RAB6A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YZQ, 2GIL, 3BBP, 3CWZ, 4DKX

Ідентифікатори

Символи

RAB6A, RAB6, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 179513 MGI: 894313 HomoloGene: 55697 GeneCards: RAB6A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein domain specific binding • GTP binding • myosin V binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі • мембрана • endosome to plasma membrane transport vesicle • trans-Golgi network • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • trans-Golgi network membrane • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane
Біологічний процес	• antigen processing and presentation • early endosome to Golgi transport • peptidyl-cysteine methylation • protein localization to Golgi apparatus • protein transport • minus-end-directed organelle transport along microtubule • GO:0022415 viral process • vesicle-mediated transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • Rab protein signal transduction • retrograde transport, endosome to Golgi
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5870


19346

Ensembl


ENSG00000175582


ENSMUSG00000030704

UniProt


P20340


P35279

RefSeq (мРНК)


NM_198896 NM_001243718 NM_001243719 NM_002869


NM_001163663 NM_024287

RefSeq (білок)


NP_001230647 NP_001230648 NP_002860 NP_942599


NP_001157135 NP_077249

Локус (UCSC)

Хр. 11: 73.68 – 73.76 Mb

Хр. 7: 100.26 – 100.29 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB6A (англ. RAB6A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 208 амінокислот, а молекулярна маса — 23 593^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTGGDFGNP	LRKFKLVFLG	EQSVGKTSLI	TRFMYDSFDN	TYQATIGIDF
LSKTMYLEDR	TVRLQLWDTA	GQERFRSLIP	SYIRDSTVAV	VVYDITNVNS
FQQTTKWIDD	VRTERGSDVI	IMLVGNKTDL	ADKRQVSIEE	GERKAKELNV
MFIETSAKAG	YNVKQLFRRV	AAALPGMEST	QDRSREDMID	IKLEKPQEQP
VSEGGCSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

Caillol N., Pasqualini E., Lloubes R., Lombardo D. (2000). Impairment of bile salt-dependent lipase secretion in human pancreatic tumoral SOJ-6 cells. J. Cell. Biochem. 79: 628—647. PMID 10996854 DOI:10.1002/1097-4644(20001215)79:4<628::AID-JCB120>3.0.CO;2-T
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Indran S.V., Britt W.J. (2011). A role for the small GTPase Rab6 in assembly of human cytomegalovirus. J. Virol. 85: 5213—5219. PMID 21411515 DOI:10.1128/JVI.02605-10
Pusapati G.V., Luchetti G., Pfeffer S.R. (2012). Ric1-Rgp1 complex is a guanine nucleotide exchange factor for the late Golgi Rab6A GTPase and an effector of the medial Golgi Rab33B GTPase. J. Biol. Chem. 287: 42129—42137. PMID 23091056 DOI:10.1074/jbc.M112.414565
Matsuto M., Kano F., Murata M. (2015). Reconstitution of the targeting of Rab6A to the Golgi apparatus in semi-intact HeLa cells: A role of BICD2 in stabilizing Rab6A on Golgi membranes and a concerted role of Rab6A/BICD2 interactions in Golgi-to-ER retrograde transport. Biochim. Biophys. Acta. 1853: 2592—2609. PMID 25962623 DOI:10.1016/j.bbamcr.2015.05.005
Bergbrede T., Pylypenko O., Rak A., Alexandrov K. (2005). Structure of the extremely slow GTPase Rab6A in the GTP bound form at 1.8A resolution. J. Struct. Biol. 152: 235—238. PMID 16332443 DOI:10.1016/j.jsb.2005.10.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9786 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P20340 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.