RAB1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3JZA, 3NKV, 4HLQ, 4I1O

Ідентифікатори

Символи

RAB1B, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 612565 MGI: 1923558 HomoloGene: 128838 GeneCards: RAB1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • phagophore assembly site membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • transport vesicle • мітохондрія • екзосома • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm
Біологічний процес	• establishment of endothelial intestinal barrier • positive regulation of glycoprotein metabolic process • автофагія • regulation of autophagosome assembly • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • protein transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • посттрансляційна модифікація • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81876


76308

Ensembl


ENSG00000174903


ENSMUSG00000024870

UniProt


Q9H0U4


Q9D1G1

RefSeq (мРНК)


NM_030981


NM_029576

RefSeq (білок)


NP_112243


NP_083852

Локус (UCSC)

Хр. 11: 66.27 – 66.28 Mb

Хр. 19: 5.15 – 5.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB1B (англ. RAB1B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 171^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNPEYDYLFK	LLLIGDSGVG	KSCLLLRFAD	DTYTESYIST	IGVDFKIRTI
ELDGKTIKLQ	IWDTAGQERF	RTITSSYYRG	AHGIIVVYDV	TDQESYANVK
QWLQEIDRYA	SENVNKLLVG	NKSDLTTKKV	VDNTTAKEFA	DSLGIPFLET
SAKNATNVEQ	AFMTMAAEIK	KRMGPGAASG	GERPNLKIDS	TPVKPAGGGC
C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wilson A.L., Sheridan K.M., Erdman R.A., Maltese W.A. (1996). Prenylation of a Rab1B mutant with altered GTPase activity is impaired in cell-free systems but not in intact mammalian cells. Biochem. J. 318: 1007—1014. PMID 8836150 DOI:10.1042/bj3181007
Overmeyer J.H., Wilson A.L., Erdman R.A., Maltese W.A. (1998). The putative 'switch 2' domain of the Ras-related GTPase, Rab1B, plays an essential role in the interaction with Rab escort protein. Mol. Biol. Cell. 9: 223—235. PMID 9437002 DOI:10.1091/mbc.9.1.223
Overmeyer J.H., Wilson A.L., Maltese W.A. (2001). Membrane targeting of a Rab GTPase that fails to associate with Rab escort protein (REP) or guanine nucleotide dissociation inhibitor (GDI). J. Biol. Chem. 276: 20379—20386. PMID 11389151 DOI:10.1074/jbc.M101511200
Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
Zoppino F.C., Militello R.D., Slavin I., Alvarez C., Colombo M.I. (2010). Autophagosome formation depends on the small GTPase Rab1 and functional ER exit sites. Traffic. 11: 1246—1261. PMID 20545908 DOI:10.1111/j.1600-0854.2010.01086.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18370 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, Q9H0U4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.