RAD21

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4PJU, 4PJW, 4PK7

Ідентифікатори

Символи

RAD21, CDLS4, HR21, HMCD1, NXP1, SCC1, hHR21, RAD21 cohesin complex component, MGS

Зовнішні ІД

OMIM: 606462 MGI: 108016 HomoloGene: 38161 GeneCards: RAD21

Пов'язані генетичні захворювання

Mungan syndrome, Cornelia de Lange syndrome, Cornelia de Lange syndrome, sclerocornea, Mungan syndrome, гострий мієлоїдний лейкоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мембрана • хромосома • нуклеоплазма • condensed nuclear chromosome • nuclear chromosome • Хроматин • центромера • клітинне ядро • GO:0000798 cohesin complex • nuclear matrix • GO:0034991 meiotic cohesin complex • spindle pole • цитоплазма • цитоскелет
Біологічний процес	• reciprocal meiotic recombination • DNA recombination • chromosome segregation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • double-strand break repair • клітинний цикл • protein localization to chromatin • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0097285 апоптоз • sister chromatid cohesion • positive regulation of sister chromatid cohesion • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • negative regulation of mitotic metaphase/anaphase transition • GO:0007126 мейоз • multicellular organism development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5885


19357

Ensembl


ENSG00000164754


ENSMUSG00000022314

UniProt


O60216


Q61550

RefSeq (мРНК)


NM_006265


NM_009009

RefSeq (білок)


NP_006256


NP_033035

Локус (UCSC)

Хр. 8: 116.85 – 116.87 Mb

Хр. 15: 51.83 – 51.86 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAD21 (англ. RAD21 cohesin complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 631 амінокислот, а молекулярна маса — 71 690^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFYAHFVLSK	RGPLAKIWLA	AHWDKKLTKA	HVFECNLESS	VESIISPKVK
MALRTSGHLL	LGVVRIYHRK	AKYLLADCNE	AFIKIKMAFR	PGVVDLPEEN
REAAYNAITL	PEEFHDFDQP	LPDLDDIDVA	QQFSLNQSRV	EEITMREEVG
NISILQENDF	GDFGMDDREI	MREGSAFEDD	DMLVSTTTSN	LLLESEQSTS
NLNEKINHLE	YEDQYKDDNF	GEGNDGGILD	DKLISNNDGG	IFDDPPALSE
AGVMLPEQPA	HDDMDEDDNV	SMGGPDSPDS	VDPVEPMPTM	TDQTTLVPNE
EEAFALEPID	ITVKETKAKR	KRKLIVDSVK	ELDSKTIRAQ	LSDYSDIVTT
LDLAPPTKKL	MMWKETGGVE	KLFSLPAQPL	WNNRLLKLFT	RCLTPLVPED
LRKRRKGGEA	DNLDEFLKEF	ENPEVPREDQ	QQQHQQRDVI	DEPIIEEPSR
LQESVMEASR	TNIDESAMPP	PPPQGVKRKA	GQIDPEPVMP	PQQVEQMEIP
PVELPPEEPP	NICQLIPELE	LLPEKEKEKE	KEKEDDEEEE	DEDASGGDQD
QEERRWNKRT	QQMLHGLQRA	LAKTGAESIS	LLELCRNTNR	KQAAAKFYSF
LVLKKQQAIE	LTQEEPYSDI	IATPGPRFHI	I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, розходження хромосом. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

Sadano H., Sugimoto H., Sakai F., Nomura N., Osumi T. (2000). NXP-1, a human protein related to Rad21/Scc1/Mcd1, is a component of the nuclear matrix. Biochem. Biophys. Res. Commun. 267: 418—422. PMID 10623634 DOI:10.1006/bbrc.1999.1969
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pati D., Zhang N., Plon S.E. (2002). Linking sister chromatid cohesion and apoptosis: role of rad21. Mol. Cell. Biol. 22: 8267—8277. PMID 12417729 DOI:10.1128/MCB.22.23.8267-8277.2002
Hoque M.T., Ishikawa F. (2001). Human chromatid cohesin component hRad21 is phosphorylated in M phase and associated with metaphase centromeres. J. Biol. Chem. 276: 5059—5067. PMID 11073952 DOI:10.1074/jbc.M007809200
Hauf S., Waizenegger I.C., Peters J.-M. (2001). Cohesin cleavage by separase required for anaphase and cytokinesis in human cells. Science. 293: 1320—1323. PMID 11509732 DOI:10.1126/science.1061376
Rankin S., Ayad N.G., Kirschner M.W. (2005). Sororin, a substrate of the anaphase-promoting complex, is required for sister chromatid cohesion in vertebrates. Mol. Cell. 18: 185—200. PMID 15837422 DOI:10.1016/j.molcel.2005.03.017

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAD21 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9811 (англ.) . Архів оригіналу за 30 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O60216 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.