RBBP5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3P4F, 4X8N, 4X8P, 5F6K, 5F6L

Ідентифікатори

Символи

RBBP5, RBQ3, SWD1, retinoblastoma binding protein 5, RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit

Зовнішні ІД

OMIM: 600697 MGI: 1918367 HomoloGene: 3709 GeneCards: RBBP5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) • histone-lysine N-methyltransferase activity
Клітинна компонента	• MLL1 complex • ядерце • MLL3/4 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • histone methyltransferase complex • Set1C/COMPASS complex
Біологічний процес	• response to estrogen • histone H3-K4 methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • beta-catenin-TCF complex assembly • посттрансляційна модифікація • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5929


213464

Ensembl


ENSG00000117222


ENSMUSG00000026439

UniProt


Q15291


Q8BX09

RefSeq (мРНК)


NM_001193272 NM_001193273 NM_005057


NM_172517 NM_001357486 NM_001357487

RefSeq (білок)


NP_001180201 NP_001180202 NP_005048


NP_766105 NP_001344415 NP_001344416

Локус (UCSC)

Хр. 1: 205.09 – 205.12 Mb

Хр. 1: 132.41 – 132.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBBP5 (англ. RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 538 амінокислот, а молекулярна маса — 59 153^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNLELLESFG	QNYPEEADGT	LDCISMALTC	TFNRWGTLLA	VGCNDGRIVI
WDFLTRGIAK	IISAHIHPVC	SLCWSRDGHK	LVSASTDNIV	SQWDVLSGDC
DQRFRFPSPI	LKVQYHPRDQ	NKVLVCPMKS	APVMLTLSDS	KHVVLPVDDD
SDLNVVASFD	RRGEYIYTGN	AKGKILVLKT	DSQDLVASFR	VTTGTSNTTA
IKSIEFARKG	SCFLINTADR	IIRVYDGREI	LTCGRDGEPE	PMQKLQDLVN
RTPWKKCCFS	GDGEYIVAGS	ARQHALYIWE	KSIGNLVKIL	HGTRGELLLD
VAWHPVRPII	ASISSGVVSI	WAQNQVENWS	AFAPDFKELD	ENVEYEERES
EFDIEDEDKS	EPEQTGADAA	EDEEVDVTSV	DPIAAFCSSD	EELEDSKALL
YLPIAPEVED	PEENPYGPPP	DAVQTSLMDE	GASSEKKRQS	SADGSQPPKK
KPKTTNIELQ	GVPNDEVHPL	LGVKGDGKSK	KKQAGRPKGS	KGKEKDSPFK
PKLYKGDRGL	PLEGSAKGKV	QAELSQPLTA	GGAISELL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee J.-H., Skalnik D.G. (2005). CpG-binding protein (CXXC finger protein 1) is a component of the mammalian Set1 histone H3-Lys4 methyltransferase complex, the analogue of the yeast Set1/COMPASS complex. J. Biol. Chem. 280: 41725—41731. PMID 16253997 DOI:10.1074/jbc.M508312200
Lee J.-H., Tate C.M., You J.-S., Skalnik D.G. (2007). Identification and characterization of the human Set1B histone H3-Lys4 methyltransferase complex. J. Biol. Chem. 282: 13419—13428. PMID 17355966 DOI:10.1074/jbc.M609809200
Lee J.H., Skalnik D.G. (2008). Wdr82 is a C-terminal domain-binding protein that recruits the Setd1A Histone H3-Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes. Mol. Cell. Biol. 28: 609—618. PMID 17998332 DOI:10.1128/MCB.01356-07
Patel A., Dharmarajan V., Vought V.E., Cosgrove M.S. (2009). On the mechanism of multiple lysine methylation by the human mixed lineage leukemia protein-1 (MLL1) core complex. J. Biol. Chem. 284: 24242—24256. PMID 19556245 DOI:10.1074/jbc.M109.014498

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9888 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15291 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.