RABGAP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4NC6

Ідентифікатори

Символи

RABGAP1, GAPCENA, TBC1D11, RAB GTPase activating protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 615882 MGI: 2385139 HomoloGene: 49301 GeneCards: RABGAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• tubulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • центросома • цитоскелет • microtubule associated complex • центр організації мікротрубочок • система ендомембран
Біологічний процес	• regulation of cilium assembly • клітинний цикл • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23637


227800

Ensembl


ENSG00000011454


ENSMUSG00000035437

UniProt


Q9Y3P9


A2AWA9

RefSeq (мРНК)


NM_012197


NM_001033960 NM_146121 NM_001362956 NM_001362957 NM_001362958

RefSeq (білок)


NP_036329


NP_001029132 NP_666233 NP_001349885 NP_001349886 NP_001349887

Локус (UCSC)

Хр. 9: 122.94 – 123.1 Mb

Хр. 2: 37.33 – 37.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RABGAP1 (англ. RAB GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 121 737^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDKASVGKI	SVSSDSVSTL	NSEDFVLVSR	QGDETPSTNN	GSDDEKTGLK
IVGNGSEQQL	QKELADVLMD	PPMDDQPGEK	ELVKRSQLDG	EGDGPLSNQL
SASSTINPVP	LVGLQKPEMS	LPVKPGQGDS	EASSPFTPVA	DEDSVVFSKL
TYLGCASVNA	PRSEVEALRM	MSILRSQCQI	SLDVTLSVPN	VSEGIVRLLD
PQTNTEIANY	PIYKILFCVR	GHDGTPESDC	FAFTESHYNA	ELFRIHVFRC
EIQEAVSRIL	YSFATAFRRS	AKQTPLSATA	APQTPDSDIF	TFSVSLEIKE
DDGKGYFSAV	PKDKDRQCFK	LRQGIDKKIV	IYVQQTTNKE	LAIERCFGLL
LSPGKDVRNS	DMHLLDLESM	GKSSDGKSYV	ITGSWNPKSP	HFQVVNEETP
KDKVLFMTTA	VDLVITEVQE	PVRFLLETKV	RVCSPNERLF	WPFSKRSTTE
NFFLKLKQIK	QRERKNNTDT	LYEVVCLESE	SERERRKTTA	SPSVRLPQSG
SQSSVIPSPP	EDDEEEDNDE	PLLSGSGDVS	KECAEKILET	WGELLSKWHL
NLNVRPKQLS	SLVRNGVPEA	LRGEVWQLLA	GCHNNDHLVE	KYRILITKES
PQDSAITRDI	NRTFPAHDYF	KDTGGDGQDS	LYKICKAYSV	YDEEIGYCQG
QSFLAAVLLL	HMPEEQAFSV	LVKIMFDYGL	RELFKQNFED	LHCKFYQLER
LMQEYIPDLY	NHFLDISLEA	HMYASQWFLT	LFTAKFPLYM	VFHIIDLLLC
EGISVIFNVA	LGLLKTSKDD	LLLTDFEGAL	KFFRVQLPKR	YRSEENAKKL
MELACNMKIS	QKKLKKYEKE	YHTMREQQAQ	QEDPIERFER	ENRRLQEANM
RLEQENDDLA	HELVTSKIAL	RKDLDNAEEK	ADALNKELLM	TKQKLIDAEE
EKRRLEEESA	QLKEMCRREL	DKAESEIKKN	SSIIGDYKQI	CSQLSERLEK
QQTANKVEIE	KIRQKVDDCE	RCREFFNKEG	RVKGISSTKE	VLDEDTDEEK
ETLKNQLREM	ELELAQTKLQ	LVEAECKIQD	LEHHLGLALN	EVQAAKKTWF
NRTLSSIKTA	TGVQGKETC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17155 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y3P9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.