RAB7B

Ідентифікатори

Символи

RAB7B, RAB7, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

MGI: 2442295 HomoloGene: 64833 GeneCards: RAB7B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network • лізосома • phagocytic vesicle membrane • phagocytic vesicle • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • late endosome membrane • vacuolar membrane
Біологічний процес	• protein transport • negative regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway • late endosome to Golgi transport • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of megakaryocyte differentiation • negative regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • positive regulation of interleukin-6 production • cellular response to interferon-gamma • intracellular protein transport • endosome to lysosome transport • Rab protein signal transduction • phagosome-lysosome fusion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


338382


226421

Ensembl


ENSG00000276600


ENSMUSG00000052688

UniProt


Q96AH8


Q8VEA8

RefSeq (мРНК)


NM_001164522 NM_001304839 NM_177403


NM_145509 NM_001311096

RefSeq (білок)


NP_001157994 NP_001291768 NP_796377


NP_001298025 NP_663484

Локус (UCSC)

Хр. 1: 205.98 – 206 Mb

Хр. 1: 131.62 – 131.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB7B (англ. RAB7B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 199 амінокислот, а молекулярна маса — 22 511^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNPRKKVDLK	LIIVGAIGVG	KTSLLHQYVH	KTFYEEYQTT	LGASILSKII
ILGDTTLKLQ	IWDTGGQERF	RSMVSTFYKG	SDGCILAFDV	TDLESFEALD
IWRGDVLAKI	VPMEQSYPMV	LLGNKIDLAD	RKVPQEVAQG	WCREKDIPYF
EVSAKNDINV	VQAFEMLASR	ALSRYQSILE	NHLTESIKLS	PDQSRSRCC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bucci C., Bakke O., Progida C. (2010). Rab7b and receptors trafficking. Commun. Integr. Biol. 3: 401—404. PMID 21057625 DOI:10.4161/cib.3.5.12341
Seto S., Tsujimura K., Koide Y. (2011). Rab GTPases regulating phagosome maturation are differentially recruited to mycobacterial phagosomes. Traffic. 12: 407—420. PMID 21255211 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01165.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30513 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96AH8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.