKI, a potential regulator of mRNA expression of human oligodendrocyte-related genes involved in schizophrenia. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 7482—7487. PMID 16641098 DOI:10.1073/pnas.0601213103
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21100 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96PU8 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |