RBSN

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YZM, 1Z0J, 1Z0K

Ідентифікатори

Символи

RBSN, Rabenosyn-5, ZFYVE20, rabenosyn, RAB effector

Зовнішні ІД

OMIM: 609511 MGI: 1925537 HomoloGene: 41477 GeneCards: RBSN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• ендосома • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • cytoplasmic side of endosome membrane • клітинна мембрана • endosome membrane • екзосома • гіалоплазма
Біологічний процес	• endosomal vesicle fusion • ендоцитоз • vacuole inheritance • Golgi to endosome transport • зсідання крові • endosomal transport • protein transport • regulation of Golgi organization • Golgi to lysosome transport • early endosome to Golgi transport • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64145


78287

Ensembl


ENSG00000131381


ENSMUSG00000014550

UniProt


Q9H1K0


Q80Y56

RefSeq (мРНК)


NM_001302378 NM_022340


NM_030081

RefSeq (білок)


NP_001289307 NP_071735


NP_084357

Локус (UCSC)

Хр. 3: 15.07 – 15.1 Mb

Хр. 6: 92.16 – 92.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBSN (англ. Rabenosyn, RAB effector) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 88 870^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLDDPGEV	REGFLCPLCL	KDLQSFYQLH	SHYEEEHSGE	DRDVKGQIKS
LVQKAKKAKD	RLLKREGDDR	AESGTQGYES	FSYGGVDPYM	WEPQELGAVR
SHLSDFKKHR	AARIDHYVVE	VNKLIIRLEK	LTAFDRTNTE	SAKIRAIEKS
VVPWVNDQDV	PFCPDCGNKF	SIRNRRHHCR	LCGSIMCKKC	MELISLPLAN
KLTSASKESL	STHTSPSQSP	NSVHGSRRGS	ISSMSSVSSV	LDEKDDDRIR
CCTHCKDTLL	KREQQIDEKE	HTPDIVKLYE	KLRLCMEKVD	QKAPEYIRMA
ASLNAGETTY	SLEHASDLRV	EVQKVYELID	ALSKKILTLG	LNQDPPPHPS
NLRLQRMIRY	SATLFVQEKL	LGLMSLPTKE	QFEELKKKRK	EEMERKRAVE
RQAALESQRR	LEERQSGLAS	RAANGEVASL	RRGPAPLRKA	EGWLPLSGGQ
GQSEDSDPLL	QQIHNITSFI	RQAKAAGRMD	EVRTLQENLR	QLQDEYDQQQ
TEKAIELSRR	QAEEEDLQRE	QLQMLREREL	EREREQFRVA	SLHTRTRSLD
FREIGPFQLE	PSREPRTHLA	YALDLGSSPV	PSSTAPKTPS	LSSTQPTRVW
SGPPAVGQER	LPQSSMPQQH	EGPSLNPFDE	EDLSSPMEEA	TTGPPAAGVS
LDPSARILKE	YNPFEEEDEE	EEAVAGNPFI	QPDSPAPNPF	SEEDEHPQQR
LSSPLVPGNP	FEEPTCINPF	EMDSDSGPEA	EEPIEEELLL	QQIDNIKAYI
FDAKQCGRLD	EVEVLTENLR	ELKHTLAKQK	GGTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
de Renzis S., Soennichsen B., Zerial M. (2002). Divalent Rab effectors regulate the sub-compartmental organization and sorting of early endosomes. Nat. Cell Biol. 4: 124—133. PMID 11788822 DOI:10.1038/ncb744
Naslavsky N., Boehm M., Backlund P.S. Jr., Caplan S. (2004). Rabenosyn-5 and EHD1 interact and sequentially regulate protein recycling to the plasma membrane. Mol. Biol. Cell. 15: 2410—2422. PMID 15020713 DOI:10.1091/mbc.E03-10-0733
Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20759 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H1K0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.