RAB1B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c6/Protein_RAB1B_PDB_2fol.png/250px-Protein_RAB1B_PDB_2fol.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3JZA, 3NKV, 4HLQ, 4I1O | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAB1B, member RAS oncogene family |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612565 MGI: 1923558 HomoloGene: 128838 GeneCards: RAB1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • phagophore assembly site membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • transport vesicle • мітохондрія • екзосома • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • establishment of endothelial intestinal barrier • positive regulation of glycoprotein metabolic process • автофагія • regulation of autophagosome assembly • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • protein transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • посттрансляційна модифікація • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4b/PBB_GE_RAB1B_220964_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAB1B_220964_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 66.27 – 66.28 Mb | Хр. 19: 5.15 – 5.16 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAB1B (англ. RAB1B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 171[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNPEYDYLFK | | LLLIGDSGVG | | KSCLLLRFAD | | DTYTESYIST | | IGVDFKIRTI |
ELDGKTIKLQ | | IWDTAGQERF | | RTITSSYYRG | | AHGIIVVYDV | | TDQESYANVK |
QWLQEIDRYA | | SENVNKLLVG | | NKSDLTTKKV | | VDNTTAKEFA | | DSLGIPFLET |
SAKNATNVEQ | | AFMTMAAEIK | | KRMGPGAASG | | GERPNLKIDS | | TPVKPAGGGC |
C |
Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wilson A.L., Sheridan K.M., Erdman R.A., Maltese W.A. (1996). Prenylation of a Rab1B mutant with altered GTPase activity is impaired in cell-free systems but not in intact mammalian cells. Biochem. J. 318: 1007—1014. PMID 8836150 DOI:10.1042/bj3181007
- Overmeyer J.H., Wilson A.L., Erdman R.A., Maltese W.A. (1998). The putative 'switch 2' domain of the Ras-related GTPase, Rab1B, plays an essential role in the interaction with Rab escort protein. Mol. Biol. Cell. 9: 223—235. PMID 9437002 DOI:10.1091/mbc.9.1.223
- Overmeyer J.H., Wilson A.L., Maltese W.A. (2001). Membrane targeting of a Rab GTPase that fails to associate with Rab escort protein (REP) or guanine nucleotide dissociation inhibitor (GDI). J. Biol. Chem. 276: 20379—20386. PMID 11389151 DOI:10.1074/jbc.M101511200
- Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
- Zoppino F.C., Militello R.D., Slavin I., Alvarez C., Colombo M.I. (2010). Autophagosome formation depends on the small GTPase Rab1 and functional ER exit sites. Traffic. 11: 1246—1261. PMID 20545908 DOI:10.1111/j.1600-0854.2010.01086.x
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18370 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q9H0U4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |