RBM25

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3V53

Ідентифікатори

Символи

RBM25, NET52, RED120, RNPC7, S164, Snu71, fSAP94, RNA binding motif protein 25

Зовнішні ІД

OMIM: 612427 MGI: 1914289 HomoloGene: 136439 GeneCards: RBM25

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • spliceosomal complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


58517


67039

Ensembl


ENSG00000119707


ENSMUSG00000010608

UniProt


P49756


B2RY56

RefSeq (мРНК)


NM_021239


NM_027349 NM_001364415 NM_001364416

RefSeq (білок)


NP_067062


NP_081625 NP_001351344 NP_001351345

Локус (UCSC)

Хр. 14: 73.06 – 73.12 Mb

Хр. 12: 83.63 – 83.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBM25 (англ. RNA binding motif protein 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 843 амінокислот, а молекулярна маса — 100 185^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSFPPHLNRP	PMGIPALPPG	IPPPQFPGFP	PPVPPGTPMI	PVPMSIMAPA
PTVLVPTVSM	VGKHLGARKD	HPGLKAKEND	ENCGPTTTVF	VGNISEKASD
MLIRQLLAKC	GLVLSWKRVQ	GASGKLQAFG	FCEYKEPEST	LRALRLLHDL
QIGEKKLLVK	VDAKTKAQLD	EWKAKKKASN	GNARPETVTN	DDEEALDEET
KRRDQMIKGA	IEVLIREYSS	ELNAPSQESD	SHPRKKKKEK	KEDIFRRFPV
APLIPYPLIT	KEDINAIEME	EDKRDLISRE	ISKFRDTHKK	LEEEKGKKEK
ERQEIEKERR	ERERERERER	ERRERERERE	REREREKEKE	RERERERDRD
RDRTKERDRD	RDRERDRDRD	RERSSDRNKD	RSRSREKSRD	RERERERERE
RERERERERE	RERERERERE	REREREKDKK	RDREEDEEDA	YERRKLERKL
REKEAAYQER	LKNWEIRERK	KTREYEKEAE	REEERRREMA	KEAKRLKEFL
EDYDDDRDDP	KYYRGSALQK	RLRDREKEME	ADERDRKREK	EELEEIRQRL
LAEGHPDPDA	ELQRMEQEAE	RRRQPQIKQE	PESEEEEEEK	QEKEEKREEP
MEEEEEPEQK	PCLKPTLRPI	SSAPSVSSAS	GNATPNTPGD	ESPCGIIIPH
ENSPDQQQPE	EHRPKIGLSL	KLGASNSPGQ	PNSVKRKKLP	VDSVFNKFED
EDSDDVPRKR	KLVPLDYGED	DKNATKGTVN	TEEKRKHIKS	LIEKIPTAKP
ELFAYPLDWS	IVDSILMERR	IRPWINKKII	EYIGEEEATL	VDFVCSKVMA
HSSPQSILDD	VAMVLDEEAE	VFIVKMWRLL	IYETEAKKIG	LVK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Zhou A., Ou A.C., Cho A., Benz E.J. Jr., Huang S.C. (2008). Novel splicing factor RBM25 modulates Bcl-x pre-mRNA 5' splice site selection. Mol. Cell. Biol. 28: 5924—5936. PMID 18663000 DOI:10.1128/MCB.00560-08

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23244 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P49756 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.