RAB6A |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e2/Protein_RAB6A_PDB_1yzq.png/250px-Protein_RAB6A_PDB_1yzq.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1YZQ, 2GIL, 3BBP, 3CWZ, 4DKX | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAB6A, RAB6, member RAS oncogene family |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 179513 MGI: 894313 HomoloGene: 55697 GeneCards: RAB6A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • protein domain specific binding • GTP binding • myosin V binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity |
---|
Клітинна компонента | • комплекс Ґольджі • мембрана • endosome to plasma membrane transport vesicle • trans-Golgi network • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • trans-Golgi network membrane • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation • early endosome to Golgi transport • peptidyl-cysteine methylation • protein localization to Golgi apparatus • protein transport • minus-end-directed organelle transport along microtubule • GO:0022415 viral process • vesicle-mediated transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • Rab protein signal transduction • retrograde transport, endosome to Golgi |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/63/PBB_GE_RAB6A_201045_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAB6A_201045_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/PBB_GE_RAB6A_201047_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAB6A_201047_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c5/PBB_GE_RAB6A_210406_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAB6A_210406_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_198896 NM_001243718 NM_001243719 NM_002869 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001230647 NP_001230648 NP_002860 NP_942599 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 73.68 – 73.76 Mb | Хр. 7: 100.26 – 100.29 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAB6A (англ. RAB6A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 208 амінокислот, а молекулярна маса — 23 593[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTGGDFGNP | | LRKFKLVFLG | | EQSVGKTSLI | | TRFMYDSFDN | | TYQATIGIDF |
LSKTMYLEDR | | TVRLQLWDTA | | GQERFRSLIP | | SYIRDSTVAV | | VVYDITNVNS |
FQQTTKWIDD | | VRTERGSDVI | | IMLVGNKTDL | | ADKRQVSIEE | | GERKAKELNV |
MFIETSAKAG | | YNVKQLFRRV | | AAALPGMEST | | QDRSREDMID | | IKLEKPQEQP |
VSEGGCSC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.
Література
- Caillol N., Pasqualini E., Lloubes R., Lombardo D. (2000). Impairment of bile salt-dependent lipase secretion in human pancreatic tumoral SOJ-6 cells. J. Cell. Biochem. 79: 628—647. PMID 10996854 DOI:10.1002/1097-4644(20001215)79:4<628::AID-JCB120>3.0.CO;2-T
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Indran S.V., Britt W.J. (2011). A role for the small GTPase Rab6 in assembly of human cytomegalovirus. J. Virol. 85: 5213—5219. PMID 21411515 DOI:10.1128/JVI.02605-10
- Pusapati G.V., Luchetti G., Pfeffer S.R. (2012). Ric1-Rgp1 complex is a guanine nucleotide exchange factor for the late Golgi Rab6A GTPase and an effector of the medial Golgi Rab33B GTPase. J. Biol. Chem. 287: 42129—42137. PMID 23091056 DOI:10.1074/jbc.M112.414565
- Matsuto M., Kano F., Murata M. (2015). Reconstitution of the targeting of Rab6A to the Golgi apparatus in semi-intact HeLa cells: A role of BICD2 in stabilizing Rab6A on Golgi membranes and a concerted role of Rab6A/BICD2 interactions in Golgi-to-ER retrograde transport. Biochim. Biophys. Acta. 1853: 2592—2609. PMID 25962623 DOI:10.1016/j.bbamcr.2015.05.005
- Bergbrede T., Pylypenko O., Rak A., Alexandrov K. (2005). Structure of the extremely slow GTPase Rab6A in the GTP bound form at 1.8A resolution. J. Struct. Biol. 152: 235—238. PMID 16332443 DOI:10.1016/j.jsb.2005.10.001
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9786 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P20340 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |