RBM6

Ідентифікатори

Символи

RBM6, 3G2, DEF-3, DEF3, HLC-11, NY-LU-12, g16, RNA binding motif protein 6

Зовнішні ІД

OMIM: 606886 MGI: 1338037 HomoloGene: 31336 GeneCards: RBM6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10180


19654

Ensembl


ENSG00000004534


ENSMUSG00000032582

UniProt


P78332


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001167582 NM_005777 NM_001349190 NM_001349191 NM_001349192
NM_001349193 NM_001349194


NM_011251 NM_029169

RefSeq (білок)

NP_001161054 NP_005768 NP_001336119 NP_001336120 NP_001336121
NP_001336122 NP_001336123


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 3: 49.94 – 50.1 Mb

Хр. 9: 107.65 – 107.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBM6 (англ. RNA binding motif protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 123 амінокислот, а молекулярна маса — 128 644^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWGDSRPANR	TGPFRGSQEE	RFAPGWNRDY	PPPPLKSHAQ	ERHSGNFPGR
DSLPFDFQGH	SGPPFANVEE	HSFSYGARDG	PHGDYRGGEG	PGHDFRGGDF
SSSDFQSRDS	SQLDFRGRDI	HSGDFRDREG	PPMDYRGGDG	TSMDYRGREA
PHMNYRDRDA	HAVDFRGRDA	PPSDFRGRGT	YDLDFRGRDG	SHADFRGRDL
SDLDFRAREQ	SRSDFRNRDV	SDLDFRDKDG	TQVDFRGRGS	GTTDLDFRDR
DTPHSDFRGR	HRSRTDQDFR	GREMGSCMEF	KDREMPPVDP	NILDYIQPST
QDREHSGMNV	NRREESTHDH	TIERPAFGIQ	KGEFEHSETR	EGETQGVAFE
HESPADFQNS	QSPVQDQDKS	QLSGREEQSS	DAGLFKEEGG	LDFLGRQDTD
YRSMEYRDVD	HRLPGSQMFG	YGQSKSFPEG	KTARDAQRDL	QDQDYRTGPS
EEKPSRLIRL	SGVPEDATKE	EILNAFRTPD	GMPVKNLQLK	EYNTGYDYGY
VCVEFSLLED	AIGCMEANQG	TLMIQDKEVT	LEYVSSLDFW	YCKRCKANIG
GHRSSCSFCK	NPREVTEAKQ	ELITYPQPQK	TSIPAPLEKQ	PNQPLRPADK
EPEPRKREEG	QESRLGHQKR	EAERYLPPSR	REGPTFRRDR	ERESWSGETR
QDGESKTIML	KRIYRSTPPE	VIVEVLEPYV	RLTTANVRII	KNRTGPMGHT
YGFIDLDSHA	EALRVVKILQ	NLDPPFSIDG	KMVAVNLATG	KRRNDSGDHS
DHMHYYQGKK	YFRDRRGGGR	NSDWSSDTNR	QGQQSSSDCY	IYDSATGYYY
DPLAGTYYDP	NTQQEVYVPQ	DPGLPEEEEI	KEKKPTSQGK	SSSKKEMSKR
DGKEKKDRGV	TRFQENASEG	KAPAEDVFKK	PLPPTVKKEE	SPPPPKVVNP
LIGLLGEYGG	DSDYEEEEEE	EQTPPPQPRT	AQPQKREEQT	KKENEEDKLT
DWNKLACLLC	RRQFPNKEVL	IKHQQLSDLH	KQNLEIHRKI	KQSEQELAYL
ERREREGKFK	GRGNDRREKL	QSFDSPERKR	IKYSRETDSD	RKLVDKEDID
TSSKGGCVQQ	ATGWRKGTGL	GYGHPGLASS	EEAEGRMRGP	SVGASGRTSK
RQSNETYRDA	VRRVMFARYK	ELD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mishra M., Akatsu H., Heese K. (2011). The novel protein MANI modulates neurogenesis and neurite-cone growth. J. Cell. Mol. Med. 15: 1713—1725. PMID 20716133 DOI:10.1111/j.1582-4934.2010.01134.x
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Lerman M.I., Minna J.D. (2000). The 630-kb lung cancer homozygous deletion region on human chromosome 3p21.3: identification and evaluation of the resident candidate tumor suppressor genes. Cancer Res. 60: 6116—6133. PMID 11085536

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9903 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P78332 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.